Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04049
• Subject: XM_011239456.2
• Aligned Length: 993
• Identities: 660
• Gaps: 240

Alignment

Query   1  ATGCTGAGTCCGGAGCGCCTAGCCCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGCGACATGTCCTCACCTACATGGA  74
                                                                                |||||
Sbjct   1  ---------------------------------------------------------------------ATGGA  5

Query  75  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTAGAAAACAGGGAAGATATTAGCCAATATGGAATTGCCAGGTTCTTCACTGAAT  148
           |||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|
Sbjct   6  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTGGAGAACAGGGAGGATATTAGCCAGTATGGCATTGCCCGGTTCTTCACTGACT  79

Query 149  ATTTTAACAGTGTATGCCAGGGAACACACATTCTCTTTCGAGAATTCAGCTTCGTCCAAGCCACCCCCCACAAT  222
           ||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||.||.||.|||
Sbjct  80  ATTTTAACAGCGTATGCCAAGGAACTCACATTCTCTTCCGGGAATTCAGCTTTATACAAGCCACACCTCATAAT  153

Query 223  AGGGTATCATTTTTACGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTGGGCAAAAATGGCGATTTGCTGACCATGAA  296
           ||.|.||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..||||||||||||.
Sbjct 154  AGAGCATCATTCCTTCGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTAGGGAAAAATGGTGACCTGCTGACCATGAG  227

Query 297  AGAATATCACTGTTTGCTGCAATTACTGTGTCCTGATTTCCCGCTGGAGCTCACTCAGAAAGCAGCCAGGATTG  370
           .||.||.||||||.|||||||.|||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 228  GGAGTACCACTGTCTGCTGCAGTTATTGTGCCCAGACTTCCCGCTGGAGCTTACTCAGAAAGCCGCCAGGATTG  301

Query 371  TGCTCATGGACGATGCCATGGACTGCTTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTCTTTGCCTTCCAGATCCAGTTTTAC  444
           ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 302  TGCTCATGGATGATGCCATGGACTGCCTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTTTTCGCCTTCCAGATCCAGTTTTAT  375

Query 445  TACTCAGAATTCCTGGACAGTGTGGCTGCCATCTATGAGGACCTGCTGTCAGGCAAGAACCCCAACACAGTGAT  518
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 376  TACTCAGAATTCCTGGAGAGTGTGGCTGCCATCTATCAGGACTTGCTATCTGGGAAAAACCCCAATACAGTGAT  449

Query 519  TGTGCCGACGTCGTCCAGTGGGCAGCACCGCCAACGACCTGCCTTGGGCGGGGCCGGCACGCTGGAGGGCGTGG  592
           |||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|..|||||.|.||||||.||.||||
Sbjct 450  TGTCCCAACATCATCCAGTGGGCAACACCGCCAACGACCTGCCTTGGGTGATGCCGGTATGCTGGATGGAGTGG  523

Query 593  AGGCGTCGCTGTTCTACCAGTGTCTGGAAAACCTGTGTGATCGGCACAAGTACAGCTGCCCACCCCCAGCACTT  666
           |.||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 524  AAGCATCACTGTTCTATCAGCGCCTGGAAAACCTGTGTGACCGGCACAAGTACAGCTGTCCACCACCAGCGCTT  597

Query 667  GTCAAAGAGGCCCTCAGCAATGTTCAGAGACTGACCTTCTATGGATTCCTCATGGCTCTCTCAAAGCACCGTGG  740
           |||||||||..|||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||.|.|||
Sbjct 598  GTCAAAGAGATCCTGAGCAATGTCCAGAGGCTGACTTTCTATGGATTCCTTGTGGCCCTCTCAAAGCATCATGG  671

Query 741  AATCAACCAAGCCCTCGGAGCTTTGCCTGACAAGGGGGATCTGATGCACGACCCAGCAATGGATGAAGAGCTGG  814
           .||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 672  GATCAACCAAGCCCTGGGAGCTTTGCCAGACAAAGGAGACCTGATGCACGACCCAGCCATGGATGAAGAGCTGG  745

Query 815  AACGGCTG------------------------------------------------------------------  822
           ||||||||                                                                  
Sbjct 746  AACGGCTGCTGGTCCAGGTCCCAGGCCTGGTCAACTCCATCACTGCCACTTCTGAGGCCAGCTGCCTGCCTTCC  819

Query 823  --------------------------------------------------------------------------  822
                                                                                     
Sbjct 820  CGAACCCCTCCCCGGGTTGGTTCCCCGTGGAAACCCCTCCATCGCTCCCGCAAATTGGATGCAGAGAGCGATGG  893

Query 823  -------------------------------  822
                                          
Sbjct 894  CTCCACTGAAGAGACAGATGAGTCTGAGACT  924