Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04256
• Subject: NM_001110197.1
• Aligned Length: 1083
• Identities: 966
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ------ATGGCTGGCTGTGGTGAAATTGATCATTCAATAAACATGCTTCCTACAAACAGGAAAGCGAACGAGTC  68
                  |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|.|||.||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGAGATGGCCGGCTGTGGTGAAATTGATCACTCAATAAATATGCTTCCTACAAATAAGAAGGCAAATGAGTC  74

Query   69  CTGTTCTAATACTGCACCTTCTTTAACCGTCCCTGAATGTGCCATTTGTCTGCAAACATGTGTTCATCCAGTCA  142
            ||||||.|||||||||||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct   75  CTGTTCCAATACTGCACCTTCTCTGACAGTTCCTGAATGTGCCATTTGTCTACAAACATGTGTTCACCCTGTCA  148

Query  143  GTCTGCCCTGTAAGCACGTTTTCTGCTATCTATGTGTAAAAGGAGCTTCATGGCTTGGAAAGCGGTGTGCTCTT  216
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  149  GTCTGCCCTGTAAGCATGTTTTCTGTTATCTGTGTGTAAAGGGTGCTTCATGGCTTGGGAAGCGATGTGCTCTT  222

Query  217  TGTCGACAAGAAATTCCCGAGGATTTCCTTGACAAGCCAACCTTGTTGTCACCAGAAGAACTCAAGGCAGCAAG  290
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  223  TGTCGACAAGAGATTCCTGAGGATTTTCTTGACAAGCCAACCTTGTTGTCACCAGAAGAACTTAAGGCTGCAAG  296

Query  291  TAGAGGAAATGGTGAATATGCATGGTATTATGAAGGAAGAAATGGGTGGTGGCAGTACGATGAGCGCACTAGTA  364
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.
Sbjct  297  CAGAGGAAATGGTGAATATGCGTGGTATTATGAAGGAAGGAATGGGTGGTGGCAGTATGATGAGCGCACTAGTC  370

Query  365  GAGAGCTGGAAGATGCTTTTTCCAAAGGTAAAAAGAACACTGAAATGTTAATTGCTGGCTTTCTGTATGTCGCT  438
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  371  GGGAGCTAGAAGATGCTTTTTCCAAAGGTAAAAAGAACACGGAAATGTTAATTGCTGGATTTCTGTATGTTGCT  444

Query  439  GATCTTGAAAACATGGTTCAATATAGGAGAAATGAACATGGACGTCGCAGGAAGATTAAGCGAGATATAATAGA  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCTTGAAAACATGGTTCAATATAGGAGAAATGAACATGGACGTCGCAGGAAGATTAAGCGAGATATAATAGA  518

Query  513  TATACCAAAGAAGGGAGTAGCTGGACTTAGGCTAGACTGTGATGCTAATACCGTAAACCTAGCAAGAGAGAGCT  586
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.|||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  TATACCAAAGAAGGGAGTAGCTGGACTTAGGCTGGACTGTGACACCAATACTGTAAATCTAGCAAGAGAGAGTT  592

Query  587  CTGCTGACGGAGCGGACAGTGTATCAGCACAGAGTGGAGCTTCTGTTCAGCCCCTAGTG---TCTTCTGTAAGG  657
            |||||||.||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||....||||   ||||||..||||
Sbjct  593  CTGCTGATGGTGCGGACAGTGGATCAGCACAGACTGGAGCTTCTGTTCAGCTTGCAGTGCCATCTTCTACAAGG  666

Query  658  CCCCTAACATCAGTAGATGGTCAGTTAACAAGCCCTGCAACACCATCCCCTGATGCAAGCACTTCTCTGGAAGA  731
            |||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||
Sbjct  667  CCCCTGACATCAGTTGATGGTCAGTTAACCAGCCCTGTAACACCATCCCCTGATGCAGGCATTTCTTTGGAAGA  740

Query  732  CTCTTTTGCTCATTTACAACTCAGTGGAGACAACACAGCTGAAAGGAGTCATAGGGGAGAAGGAGAAGAAGATC  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCTTTTGCTCATTTACAACTCAGTGGAGACAGCATAGCTGAACGGAGTCACAGAGGTGAAGGAGAAGAAGATC  814

Query  806  ATGAATCACCATCTTCAGGCAGGGTACCAGCACCAGACACCTCCATTGAAGAAACTGAATCAGATGCCAGTAGT  879
            |||||||.||||||||.|||||      ||.||||||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGAATCGCCATCTTCTGGCAG------AGTACCAGATACCTCCGTTGAAGAAACAGAATCAGATGCCAGTAGT  882

Query  880  GATAGTGAGGATGTATCTGCAGTTGTTGCACAGCACTCCTTGACCCAACAGAGACTTTTGGTTTCTAATGCAAA  953
            |||||||||||||...|||..||.||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||.|.||||.|||
Sbjct  883  GATAGTGAGGATGCCCCTGTGGTAGTTGCACAGCACTCTTTGACCCAACAGAGACCTTTGGTTCCAAATGGAAA  956

Query  954  CCAGACAGTACCCGATCGATCAGATCGATCGGGAACTGATCGATCAGTAGCAGGGGGTGGAACAGTGAGTGTCA  1027
            ||||||||||.||||.|..|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||..|||||||||
Sbjct  957  CCAGACAGTAGCCGACCAGTCAGACCGATCAGGAACTGACCGATCAGTTGCAGGGGGTGGGACCATGAGTGTCA  1030

Query 1028  GTGTCAGATCTAGAAGGCCTGATGGACAGTGCACAGTAACTGAAGTT  1074
            .|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1031  ATGTCAGATCCAGAAGGCCTGATGGGCAGTGCACAGTGACAGAGGTT  1077