Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04146
• Subject: NM_144919.2
• Aligned Length: 1046
• Identities: 911
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGCTACACACAACCCAGCTGTACCAGCATGTGCCAGAGACACGCTGGCCAATCGTGTACTCGCCGCGCTACAA  74
            ||||..|||.||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||.||.||.|||||
Sbjct    1  ATGCCTCACGCAACACAGCTGTACCAGCATGTACCAGAGAAACGCTGGCCCATCGTGTACTCACCACGTTACAA  74

Query   75  CATCACCTTCATGGGCCTGGAGAAGCTGCATCCCTTTGATGCCGGAAAATGGGGCAAAGTGATCAATTTCCTAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct   75  CATCACCTTCATGGGCCTGGAGAAGCTGCACCCCTTTGATGCTGGGAAATGGGGCAAGGTGATCAACTTCCTGA  148

Query  149  AAGAAGAGAAGCTTCTGTCTGACAGCATGCTGGTGGAGGCGCGGGAGGCCTCGGAGGAGGACCTGCTGGTGGTG  222
            |||||||||||||.|||||.||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAAGAGAAGCTGCTGTCCGATGGCATGCTGGTGGAGGCTCGGGAGGCCTCGGAGGAGGACCTGCTGGTGGTG  222

Query  223  CACACGAGGCGCTATCTTAATGAGCTCAAGTGGTCCTTTGCTGTTGCTACCATCACAGAAATCCCCCCCGTTAT  296
            |||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||..||.|||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct  223  CACACGAGGCGCTATCTCAACGAGCTGAAGTGGTCCTTTGTGGTGGCTACCATCACTGAGATCCCCCCGGTCAT  296

Query  297  CTTCCTCCCCAACTTCCTTGTGCAGAGGAAGGTGCTGAGGCCCCTTCGGACCCAGACAGGAGGAACCATAATGG  370
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  297  CTTTCTTCCCAACTTCCTTGTGCAGAGGAAGGTGCTGAGGCCCCTGCGGACCCAGACTGGAGGCACCATCATGG  370

Query  371  CGGGGAAGCTGGCTGTGGAGCGAGGCTGGGCCATCAACGTGGGGGGTGGCTTCCACCACTGCTCCAGCGACCGT  444
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  CAGGGAAGCTGGCTGTGGAGCGAGGCTGGGCCATCAATGTTGGTGGTGGCTTCCACCACTGCTCCAGTGACCGT  444

Query  445  GGCGGGGGCTTCTGTGCCTATGCGGACATCACGCTCGCCATCAAGTTTCTGTTTGAGCGTGTGGAGGGCATCTC  518
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  445  GGTGGGGGCTTCTGTGCCTATGCAGACATCACACTGGCTATCAAGTTCCTGTTTGAACGCGTGGAAGGCATCTC  518

Query  519  CAGGGCTACCATCATTGATCTTGATGCCCATCAGGGCAATGGGCATGAGCGAGACTTCATGGACGACAAGCGTG  592
            |||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|
Sbjct  519  CAGAGCCACCATCATTGATCTCGATGCCCACCAGGGCAATGGGCATGAGCGAGACTTCATGGGTGACAAGCGAG  592

Query  593  TGTACATCATGGATGTCTACAACCGCCACATCTACCCAGGGGACCGCTTTGCCAAGCAGGCCATCAGGCGGAAG  666
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||..|||||||||||||||||
Sbjct  593  TATACATCATGGATGTTTACAACCGCCACATCTACCCTGGGGATCGCTTTGCTAAAGAGGCCATCAGGCGGAAG  666

Query  667  GTGGAGCTGGAGTGGGGCACAGAGGATGATGAGTACCTGGATAAGGTGGAGAGGAACATCAAGAAATCCCTCCA  740
            |||||..||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||..|||.||..||||||||
Sbjct  667  GTGGAATTGGAGTGGGGCACAGAAGATGAGGAATATCTGGAGAAGGTGGAGAGGAATGTCAGGAGGTCCCTCCA  740

Query  741  GGAGCACCTGCCCGACGTGGTGGTATACAATGCAGGCACCGACATCCTCGAGGGGGACCGCCTTGGGGGGCTGT  814
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||.|.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGAGCACCTGCCTGACGTGGTGGTGTACAACGCTGGCACGGACGTGCTGGAGGGAGACCGCCTCGGGGGGCTGT  814

Query  815  CCATCAGCCCAGCGGGCATCGTGAAGCGGGATGAGCTGGTGTTCCGGATGGTCCGTGGCCGCCGGGTG-----C  883
            |||||||||||||||||||.||||||.|||||||..||||.|||||..|||||||.|.||     .||     |
Sbjct  815  CCATCAGCCCAGCGGGCATTGTGAAGAGGGATGAAGTGGTTTTCCGCGTGGTCCGAGCCC-----ATGATATAC  883

Query  884  CCATCCTTATGGTGACCTCAGGCGGGTACCAGAAGCGCACAGCCCGCATCATTGCTGACTCCATACTTAATCTG  957
            |||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||..||
Sbjct  884  CCATCCTCATGGTGACCTCGGGTGGGTACCAGAAGCGCACAGCCCGTATTATCGCCGACTCCATCCTCAACTTG  957

Query  958  TTTGGCCTGGGGCTCATTGGGCCTGAGTCACCCAGCGTCTCCGCACAGAACTCAGACACACCGCTGCTTCCCCC  1031
            ..||.|||||||||||||||||||||||..|||.|||||||.|||||||||||.|.||..||.||||||.||..
Sbjct  958  CATGACCTGGGGCTCATTGGGCCTGAGTTTCCCTGCGTCTCGGCACAGAACTCGGGCATCCCCCTGCTTTCCTG  1031

Query 1032  TGCAGTGCCC  1041
            |||.|||||.
Sbjct 1032  TGCTGTGCCT  1041