Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04142
• Subject: NM_001321238.1
• Aligned Length: 1218
• Identities: 933
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGTCTGTGGAGCGCCTGCAGCAGCGGGTCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTTGCCCAGGAGAGGAGTCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCAGGTCCCGAGGAGCGGCGACGGAGGGGGCGGCCGGGTCCGCATCGAGAAGATGAGCTCAGAGGTGGTGGATT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGAATCCCTACAGCCGCTTGATGGCATTGAAACGAATGGGAATTGTAAGCGACTATGAGAAAATCCGTACCTTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCGTAGCAATAGTAGGTGTTGGTGGAGTAGGTAGTGTGACTGCTGAAATGCTGACAAGATGTGGCAT------  290
                                                       .|||.||     ||| ||     ||      
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGAGAT-----CAA-AT-----ATTAAACC  20

Query  291  TGGTAAGTTGCTACTCTTTGATTATGACAAGGTGGAACTAGCCAATATGAATAGACTTTTCTTCCAACCTCATC  364
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   21  TGCTAAGTTGCTACTCTTTGATTATGACAAGGTGGAACTAGCCAATATGAATAGACTTTTCTTCCAACCTCATC  94

Query  365  AAGCAGGATTAAGTAAAGTTCAAGCAGCAGAACATACTCTGAGGAACATTAATCCTGATGTTCTTTTTGAAGTA  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   95  AAGCAGGATTAAGTAAAGTTCAAGCAGCAGAACATACTCTGAGGAACATTAATCCTGATGTTCTTTTTGAAGTA  168

Query  439  CACAACTATAATATAACCACAGTGGAAAACTTTCAACATTTCATGGATAGAATAAGTAATGGTGGGTTAGAAGA  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  169  CACAACTATAATATAACCACAGTGGAAAACTTTCAACATTTCATGGATAGAATAAGTAATGGTGGGTTAGAAGA  242

Query  513  AGGAAAACCTGTTGATCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAATTTTGAAGCTCGAATGACAATAAATACAGCTTGTA  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243  AGGAAAACCTGTTGATCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAATTTTGAAGCTCGAATGACAATAAATACAGCTTGTA  316

Query  587  ATGAACTTGGACAAACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCAGGGCATATACAGCTTATAATT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  317  ATGAACTTGGACAAACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCAGGGCATATACAGCTTATAATT  390

Query  661  CCTGGAGAATCTGCTTGTTTTGCGTGTGCTCCACCACTTGTAGTTGCTGCAAATATTGATGAAAAGACTCTGAA  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391  CCTGGAGAATCTGCTTGTTTTGCGTGTGCTCCACCACTTGTAGTTGCTGCAAATATTGATGAAAAGACTCTGAA  464

Query  735  ACGAGAAGGTGTTTGTGCAGCCAGTCTTCCTACCACTATGGGTGTGGTTGCTGGGATCTTAGTACAAAACGTGT  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  ACGAGAAGGTGTTTGTGCAGCCAGTCTTCCTACCACTATGGGTGTGGTTGCTGGGATCTTAGTACAAAACGTGT  538

Query  809  TAAAGTTTCTGTTAAATTTTGGTACTGTTAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTTCCTACT  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  TAAAGTTTCTGTTAAATTTTGGTACTGTTAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTTCCTACT  612

Query  883  ATGTCCATGAAGCCAAATCCTCAGTGTGATGACAGAAATTGCAGGAAGCAGCAGGAGGAATATAAGAAAAAGGT  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  613  ATGTCCATGAAGCCAAATCCTCAGTGTGATGACAGAAATTGCAGGAAGCAGCAGGAGGAATATAAGAAAAAGGT  686

Query  957  AGCAGCACTGCCTAAACAAGAGGTTATACAAGAAGAGGAAGAGATAATCCATGAAGATAATGAATGGGGTATTG  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  687  AGCAGCACTGCCTAAACAAGAGGTTATACAAGAAGAGGAAGAGATAATCCATGAAGATAATGAATGGGGTATTG  760

Query 1031  AGCTGGTATCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAAAATTTTTCAGGTCCAGTTCCAGACTTACCTGAAGGAATT  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  761  AGCTGGTATCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAAAATTTTTCAGGTCCAGTTCCAGACTTACCTGAAGGAATT  834

Query 1105  ACAGTGGCATACACAATTCCAAAAAAGCAAGAAGATTCTGTCACTGAGTTAACAGTGGAAGATTCTGGTGAAAG  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  ACAGTGGCATACACAATTCCAAAAAAGCAAGAAGATTCTGTCACTGAGTTAACAGTGGAAGATTCTGGTGAAAG  908

Query 1179  CTTGGAAGACCTCATGGCCAAAATGAAGAATATG  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  CTTGGAAGACCTCATGGCCAAAATGAAGAATATG  942