Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04153
• Subject: XM_024454218.1
• Aligned Length: 2572
• Identities: 1522
• Gaps: 1046

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------ATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAG  29
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCCTGTGACAGAGGCTGCCTGCTGTTTCCCGGGGAGATCATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAG  74

Query   30  TGAGGATTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCAGAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCT  103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGATTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCAGAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCT  148

Query  104  CCTGCTCCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGACAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCAT  177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGCTCCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGACAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCAT  222

Query  178  GACTCCTACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGATCCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGT  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTCCTACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGATCCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGT  296

Query  252  CCAGGTGCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGCCAGGGTTGTGTCTGAAGAGAAATCCCTCATGT  325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGGTGCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGCCAGGGTTGTGTCTGAAGAGAAATCCCTCATGT  370

Query  326  TCATCAGGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTCCCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACG  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATCAGGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTCCCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACG  444

Query  400  CTGGCTGACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCTGCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATT  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGCTGACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCTGCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATT  518

Query  474  TAAGGAGATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAGGGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCT  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAGGAGATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAGGGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCT  592

Query  548  ACGACAATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGATCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGAT  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGACAATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGATCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGAT  666

Query  622  GTCTGCCAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTCTGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCA  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCTGCCAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTCTGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCA  740

Query  696  GGCCTGTTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTGCCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAA  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCTGTTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTGCCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAA  814

Query  770  AATGTCTGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCCGTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGC  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATGTCTGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCCGTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGC  888

Query  844  TGTGCTCTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAGATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACAT  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGCTCTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAGATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACAT  962

Query  918  TCCCAGCAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAAGTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGA  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCCAGCAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAAGTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGA  1036

Query  992  AGAACTGCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGGGCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAG  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAACTGCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGGGCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAG  1110

Query 1066  AATGATGAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCACATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAA  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATGATGAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCACATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAA  1184

Query 1140  GGGGGCTGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAATCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGC  1213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGGGCTGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAATCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGC  1258

Query 1214  AGAACCGGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGCTGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACC  1287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAACCGGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGCTGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACC  1332

Query 1288  TTCGTCAACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAGGAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTG  1361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCGTCAACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAGGAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTG  1406

Query 1362  GAAGTTGAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCCAAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCA  1435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAGTTGAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCCAAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCA  1480

Query 1436  AGCGGGAGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGCACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGT----  1505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 1481  AGCGGGAGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGCACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGTTCGG  1554

Query 1506  AA--TGATTGACA--CTGACACC------------TTA------------------------------------  1527
            ||  |.|.|.|||  .|||| ||            |||                                    
Sbjct 1555  AACCTCACTTACATGGTGAC-CCGCAGGGAAAAGATTAAACGGTCTGTGTGCAAAGTCCAGGAACAGATATTCA  1627

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1628  ATCTTTACACTAAGCTTTTGGAGCAAGAAAGAGTTTCAGGTGTGCCTTCTTCCTGCTCCTCCTCCTCACTGGAA  1701

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1702  AACATGCTTTTGTTTAACAGTCCTTCTGTTGGCCCTGATGCTCCCAAGATAGAGGACTTGAAGTGGCATTCTGC  1775

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1776  ATTCTTCAGAAAACAAATGGGTACTTCCTTGGTTCATTCGCTGAAAAAGCCCCATAAGCGAGATCCTTTGCAGA  1849

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1850  ATAGCCCTGGAAGTGAAGGCAAAACCCTGCTGAAGCAGCCAGACCTGTGTGGTAGAAGGGAGGGGATGGTGGTC  1923

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1924  CCAGAGAGCTTTTTGGGTTTAGAAAAGACCTTTGCAGAAGCACGTCTCATATCAGCACAACAGAAAAATGGTGT  1997

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1998  GGTGATGCCAGACCATGGGAAAAGAAGAGACAATCGTTTTCATTGTGATCTCATTAAAGGAGACTTAAAGGACA  2071

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2072  AATCTTTTAAACAGAGTCACAAGCCTCTCAGGTCCACAGATGTGTCCCAGAGGCATCTGGACAACACAAGAGCT  2145

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2146  GCCACCTCCCCTGGAGTGGGGCAGTCAGCACCTGGCACAAGGAAGGAGATAGTGCCCAAGTGCAATGGCTCCCT  2219

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2220  AATCAAAGTAAACTATAATCAGACTGCAGTCAAAGTGCCTACAACACCTGCCAGCCCAGTGAAAAACTGGGGAG  2293

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2294  GATTCCGGATTCCAAAGAAGGGGGAACGGCAGCAGCAGGGAGAGGCCCACGATGGGGCCTGCCACCAGCACTCA  2367

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2368  GACTACCCATATTTGGGCTTAGGCCGAGTTCCAGCCAAGGAAAGGGCAAAAAGCAAATTAAAATCCGACAATGA  2441

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2442  GAATGACGGGTATGTCCCCGATGTGGAAATGAGTGACTCAGAGAGTGAGGCATCAGAAAAGAAATGTATACACA  2515

Query 1528  --------------------------------------------------------  1527
                                                                    
Sbjct 2516  CCAGCAGCACTATCAGCAGAAGGACAGACATTATCAGGAGAAGCATCTTGGCTTCT  2571