Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04314
- Subject:
- XM_006517350.3
- Aligned Length:
- 1328
- Identities:
- 1098
- Gaps:
- 94
Alignment
Query 1 ---ATGTCT--ATTTCCT-----------TGAGCTCTTTAATTTTGT-----TGCCAAT-TTG---GATAAA-- 47
|.||.| |||.||| .|.||..|..||.||.|| .||..|| ||| ||.|||
Sbjct 1 ATGACGTTTAAATTCCCTGCAGACCCGGAAGTGCAATCGAACTTGGTCGGGGCGCGGATCTTGAGAGAGAAAGT 74
Query 48 ------CATGGCACAAATCCAGCAGGGAG---GTCCAGA----TGAAAAAGAA----AAGACT------ACC-- 96
||.|||.|| |||||| |.||||| || ||| |.|.|| |||
Sbjct 75 CCGAGCCAGGGCGCA--------AGGGAGTTCGCCCAGAGATCTG-----GAAGGCCACGCCTCCTCGCACCTA 135
Query 97 --------GCACTGAA----------------AGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAATGAAAAA 146
|||.||.| ||||||..|.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 136 CCCTCTCAGCATTGCAGCTGGGGACAGAGCTCAGATTTGCTGTCTAGGATCGATTTGGATGAACTCATGAAAAA 209
Query 147 AGATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGACAGTTAA 220
.||.|||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 210 GGACGAACCACCTTTTGATTTTCCAGATACACTGGAAGGCTTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGGCAGTTAA 283
Query 221 GACACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAAAGATAC 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 284 GACACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGAGAAGACTTACACAGGTGGAACCAGAAAAGATAT 357
Query 295 GAGGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAG-TATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAAAAGTAT 367
||.|||||.||.||||||||||| ||| |||||.||||||||||||||||..||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 358 GAAGCTCTGGGCGAGATCATCAC-AAGATATGTTTATGAGCTCCTGGAAAGTGACTGTAATTTGAAAAAAATCT 430
Query 368 CTATTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCA 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431 CTATTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACAAATCCA 504
Query 442 CAGAAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTATTATAAA 515
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 505 CAGAAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGTCAGTGGGCTAGAAGGCTTATTATTAA 578
Query 516 TGAAGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCTGAAGGATATGGAGTAATAGTAC 589
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||.||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 579 TGAAGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCTTTTATTAAGAGAGCTATGGATGAAGGGTATGGAGTCATCGTCC 652
Query 590 TAAATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCA---TCTGATAGTTCA 660
|.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.|||.||.||...|||||||||| ||||||.||.||
Sbjct 653 TGAACCCAAATGAAAACTATATAGAAGTGGAAAAGCAGAAAATGCATAAACAGTCATCATCTTCTGATGGTACA 726
Query 661 GATGAACCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTTCTATGA 734
|||||.|||||||..||.||||||||.|.||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 727 GATGAGCCAGCAGGGAAGCGGGAAAGGAGAGATAAGGTCTCCAAGGAAACAAAGAAGCGTCGTGATTTCTATGA 800
Query 735 GAAGTATCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTGAAGAAC 808
||||||.||.|||||.||||..||.||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 801 GAAGTACCGCAACCCTCAAAAGGAGAAAGAAATGATGCAGTTGTTTATCAGGGAAAATGGTTCTCCTGAAGAGC 874
Query 809 ATGCAATCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCACAGCTAT 882
||||..|||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 875 ATGCGGTCTATGTGTGGGACCATTTCATAGCCCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTCTTTGTGGCTCATAGCTAT 948
Query 883 GGAGGACTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGTGGCATT 956
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 949 GGAGGACTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCAGATGTAAAAAGTAAGGTGACTGCTGTGGCATT 1022
Query 957 GACAGACTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTT 1030
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 GACAGACTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACCATCCGAGAATGGATGAGAGAGAACTGTT 1096
Query 1031 GTAATTGGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGGGTCTCA 1104
||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|.||.||.
Sbjct 1097 GTAACTGGGTCTCCAGCTCAGAACCATTAGATACATCGGTGGAATCCATGCTGCCTGACTGTCCCAGAGTGTCT 1170
Query 1105 GCAGGCACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGAAGCCTC 1178
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||..|.||||||||
Sbjct 1171 GCAGGCACCGACCGTCACGAGCTCACTTCCTGGAAGAGCTTCCCGTCTATCTTCAAGTTCTTCGCGGAAGCCTC 1244
Query 1179 AGAGGCCAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGCTG 1248
.||||||||||.||||||.|.|||||||||..|||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1245 GGAGGCCAAGAGCAGCTCGCAGAAGCCGGCCCTGACGCGGCGCTCGCACCGGATCAAGCACGAGGAGCTG 1314