Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04142
• Subject: NM_025692.3
• Aligned Length: 1217
• Identities: 1038
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGTCTGTGGAGCGCCTGCAGCAGCGGGTCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTTGCCCAGGAGAGGAGTCT  74
            |||||.||.||.||||||||.||||..||||||||..||||||||||||.||||||.||||.||||||.|..|.
Sbjct    1  ATGGCCGACTCGGTGGAGCGGCTGCGACAGCGGGTTGAGGAGCTGGAGCAGGAACTCGCCCGGGAGAGAACCCG  74

Query   75  GCAGGTCCCGAGGAG-CGGCGACGGAGGGGGCGGCCGGGTCCGCATCGAGAAGATGAGCTCAGAGGTGGTGGAT  147
            || |.||..||||.| ||||.||      .||||||||..|||||||.||.||||||||...||||||.|||||
Sbjct   75  GC-GCTCTGGAGGGGACGGCCAC------TGCGGCCGGACCCGCATCCAGGAGATGAGCGACGAGGTGTTGGAT  141

Query  148  TCGAATCCCTACAGCCGCTTGATGGCATTGAAACGAATGGGAATTGTAAGCGACTATGAGAAAATCCGTACCTT  221
            ||.||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||.
Sbjct  142  TCCAATCCCTACAGCCGTCTGATGGCATTGAAACGGATGGGAATTGTCAGTGACTATAAGAAAATCCGTACCTA  215

Query  222  TGCCGTAGCAATAGTAGGTGTTGGTGGAGTAGGTAGTGTGACTGCTGAAATGCTGACAAGATGTGGCATTGGTA  295
            .||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  CGCTGTAGCAATAGTAGGTGTTGGTGGAGTTGGTAGTGTGACTGCTGAAATGCTGACAAGATGTGGCATTGGTA  289

Query  296  AGTTGCTACTCTTTGATTATGACAAGGTGGAACTAGCCAATATGAATAGACTTTTCTTCCAACCTCATCAAGCA  369
            ||.||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||.|.|||||||||||.||..||||||||
Sbjct  290  AGCTGCTGCTCTTTGACTATGATAAGGTGGAGCTGGCCAACATGAATCGGCTTTTCTTCCAGCCATATCAAGCA  363

Query  370  GGATTAAGTAAAGTTCAAGCAGCAGAACATACTCTGAGGAACATTAATCCTGATGTTCTTTTTGAAGTACACAA  443
            |||.|.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  364  GGACTGAGTAAGGTCCACGCAGCAGAACACACCCTGAGGAACATTAACCCTGATGTTCTGTTTGAAGTCCACAA  437

Query  444  CTATAATATAACCACAGTGGAAAACTTTCAACATTTCATGGATAGAATAAGTAATGGTGGGTTAGAAGAAGGAA  517
            |||.|||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct  438  CTACAATATCACCACAGTGGAACACTTTGAACATTTCATGAATAGAATAAGTAATGGTGGATTAGAAGAAGGAC  511

Query  518  AACCTGTTGATCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAATTTTGAAGCTCGAATGACAATAAATACAGCTTGTAATGAA  591
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  AACCTGTTGACCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAACTTTGAAGCTCGAATGGCAATAAATACAGCTTGTAATGAA  585

Query  592  CTTGGACAAACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCAGGGCATATACAGCTTATAATTCCTGG  665
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  586  CTTGGTCAGACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCCGGGCACATCCAGCTGATGATCCCTGG  659

Query  666  AGAATCTGCTTGTTTTGCGTGTGCTCCACCACTTGTAGTTGCTGCAAATATTGATGAAAAGACTCTGAAACGAG  739
            |||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  660  AGAGTCGGCTTGCTTCGCGTGTGCGCCACCACTTGTAGTTGCTTCAAATATTGATGAAAAAACCCTGAAACGAG  733

Query  740  AAGGTGTTTGTGCAGCCAGTCTTCCTACCACTATGGGTGTGGTTGCTGGGATCTTAGTACAAAACGTGTTAAAG  813
            ||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||..|||||
Sbjct  734  AAGGCGTCTGCGCAGCCAGTCTCCCCACCACCATGGGGGTGGTGGCCGGGATCTTGGTACAAAATGTACTAAAG  807

Query  814  TTTCTGTTAAATTTTGGTACTGTTAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTTCCTACTATGTC  887
            |||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.
Sbjct  808  TTTCTGTTAAAATTTGGCACTGTCAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTCCCTACCATGTT  881

Query  888  CATGAAGCCAAATCCTCAGTGTGATGACAGAAATTGCAGGAAGCAGCAGGAGGAATATAAGAAAAAGGTAGCAG  961
            ||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.|.||.|||||
Sbjct  882  CATGAAGCCAAACCCTCAGTGTGATGACAAAAACTGTAGAAAGCAACAAGAAGAATACAAGAAGAGGGCAGCAG  955

Query  962  CACTGCCTAAACAAGAGGTTATA----CAAGAAGAGGAAGAGATAATCCATGAAGATAATGAATGGGGTATTGA  1031
            |||||||.|..||.||||.| .|    ||.||.||||.||||.|..|.|||||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  956  CACTGCCCACGCAGGAGGCT-GAGCCCCAGGAGGAGGCAGAGGTGGTTCATGAGGACAACGAGTGGGGCATTGA  1028

Query 1032  GCTGGTATCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAAAATTTTTCAGGTCCAGTTCCAGACTTACCTGAAGGAATTA  1105
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||||||||.|||||...||||||||||||.||||
Sbjct 1029  GCTGGTGTCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAGAACTCTTCAGGTCCTGTTCCCACCTTACCTGAAGGCATTA  1102

Query 1106  CAGTGGCATACACAATTCCAAAAAAGCAAGAAGATTCTGTCACTGAGTTAACAGTGGAAGATTCTGGTGAAAGC  1179
            ||||||||||||||.|.|||||.|||...||.|||||.|...||||..|||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1103  CAGTGGCATACACAGTCCCAAAGAAGACGGAGGATTCGGCTTCTGAAGTAACAGTGGAAGACTCCGGCGAAAGC  1176

Query 1180  TTGGAAGACCTCATGGCCAAAATGAAGAATATG  1212
            ||||||||.||.|||||||..||||||||||||
Sbjct 1177  TTGGAAGATCTTATGGCCAGGATGAAGAATATG  1209