Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04446
• Subject: XM_011519130.2
• Aligned Length: 2192
• Identities: 1450
• Gaps: 724

Alignment

Query    1  ATGGACATACAGCTGGACCCTGCCAGAGATGACCTGCCTCTCATGGCCAACACCAGCCACATACTTGTGAAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACATACAGCTGGACCCTGCCAGAGATGACCTGCCTCTCATGGCCAACACCAGCCACATACTTGTGAAGCA  74

Query   75  CTATGTACTGGATTTGGATGTGGATTTTGAAAGTCAAGTCATTGAGGGGACCATAGTGCTTTTCCTCGAGGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTATGTACTGGATTTGGATGTGGATTTTGAAAGTCAAGTCATTGAGGGGACCATAGTGCTTTTCCTCGAGGATG  148

Query  149  GAAACAGATTCAAGAAACAGAATAGCTCTATTGAGGAAGCCTGCCAATCAGAATCAAACAAAGCCTGCAAATTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAAACAGATTCAAGAAACAGAATAGCTCTATTGAGGAAGCCTGCCAATCAGAATCAAACAAAGCCTGCAAATTT  222

Query  223  GGGATGCCTGAACCCTGCCATATTCCCGTGACAAATGCAAGGACCTTCTCATCTGAAATGGAATATAATGATTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGATGCCTGAACCCTGCCATATTCCCGTGACAAATGCAAGGACCTTCTCATCTGAAATGGAATATAATGATTT  296

Query  297  TGCAATCTGTAGTAAAGGTGAAAAAGATACTTCTGATAAAGATGGTAACCATGACAACCAGGAACATGCTTCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCAATCTGTAGTAAAGGTGAAAAAGATACTTCTGATAAAGATGGTAACCATGACAACCAGGAACATGCTTCTG  370

Query  371  GGATTTCTAGCTCAAAGTACTGCTGTGACACAGGGAATCATGGGAGTGAGGATTTTTTGCTAGTGTTGGACTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATTTCTAGCTCAAAGTACTGCTGTGACACAGGGAATCATGGGAGTGAGGATTTTTTGCTAGTGTTGGACTGC  444

Query  445  TGTGATTTATCTGTGTTAAAAGTCGAGGAGGTGGATGTTGCTGCTGTGCCAGGTCTGGAAAAATTTACAAGGTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTGATTTATCTGTGTTAAAAGTCGAGGAGGTGGATGTTGCTGCTGTGCCAGGTCTGGAAAAATTTACAAGGTC  518

Query  519  TCCTGAGCTCACGGTTGTTTCTGAGGAGTTCAGGAATCAGATTGTACGTGAACTTGTGACTTTGCCTGCAAATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTGAGCTCACGGTTGTTTCTGAGGAGTTCAGGAATCAGATTGTACGTGAACTTGTGACTTTGCCTGCAAATC  592

Query  593  GTTGGAGGGAGCAGTTAGACTATTACGCTCGCTGCAGCCAGGCTCCTGGCTGTGGGGAACTCCTCTTTGACACT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTGGAGGGAGCAGTTAGACTATTACGCTCGCTGCAGCCAGGCTCCTGGCTGTGGGGAACTCCTCTTTGACACT  666

Query  667  GACACTTGGAGCTTGCAGATAAGGAAGACAGGGGCTCAGACAGCTACTGACTTTCCTCATGCTATCAGGATATG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACACTTGGAGCTTGCAGATAAGGAAGACAGGGGCTCAGACAGCTACTGACTTTCCTCATGCTATCAGGATATG  740

Query  741  GTACAAAACTAAACCTGAAGGGCGATCGGTTACATGGACCTCAGACCAGAGTGGCAGGCCATGTGTTTATACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACAAAACTAAACCTGAAGGGCGATCGGTTACATGGACCTCAGACCAGAGTGGCAGGCCATGTGTTTATACTG  814

Query  815  TGGGATCTCCCATAAACAACAGGGCCCTTTTTCCATGCCAGGAGCCACCCGTTGCCATGTCAACATGGCAGGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGATCTCCCATAAACAACAGGGCCCTTTTTCCATGCCAGGAGCCACCCGTTGCCATGTCAACATGGCAGGCT  888

Query  889  ACAGTTCGAGCAGCTGCATCTTTTGTTGTTTTAATGAGTGGGGAAAATTCTGCCAAACCAACGCAGCTTTGGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGTTCGAGCAGCTGCATCTTTTGTTGTTTTAATGAGTGGGGAAAATTCTGCCAAACCAACGCAGCTTTGGGA  962

Query  963  AGAGTGCTCAAGCTGGTATTACTATGTAACTATGCCAATGCCAGCCTCCACCTTCACAATTGCAGTGGGATGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAGTGCTCAAGCTGGTATTACTATGTAACTATGCCAATGCCAGCCTCCACCTTCACAATTGCAGTGGGATGCT  1036

