Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04146
• Subject: XM_006713338.1
• Aligned Length: 1041
• Identities: 804
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  ATGCTACACACAACCCAGCTGTACCAGCATGTGCCAGAGACACGCTGGCCAATCGTGTACTCGCCGCGCTACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTACACACAACCCAGCTGTACCAGCATGTGCCAGAGACACGCTGGCCAATCGTGTACTCGCCGCGCTACAA  74

Query   75  CATCACCTTCATGGGCCTGGAGAAGCTGCATCCCTTTGATGCCGGAAAATGGGGCAAAGTGATCAATTTCCTAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCACCTTCATGGGCCTGGAGAAGCTGCATCCCTTTGATGCCGGAAAATGGGGCAAAGTGATCAATTTCCTAA  148

Query  149  AAGAAGAGAAGCTTCTGTCTGACAGCATGCTGGTGGAGGCGCGGGAGGCCTCGGAGGAGGACCTGCTGGTGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAAGAGAAGCTTCTGTCTGACAGCATGCTGGTGGAGGCGCGGGAGGCCTCGGAGGAGGACCTGCTGGTGGTG  222

Query  223  CACACGAGGCGCTATCTTAATGAGCTCAAGTGGTCCTTTGCTGTTGCTACCATCACAGAAATCCCCCCCGTTAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACACGAGGCGCTATCTTAATGAGCTCAAGTGGTCCTTTGCTGTTGCTACCATCACAGAAATCCCCCCCGTTAT  296

Query  297  CTTCCTCCCCAACTTCCTTGTGCAGAGGAAGGTGCTGAGGCCCCTTCGGACCCAGACAGGAGGAACCATAATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCCTCCCCAACTTCCTTGTGCAGAGGAAGGTGCTGAGGCCCCTTCGGACCCAGACAGGAGGAACCATAATGG  370

Query  371  CGGGGAAGCTGGCTGTGGAGCGAGGCTGGGCCATCAACGTGGGGGGTGGCTTCCACCACTGCTCCAGCGACCGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct  371  CGGGGAAGCTGGCTGTGGAGCGAGGCTGGGCCATCAACGTGG--------------------------------  412

Query  445  GGCGGGGGCTTCTGTGCCTATGCGGACATCACGCTCGCCATCAAGTTTCTGTTTGAGCGTGTGGAGGGCATCTC  518
                                                                                      
Sbjct  413  --------------------------------------------------------------------------  412

Query  519  CAGGGCTACCATCATTGATCTTGATGCCCATCAGGGCAATGGGCATGAGCGAGACTTCATGGACGACAAGCGTG  592
                                                                                      
Sbjct  413  --------------------------------------------------------------------------  412

Query  593  TGTACATCATGGATGTCTACAACCGCCACATCTACCCAGGGGACCGCTTTGCCAAGCAGGCCATCAGGCGGAAG  666
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  413  ---------------------------------------------------------AGGCCATCAGGCGGAAG  429

Query  667  GTGGAGCTGGAGTGGGGCACAGAGGATGATGAGTACCTGGATAAGGTGGAGAGGAACATCAAGAAATCCCTCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430  GTGGAGCTGGAGTGGGGCACAGAGGATGATGAGTACCTGGATAAGGTGGAGAGGAACATCAAGAAATCCCTCCA  503

Query  741  GGAGCACCTGCCCGACGTGGTGGTATACAATGCAGGCACCGACATCCTCGAGGGGGACCGCCTTGGGGGGCTGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  GGAGCACCTGCCCGACGTGGTGGTATACAATGCAGGCACCGACATCCTCGAGGGGGACCGCCTTGGGGGGCTGT  577

Query  815  CCATCAGCCCAGCGGGCATCGTGAAGCGGGATGAGCTGGTGTTCCGGATGGTCCGTGGCCGCCGGGTGCCCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  578  CCATCAGCCCAGCGGGCATCGTGAAGCGGGATGAGCTGGTGTTCCGGATGGTCCGTGGCCGCCGGGTGCCCATC  651

Query  889  CTTATGGTGACCTCAGGCGGGTACCAGAAGCGCACAGCCCGCATCATTGCTGACTCCATACTTAATCTGTTTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  CTTATGGTGACCTCAGGCGGGTACCAGAAGCGCACAGCCCGCATCATTGCTGACTCCATACTTAATCTGTTTGG  725

Query  963  CCTGGGGCTCATTGGGCCTGAGTCACCCAGCGTCTCCGCACAGAACTCAGACACACCGCTGCTTCCCCCTGCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  CCTGGGGCTCATTGGGCCTGAGTCACCCAGCGTCTCCGCACAGAACTCAGACACACCGCTGCTTCCCCCTGCAG  799

Query 1037  TGCCC  1041
            |||||
Sbjct  800  TGCCC  804