Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04314
- Subject:
- NM_138312.1
- Aligned Length:
- 1252
- Identities:
- 1124
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTGTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATCCAGCAGGGAGGTCC 74
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGTCTATTTCCTTGAGCTCTTTAATTTTCTTGCCAATTTGGATAAACATGGCACAAATGCAGCAGGGAGGTTC 74
Query 75 AGATGAAAAAGAAAAGACTACCGCACTGAAAGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAATGAAAAAAG 148
|.||||||.||||.|||||.|.|||.||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 75 AAATGAAACAGAACAGACTGCAGCATTGAAAGATTTGCTGTCTAGGATCGATTTGGATGAACTCATGAAAAAGG 148
Query 149 ATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAAGA 222
|.|||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 ACGAACCACCTTTTGATTTTCCAGATACACTGGAAGGCTTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGGCAGTTAAGA 222
Query 223 CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATACGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGAGAAGACTTACACAGGTGGAACCAGAAAAGATATGA 296
Query 297 GGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAG-TATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTATCT 369
.|||||.||.||||||||||| ||| |||||.||||||||||||||||..||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct 297 AGCTCTGGGCGAGATCATCAC-AAGATATGTTTATGAGCTCCTGGAAAGTGACTGTAATTTGAAAAAAATCTCT 369
Query 370 ATTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACA 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 ATTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCACA 443
Query 444 GAAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTATTATAAATG 517
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 444 GAAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGTCAGTGGGCTAGAAGGCTTATTATTAATG 517
Query 518 AAGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCTGAAGGATATGGAGTAATAGTACTA 591
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||.||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 518 AAGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCTTTTATTAAGAGAGCTATGGATGAAGGGTATGGAGTCATCGTCCTG 591
Query 592 AATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCA---TCTGATAGTTCAGA 662
||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.|||.||.||...|||||||||| ||||||.||.||||
Sbjct 592 AACCCAAATGAAAACTATATAGAAGTGGAAAAGCAGAAAATGCATAAACAGTCATCATCTTCTGATGGTACAGA 665
Query 663 TGAACCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGAGA 736
|||.|||||||..||.||||||||.|.||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 666 TGAGCCAGCAGGGAAGCGGGAAAGGAGAGATAAGGTCTCCAAGGAAACAAAGAAGCGTCGTGATTTCTATGAGA 739
Query 737 AGTATCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAACAT 810
||||.||.|||||.||||..||.||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 740 AGTACCGCAACCCTCAAAAGGAGAAAGAAATGATGCAGTTGTTTATCAGGGAAAATGGTTCTCCTGAAGAGCAT 813
Query 811 GCAATCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTATGG 884
||..|||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct 814 GCGGTCTATGTGTGGGACCATTTCATAGCCCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTCTTTGTGGCTCATAGCTATGG 887
Query 885 AGGACTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATTGA 958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 888 AGGACTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCAGATGTAAAAAGTAAGGTGACTGCTGTGGCATTGA 961
Query 959 CAGACTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGT 1032
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 CAGACTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACCATCCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTTGT 1035
Query 1033 AATTGGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCAGC 1106
||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|.||.||.||
Sbjct 1036 AACTGGGTCTCCAGCTCAGAACCATTAGATACATCGGTGGAATCCATGCTGCCTGACTGTCCCAGAGTGTCTGC 1109
Query 1107 AGGCACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGAAGCCTCAG 1180
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.|
Sbjct 1110 AGGCACCGACCGTCACGAGCTCACTTCCTGGAAGAGCTTCCCGTCTATCTTCAAGTTCTTCGCGGAAGCCTCGG 1183
Query 1181 AGGCCAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG 1248
|||||||||.||||||.|.|||||||||..|||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1184 AGGCCAAGAGCAGCTCGCAGAAGCCGGCCCTGACGCGGCGCTCGCACCGGATCAAGCACGAGGAGCTG 1251