Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04049
• Subject: NM_175123.4
• Aligned Length: 993
• Identities: 725
• Gaps: 171

Alignment

Query   1  ATGCTGAGTCCGGAGCGCCTAGCCCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGCGACATGTCCTCACCTACATGGA  74
           |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct   1  ATGCTGAGTCCCGAGCGCCTAGCTCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGAGACATGTCCTCACGTACATGGA  74

Query  75  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTAGAAAACAGGGAAGATATTAGCCAATATGGAATTGCCAGGTTCTTCACTGAAT  148
           |||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  75  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTGGAGAACAGGGAGGATATTAGCCAGTATGGCATTGCCCGGTTCTTCACTGACT  148

Query 149  ATTTTAACAGTGTATGCCAGGGAACACACATTCTCTTTCGAGAATTCAGCTTCGTCCAAGCCACCCCCCACAAT  222
           ||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||.||.||.|||
Sbjct 149  ATTTTAACAGCGTATGCCAAGGAACTCACATTCTCTTCCGGGAATTCAGCTTTATACAAGCCACACCTCATAAT  222

Query 223  AGGGTATCATTTTTACGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTGGGCAAAAATGGCGATTTGCTGACCATGAA  296
           ||.|.||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..||||||||||||.
Sbjct 223  AGAGCATCATTCCTTCGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTAGGGAAAAATGGTGACCTGCTGACCATGAG  296

Query 297  AGAATATCACTGTTTGCTGCAATTACTGTGTCCTGATTTCCCGCTGGAGCTCACTCAGAAAGCAGCCAGGATTG  370
           .||.||.||||||.|||||||.|||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 297  GGAGTACCACTGTCTGCTGCAGTTATTGTGCCCAGACTTCCCGCTGGAGCTTACTCAGAAAGCCGCCAGGATTG  370

Query 371  TGCTCATGGACGATGCCATGGACTGCTTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTCTTTGCCTTCCAGATCCAGTTTTAC  444
           ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 371  TGCTCATGGATGATGCCATGGACTGCCTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTTTTCGCCTTCCAGATCCAGTTTTAT  444

Query 445  TACTCAGAATTCCTGGACAGTGTGGCTGCCATCTATGAGGACCTGCTGTCAGGCAAGAACCCCAACACAGTGAT  518
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 445  TACTCAGAATTCCTGGAGAGTGTGGCTGCCATCTATCAGGACTTGCTATCTGGGAAAAACCCCAATACAGTGAT  518

Query 519  TGTGCCGACGTCGTCCAGTGGGCAGCACCGCCAACGACCTGCCTTGGGCGGGGCCGGCACGCTGGAGGGCGTGG  592
           |||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|..|||||.|.||||||.||.||||
Sbjct 519  TGTCCCAACATCATCCAGTGGGCAACACCGCCAACGACCTGCCTTGGGTGATGCCGGTATGCTGGATGGAGTGG  592

Query 593  AGGCGTCGCTGTTCTACCAGTGTCTGGAAAACCTGTGTGATCGGCACAAGTACAGCTGCCCACCCCCAGCACTT  666
           |.||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 593  AAGCATCACTGTTCTATCAGCGCCTGGAAAACCTGTGTGACCGGCACAAGTACAGCTGTCCACCACCAGCGCTT  666

Query 667  GTCAAAGAGGCCCTCAGCAATGTTCAGAGACTGACCTTCTATGGATTCCTCATGGCTCTCTCAAAGCACCGTGG  740
           |||||||||..|||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||.|.|||
Sbjct 667  GTCAAAGAGATCCTGAGCAATGTCCAGAGGCTGACTTTCTATGGATTCCTTGTGGCCCTCTCAAAGCATCATGG  740

Query 741  AATCAACCAAGCCCTCGGAGCTTTGCCTGACAAGGGGGATCTGATGCACGACCCAGCAATGGATGAAGAGCTGG  814
           .||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741  GATCAACCAAGCCCTGGGAGCTTTGCCAGACAAAGGAGACCTGATGCACGACCCAGCCATGGATGAAGAGCTGG  814

Query 815  AACGGCTG------------------------------------------------------------------  822
           ||||||||                                                                  
Sbjct 815  AACGGCTGCTGGTCCAGGTCCCAGGCCTGGTCAACTCCATCACTGCCACTTCTGAGGCCAGCTGCCTGCCTTCC  888

Query 823  --------------------------------------------------------------------------  822
                                                                                     
Sbjct 889  CGAACCCCTCCCCGGGTTGGTTCCCCGTGGAAACCCCTCCATCGCTCCCGCAAATTGGATGCAGAGAGCGATGG  962

Query 823  -------------------------------  822
                                          
Sbjct 963  CTCCACTGAAGAGACAGATGAGTCTGAGACT  993