Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04256
• Subject: NM_001242849.1
• Aligned Length: 1077
• Identities: 1074
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ---ATGGCTGGCTGTGGTGAAATTGATCATTCAATAAACATGCTTCCTACAAACAGGAAAGCGAACGAGTCCTG  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGCTGGCTGTGGTGAAATTGATCATTCAATAAACATGCTTCCTACAAACAGGAAAGCGAACGAGTCCTG  74

Query   72  TTCTAATACTGCACCTTCTTTAACCGTCCCTGAATGTGCCATTTGTCTGCAAACATGTGTTCATCCAGTCAGTC  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCTAATACTGCACCTTCTTTAACCGTCCCTGAATGTGCCATTTGTCTGCAAACATGTGTTCATCCAGTCAGTC  148

Query  146  TGCCCTGTAAGCACGTTTTCTGCTATCTATGTGTAAAAGGAGCTTCATGGCTTGGAAAGCGGTGTGCTCTTTGT  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCCTGTAAGCACGTTTTCTGCTATCTATGTGTAAAAGGAGCTTCATGGCTTGGAAAGCGGTGTGCTCTTTGT  222

Query  220  CGACAAGAAATTCCCGAGGATTTCCTTGACAAGCCAACCTTGTTGTCACCAGAAGAACTCAAGGCAGCAAGTAG  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGACAAGAAATTCCCGAGGATTTCCTTGACAAGCCAACCTTGTTGTCACCAGAAGAACTCAAGGCAGCAAGTAG  296

Query  294  AGGAAATGGTGAATATGCATGGTATTATGAAGGAAGAAATGGGTGGTGGCAGTACGATGAGCGCACTAGTAGAG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGAAATGGTGAATATGCATGGTATTATGAAGGAAGAAATGGGTGGTGGCAGTACGATGAGCGCACTAGTAGAG  370

Query  368  AGCTGGAAGATGCTTTTTCCAAAGGTAAAAAGAACACTGAAATGTTAATTGCTGGCTTTCTGTATGTCGCTGAT  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTGGAAGATGCTTTTTCCAAAGGTAAAAAGAACACTGAAATGTTAATTGCTGGCTTTCTGTATGTCGCTGAT  444

Query  442  CTTGAAAACATGGTTCAATATAGGAGAAATGAACATGGACGTCGCAGGAAGATTAAGCGAGATATAATAGATAT  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTGAAAACATGGTTCAATATAGGAGAAATGAACATGGACGTCGCAGGAAGATTAAGCGAGATATAATAGATAT  518

Query  516  ACCAAAGAAGGGAGTAGCTGGACTTAGGCTAGACTGTGATGCTAATACCGTAAACCTAGCAAGAGAGAGCTCTG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACCAAAGAAGGGAGTAGCTGGACTTAGGCTAGACTGTGATGCTAATACCGTAAACCTAGCAAGAGAGAGCTCTG  592

Query  590  CTGACGGAGCGGACAGTGTATCAGCACAGAGTGGAGCTTCTGTTCAGCCCCTAGTGTCTTCTGTAAGGCCCCTA  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGACGGAGCGGACAGTGTATCAGCACAGAGTGGAGCTTCTGTTCAGCCCCTAGTGTCTTCTGTAAGGCCCCTA  666

Query  664  ACATCAGTAGATGGTCAGTTAACAAGCCCTGCAACACCATCCCCTGATGCAAGCACTTCTCTGGAAGACTCTTT  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACATCAGTAGATGGTCAGTTAACAAGCCCTGCAACACCATCCCCTGATGCAAGCACTTCTCTGGAAGACTCTTT  740

Query  738  TGCTCATTTACAACTCAGTGGAGACAACACAGCTGAAAGGAGTCATAGGGGAGAAGGAGAAGAAGATCATGAAT  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTCATTTACAACTCAGTGGAGACAACACAGCTGAAAGGAGTCATAGGGGAGAAGGAGAAGAAGATCATGAAT  814

Query  812  CACCATCTTCAGGCAGGGTACCAGCACCAGACACCTCCATTGAAGAAACTGAATCAGATGCCAGTAGTGATAGT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CACCATCTTCAGGCAGGGTACCAGCACCAGACACCTCCATTGAAGAAACTGAATCAGATGCCAGTAGTGATAGT  888

Query  886  GAGGATGTATCTGCAGTTGTTGCACAGCACTCCTTGACCCAACAGAGACTTTTGGTTTCTAATGCAAACCAGAC  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGGATGTATCTGCAGTTGTTGCACAGCACTCCTTGACCCAACAGAGACTTTTGGTTTCTAATGCAAACCAGAC  962

Query  960  AGTACCCGATCGATCAGATCGATCGGGAACTGATCGATCAGTAGCAGGGGGTGGAACAGTGAGTGTCAGTGTCA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTACCCGATCGATCAGATCGATCGGGAACTGATCGATCAGTAGCAGGGGGTGGAACAGTGAGTGTCAGTGTCA  1036

Query 1034  GATCTAGAAGGCCTGATGGACAGTGCACAGTAACTGAAGTT  1074
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GATCTAGAAGGCCTGATGGACAGTGCACAGTAACTGAAGTT  1077