Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_04216
Subject:
XM_011528320.3
Aligned Length:
1173
Identities:
1122
Gaps:
51

Alignment

Query    1  ATGGCCGCCCCGCCGCGCCCCGCGCCATCGCCCCCCGCCCCGCGGCGCCTCGACACGAGCGACGTCCTGCAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGCCCCGCCGCGCCCCGCGCCATCGCCCCCCGCCCCGCGGCGCCTCGACACGAGCGACGTCCTGCAGCA  74

Query   75  GATCATGGCCATCACCGACCAGAGCCTGGACGAGGCACAGGCCAGAAAGCATGCTCTGAATTGCCATCGGATGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATCATGGCCATCACCGACCAGAGCCTGGACGAGGCACAGGCCAGAAAGCATGCTCTGAATTGCCATCGGATGA  148

Query  149  AGCCTGCTCTGTTCAGCGTGCTCTGTGAGATCAAGGAAAAGACAG-----------------------------  193
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct  149  AGCCTGCTCTGTTCAGCGTGCTCTGTGAGATCAAGGAAAAGACAGCATCTTCATTTCTCACGCGTCCGTGTGAA  222

Query  194  ----------------------TGGTAAGCATCCGTGGCATTCAAGACGAAGATCCCCCTGACGCCCAGCTCCT  245
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGACCACCAAACAGGCTTTCTTGGTAAGCATCCGTGGCATTCAAGACGAAGATCCCCCTGACGCCCAGCTCCT  296

Query  246  GAGGCTGGATAACATGCTGCTGGCTGAGGGCGTGTGCAGGCCCGAGAAGAGAGGAAGAGGAGGAGCGGTGGCCA  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGGCTGGATAACATGCTGCTGGCTGAGGGCGTGTGCAGGCCCGAGAAGAGAGGAAGAGGAGGAGCGGTGGCCA  370

Query  320  GGGCCGGCACAGCAACACCAGGTGGCTGTCCAAATGACAATAGCATTGAGCACTCTGACTACAGGGCCAAGCTG  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGCCGGCACAGCAACACCAGGTGGCTGTCCAAATGACAATAGCATTGAGCACTCTGACTACAGGGCCAAGCTG  444

Query  394  TCCCAGATCCGACAGATTTACCACTCTGAGCTAGAGAAATATGAACAGGCCTGTCGTGAGTTCACCACGCACGT  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCCAGATCCGACAGATTTACCACTCTGAGCTAGAGAAATATGAACAGGCCTGTCGTGAGTTCACCACGCACGT  518

Query  468  CACCAACCTCCTCCAGGAGCAGAGCAGGATGAGGCCTGTCTCCCCTAAGGAGATTGAGCGCATGGTCGGCGCCA  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCAACCTCCTCCAGGAGCAGAGCAGGATGAGGCCTGTCTCCCCTAAGGAGATTGAGCGCATGGTCGGCGCCA  592

Query  542  TTCACGGCAAGTTCAGCGCCATCCAGATGCAGTTGAAGCAGAGCACCTGTGAGGCAGTGATGACCCTGCGTTCG  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCACGGCAAGTTCAGCGCCATCCAGATGCAGTTGAAGCAGAGCACCTGTGAGGCAGTGATGACCCTGCGTTCG  666

Query  616  CGGCTGCTCGATGCCAGGCGCAAGCGGCGGAATTTCAGCAAGCAGGCGACGGAAGTGCTGAATGAGTATTTTTA  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGGCTGCTCGATGCCAGGCGCAAGCGGCGGAATTTCAGCAAGCAGGCGACGGAAGTGCTGAATGAGTATTTTTA  740

Query  690  CTCCCATCTGAACAACCCTTACCCCAGCGAAGAAGCCAAAGAAGAGCTGGCCAGGAAGGGCGGCCTCACCATCT  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCCATCTGAACAACCCTTACCCCAGCGAAGAAGCCAAAGAAGAGCTGGCCAGGAAGGGCGGCCTCACCATCT  814

Query  764  CCCAGGTCTCTAACTGGTTTGGCAACAAAAGAATCCGGTATAAAAAGAACATGGGGAAGTTTCAAGAAGAGGCT  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCAGGTCTCTAACTGGTTTGGCAACAAAAGAATCCGGTATAAAAAGAACATGGGGAAGTTTCAAGAAGAGGCT  888

Query  838  ACCATTTACACGGGTAAAACGGCTGTGGATACCACGGAAGTTGGGGTCCCAGGGAACCACGCCAGCTGCCTGTC  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCATTTACACGGGTAAAACGGCTGTGGATACCACGGAAGTTGGGGTCCCAGGGAACCACGCCAGCTGCCTGTC  962

Query  912  AACACCTAGCTCCGGCTCCTCTGGACCCTTCCCGCTGCCCAGCGCTGGGGACGCCTTCCTCACCCTGCGGACTC  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACACCTAGCTCCGGCTCCTCTGGACCCTTCCCGCTGCCCAGCGCTGGGGACGCCTTCCTCACCCTGCGGACTC  1036

Query  986  TGGCCTCTCTCCAGCCTCCTCCTGGGGGAGGCTGCCTGCAGTCCCAGGCCCAGGGTAGCTGGCAGGGGGCCACC  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGCCTCTCTCCAGCCTCCTCCTGGGGGAGGCTGCCTGCAGTCCCAGGCCCAGGGTAGCTGGCAGGGGGCCACC  1110

Query 1060  CCCCAACCTGCAACTGCCTCACCTGCTGGAGACCCTGGCAGCATCAACTCCAGTACATCTAAT  1122
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCCAACCTGCAACTGCCTCACCTGCTGGAGACCCTGGCAGCATCAACTCCAGTACATCTAAT  1173