Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04146
• Subject: XM_024453762.1
• Aligned Length: 1098
• Identities: 803
• Gaps: 294

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGCTACACACAACCCA  17
                                                                     |.|||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAAGGGTTAGCAGCGCAGCGGGGTCAGGGGATCCCCGCCCCCCGCCCTGGCTCAGGCTACACACAACCCA  74

Query   18  GCTGTACCAGCATGTGCCAGAGACACGCTGGCCAATCGTGTACTCGCCGCGCTACAACATCACCTTCATGGGCC  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGTACCAGCATGTGCCAGAGACACGCTGGCCAATCGTGTACTCGCCGCGCTACAACATCACCTTCATGGGCC  148

Query   92  TGGAGAAGCTGCATCCCTTTGATGCCGGAAAATGGGGCAAAGTGATCAATTTCCTAAAAGAAGAGAAGCTTCTG  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGAGAAGCTGCATCCCTTTGATGCCGGAAAATGGGGCAAAGTGATCAATTTCCTAAAAGAAGAGAAGCTTCTG  222

Query  166  TCTGACAGCATGCTGGTGGAGGCGCGGGAGGCCTCGGAGGAGGACCTGCTGGTGGTGCACACGAGGCGCTATCT  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTGACAGCATGCTGGTGGAGGCGCGGGAGGCCTCGGAGGAGGACCTGCTGGTGGTGCACACGAGGCGCTATCT  296

Query  240  TAATGAGCTCAAGTGGTCCTTTGCTGTTGCTACCATCACAGAAATCCCCCCCGTTATCTTCCTCCCCAACTTCC  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAATGAGCTCAAGTGGTCCTTTGCTGTTGCTACCATCACAGAAATCCCCCCCGTTATCTTCCTCCCCAACTTCC  370

Query  314  TTGTGCAGAGGAAGGTGCTGAGGCCCCTTCGGACCCAGACAGGAGGAACCATAATGGCGGGGAAGCTGGCTGTG  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGTGCAGAGGAAGGTGCTGAGGCCCCTTCGGACCCAGACAGGAGGAACCATAATGGCGGGGAAGCTGGCTGTG  444

Query  388  GAGCGAGGCTGGGCCATCAACGTGGGGGGTGGCTTCCACCACTGCTCCAGCGACCGTGGCGGGGGCTTCTGTGC  461
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  445  GAGCGAGGCTGGGCCATCAACGTGG-------------------------------------------------  469

Query  462  CTATGCGGACATCACGCTCGCCATCAAGTTTCTGTTTGAGCGTGTGGAGGGCATCTCCAGGGCTACCATCATTG  535
                                                                                      
Sbjct  470  --------------------------------------------------------------------------  469

Query  536  ATCTTGATGCCCATCAGGGCAATGGGCATGAGCGAGACTTCATGGACGACAAGCGTGTGTACATCATGGATGTC  609
                                                                                      
Sbjct  470  --------------------------------------------------------------------------  469

Query  610  TACAACCGCCACATCTACCCAGGGGACCGCTTTGCCAAGCAGGCCATCAGGCGGAAGGTGGAGCTGGAGTGGGG  683
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  ----------------------------------------AGGCCATCAGGCGGAAGGTGGAGCTGGAGTGGGG  503

Query  684  CACAGAGGATGATGAGTACCTGGATAAGGTGGAGAGGAACATCAAGAAATCCCTCCAGGAGCACCTGCCCGACG  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  CACAGAGGATGATGAGTACCTGGATAAGGTGGAGAGGAACATCAAGAAATCCCTCCAGGAGCACCTGCCCGACG  577

Query  758  TGGTGGTATACAATGCAGGCACCGACATCCTCGAGGGGGACCGCCTTGGGGGGCTGTCCATCAGCCCAGCGGGC  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  578  TGGTGGTATACAATGCAGGCACCGACATCCTCGAGGGGGACCGCCTTGGGGGGCTGTCCATCAGCCCAGCGGGC  651

Query  832  ATCGTGAAGCGGGATGAGCTGGTGTTCCGGATGGTCCGTGGCCGCCGGGTGCCCATCCTTATGGTGACCTCAGG  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  ATCGTGAAGCGGGATGAGCTGGTGTTCCGGATGGTCCGTGGCCGCCGGGTGCCCATCCTTATGGTGACCTCAGG  725

Query  906  CGGGTACCAGAAGCGCACAGCCCGCATCATTGCTGACTCCATACTTAATCTGTTTGGCCTGGGGCTCATTGGGC  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  CGGGTACCAGAAGCGCACAGCCCGCATCATTGCTGACTCCATACTTAATCTGTTTGGCCTGGGGCTCATTGGGC  799

Query  980  CTGAGTCACCCAGCGTCTCCGCACAGAACTCAGACACACCGCTGCTTCCCCCTGCAGTGCCC  1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  CTGAGTCACCCAGCGTCTCCGCACAGAACTCAGACACACCGCTGCTTCCCCCTGCAGTGCCC  861