Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_04243
Subject:
NM_023196.4
Aligned Length:
584
Identities:
478
Gaps:
25

Alignment

Query   1  AT-----------GGCCCTGCTCTCGC-----GCCCCGCGCTCACCCTCCTGCTCCTCCTCATGGCCGCTGTTG  58
           ||           ||||| ||.|.|||     ||||||||||   ||||||.|||||.||..|||||.|||   
Sbjct   1  ATGGTGACTCCGCGGCCC-GCGCCCGCCCGGAGCCCCGCGCT---CCTCCTCCTCCTGCTGCTGGCCACTG---  67

Query  59  TCAGGT-GCCAGGAGCAGGCCCAGACCACCGACTGGAGAGCCACCCTGAAGACCATCCGGAACGGCGTTCATAA  131
            |..|| |.|||||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.||
Sbjct  68  -CGCGTGGGCAGGAACAGGACCAGACCACCGACTGGAGGGCCACCCTCAAGACCATCCGCAACGGCATCCACAA  140

Query 132  GATAGACACGTACCTGAACGCCGCCTTGGACCTCCTGGGAGGCGAGGACGGTCTCTGCCAGTATAAATGCAGTG  205
           |||||||||||||||.||||||||..|||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 141  GATAGACACGTACCTCAACGCCGCGCTGGACCTGCTGGGCGGGGAGGACGGGCTCTGCCAGTACAAGTGCAGCG  214

Query 206  ACGGATCTAAGCCTTTCCCACGTTATGGTTATAAACCCTCCCCACCGAATGGATGTGGCTCTCCACTGTTTGGT  279
           |||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 215  ACGGATCGAAGCCTGTTCCACGCTATGGATATAAACCATCTCCACCAAATGGCTGTGGCTCGCCACTGTTTGGC  288

Query 280  GTTCATCTTAACATTGGTATCCCTTCCCTGACAAAGTGTTGCAACCAACACGACAGGTGCTATGAGACCTGTGG  353
           ||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 289  GTTCATCTGAACATAGGTATCCCTTCCCTGACCAAGTGCTGCAACCAGCACGACAGATGCTACGAGACCTGCGG  362

Query 354  CAAAAGCAAGAATGACTGTGATGAAGAATTCCAGTATTGCCTCTCCAAGATCTGCCGAGATGTACAGAAAACAC  427
           .|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||.|
Sbjct 363  GAAAAGCAAGAACGACTGTGACGAGGAGTTCCAGTACTGCCTCTCCAAGATCTGCAGAGACGTGCAGAAGACGC  436

Query 428  TAGGACTAACTCAGCATGTTCAGGCATGTGAAACAACAGTGGAGCTCTTGTTTGACAGTGTTATACATTTAGGT  501
           |.||||||.|||||.|.||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 437  TCGGACTATCTCAGAACGTCCAGGCATGTGAGACAACGGTGGAGCTCCTCTTTGACAGCGTCATCCATTTAGGC  510

Query 502  TGTAAACCATATCTGGACAGCCAACGAGCCGCATGCAGGTGTCATTATGAAGAAAAAACTGATCTT  567
           ||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||.||||||.|||||||||||||||.|||||.
Sbjct 511  TGCAAGCCATACCTGGACAGCCAGCGGGCTGCATGCTGGTGTCGTTATGAAGAAAAAACAGATCTA  576