Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_04216
Subject:
XM_011528322.2
Aligned Length:
1122
Identities:
864
Gaps:
258

Alignment

Query    1  ATGGCCGCCCCGCCGCGCCCCGCGCCATCGCCCCCCGCCCCGCGGCGCCTCGACACGAGCGACGTCCTGCAGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GATCATGGCCATCACCGACCAGAGCCTGGACGAGGCACAGGCCAGAAAGCATGCTCTGAATTGCCATCGGATGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGCCTGCTCTGTTCAGCGTGCTCTGTGAGATCAAGGAAAAGACAGTGGTAAGCATCCGTGGCATTCAAGACGAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GATCCCCCTGACGCCCAGCTCCTGAGGCTGGATAACATGCTGCTGGCTGAGGGCGTGTGCAGGCCCGAGAAGAG  296
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGCTGCTGGCTGAGGGCGTGTGCAGGCCCGAGAAGAG  38

Query  297  AGGAAGAGGAGGAGCGGTGGCCAGGGCCGGCACAGCAACACCAGGTGGCTGTCCAAATGACAATAGCATTGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  AGGAAGAGGAGGAGCGGTGGCCAGGGCCGGCACAGCAACACCAGGTGGCTGTCCAAATGACAATAGCATTGAGC  112

Query  371  ACTCTGACTACAGGGCCAAGCTGTCCCAGATCCGACAGATTTACCACTCTGAGCTAGAGAAATATGAACAGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  113  ACTCTGACTACAGGGCCAAGCTGTCCCAGATCCGACAGATTTACCACTCTGAGCTAGAGAAATATGAACAGGCC  186

Query  445  TGTCGTGAGTTCACCACGCACGTCACCAACCTCCTCCAGGAGCAGAGCAGGATGAGGCCTGTCTCCCCTAAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  187  TGTCGTGAGTTCACCACGCACGTCACCAACCTCCTCCAGGAGCAGAGCAGGATGAGGCCTGTCTCCCCTAAGGA  260

Query  519  GATTGAGCGCATGGTCGGCGCCATTCACGGCAAGTTCAGCGCCATCCAGATGCAGTTGAAGCAGAGCACCTGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  GATTGAGCGCATGGTCGGCGCCATTCACGGCAAGTTCAGCGCCATCCAGATGCAGTTGAAGCAGAGCACCTGTG  334

Query  593  AGGCAGTGATGACCCTGCGTTCGCGGCTGCTCGATGCCAGGCGCAAGCGGCGGAATTTCAGCAAGCAGGCGACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  AGGCAGTGATGACCCTGCGTTCGCGGCTGCTCGATGCCAGGCGCAAGCGGCGGAATTTCAGCAAGCAGGCGACG  408

Query  667  GAAGTGCTGAATGAGTATTTTTACTCCCATCTGAACAACCCTTACCCCAGCGAAGAAGCCAAAGAAGAGCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  409  GAAGTGCTGAATGAGTATTTTTACTCCCATCTGAACAACCCTTACCCCAGCGAAGAAGCCAAAGAAGAGCTGGC  482

Query  741  CAGGAAGGGCGGCCTCACCATCTCCCAGGTCTCTAACTGGTTTGGCAACAAAAGAATCCGGTATAAAAAGAACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  CAGGAAGGGCGGCCTCACCATCTCCCAGGTCTCTAACTGGTTTGGCAACAAAAGAATCCGGTATAAAAAGAACA  556

Query  815  TGGGGAAGTTTCAAGAAGAGGCTACCATTTACACGGGTAAAACGGCTGTGGATACCACGGAAGTTGGGGTCCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  TGGGGAAGTTTCAAGAAGAGGCTACCATTTACACGGGTAAAACGGCTGTGGATACCACGGAAGTTGGGGTCCCA  630

Query  889  GGGAACCACGCCAGCTGCCTGTCAACACCTAGCTCCGGCTCCTCTGGACCCTTCCCGCTGCCCAGCGCTGGGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  GGGAACCACGCCAGCTGCCTGTCAACACCTAGCTCCGGCTCCTCTGGACCCTTCCCGCTGCCCAGCGCTGGGGA  704

Query  963  CGCCTTCCTCACCCTGCGGACTCTGGCCTCTCTCCAGCCTCCTCCTGGGGGAGGCTGCCTGCAGTCCCAGGCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  CGCCTTCCTCACCCTGCGGACTCTGGCCTCTCTCCAGCCTCCTCCTGGGGGAGGCTGCCTGCAGTCCCAGGCCC  778

Query 1037  AGGGTAGCTGGCAGGGGGCCACCCCCCAACCTGCAACTGCCTCACCTGCTGGAGACCCTGGCAGCATCAACTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  AGGGTAGCTGGCAGGGGGCCACCCCCCAACCTGCAACTGCCTCACCTGCTGGAGACCCTGGCAGCATCAACTCC  852

Query 1111  AGTACATCTAAT  1122
            ||||||||||||
Sbjct  853  AGTACATCTAAT  864