Query 1037  GGACAGAAATGAAGATGGAGACATGGTCATCAAATGATTTGGCAACAGAGAGACCCTTCTCACCTTCTGAGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGACAGAAATGAAGATGGAGACATGGTCATCAAATGATTTGGCAACAGAGAGACCCTTCTCACCTTCTGAGGCC  1110

Query 1111  AACTTCAGGCATGTTGGTGTTTGCAGTCACATGGAATACCCCTGCCGCTTCCAGAATGCTTCTGCCACCACCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTTCAGGCATGTTGGTGTTTGCAGTCACATGGAATACCCCTGCCGCTTCCAGAATGCTTCTGCCACCACCCA  1184

Query 1185  GGAGATCATTCCTCATCGGGTCTTTGCCCCTGTGTGCCTCACGGGTGCCTGCCAAGAGACCCTTCTGCGGCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGATCATTCCTCATCGGGTCTTTGCCCCTGTGTGCCTCACGGGTGCCTGCCAAGAGACCCTTCTGCGGCTGA  1258

Query 1259  TCCCTCCTTGCCTCTCAGCAGCACATTCTGTTCTGGGAGCACACCCGTTCTCTCGGCTGGATGTTCTCATCGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCCTCCTTGCCTCTCAGCAGCACATTCTGTTCTGGGAGCACACCCGTTCTCTCGGCTGGATGTTCTCATCGTC  1332

Query 1333  CCTGCCAACTTTCCAAGTCTGGGGATGGCCAGACCCAGTAAAGACAAAACTGGC----------CACACAAGTG  1396
            |||||||||||||||||||||||||||||||| .||||  |||  |||..||||          |.|||.||..
Sbjct 1333  CCTGCCAACTTTCCAAGTCTGGGGATGGCCAG-GCCAG--AAG--AAATATGGCTTGGTCCCAACCCACTAGGA  1401

Query 1397  ACTCGGGAGCATCTGTTATCAAGCATGGACTTAATCCGGAGAAGATCTTCATGCAGGTGC-----ATTATTTAA  1465
            ||||.|       |||.||.|||                             |||||.||     |      ||
Sbjct 1402  ACTCAG-------TGTGATGAAG-----------------------------GCAGGAGCCACAGA------AA  1433

Query 1466  AGGGCTACTTCCTTCTTCGGTTTCTTGCCAA-AAGACTTGGAGATG-----------AAACCTATTTTTCATTT  1527
            ||          ||||||...|||   |||| ||.||      |||           |||||            
Sbjct 1434  AG----------TTCTTCCAATTC---CCAATAACAC------ATGCTACGACTCAAAAACC------------  1476

Query 1528  TTAAGA-----AAATTTGTGCACACATTTCATGGACAGCTGATTCTTTCCCAGGATTTCCTTCAAATGCTACTG  1596
               |||     ||||.|.|  |||.||||                                             
Sbjct 1477  ---AGAGACGGAAATCTCT--ACATATTT---------------------------------------------  1500

Query 1597  GAGAACATTCCAGAAGAAAAAAGGCTTGAGCTGTCTGTTGAAAACATCTACCAAGACTGGCTTGAGAGTTCCGG  1670
                                                                                      
Sbjct 1501  --------------------------------------------------------------------------  1500

Query 1671  AATACCAAAGCCGCTGCAGAGGGAGCGTCGCGCCGGGGCGGAGTGCGGGCTTGCGCGGCAAGTGCGCGCCGAGG  1744
                                                                                      
Sbjct 1501  --------------------------------------------------------------------------  1500

Query 1745  TCACGAAATGGATTGGAGTGAACCGGAGACCCCGAAAACGGAAGCGCAGGGAGAAGGAAGAGGTGTTTGAAAAG  1818
                                                                                      
Sbjct 1501  --------------------------------------------------------------------------  1500

Query 1819  CTTCTTCCAGACCAGCTGGTCTTGCTTCTGGAGCATCTCTTGGAGCAGAAGACTCTGAGCCCCCGAACTCTGCA  1892
                                                                                      
Sbjct 1501  --------------------------------------------------------------------------  1500

Query 1893  AAGCCTCCAGAGGACATACCACCTCCAGGATCAGGATGCAGAGGTTCGCCATCGGTGGTGTGAACTCATTGTTA  1966
                                                                                      
Sbjct 1501  --------------------------------------------------------------------------  1500

Query 1967  AGCACAAGTTCACGAAAGCCTACAAAAGTGTGGAGAGGTTCCTTCAGGAGGATCAGGCCATGGGTGTGTACCTC  2040
                                                                                      
Sbjct 1501  --------------------------------------------------------------------------  1500

Query 2041  TACGGGGAGCTGATGGTGAGTGAGGACGCCAGACAGCAGCAGCTCGCCCGTAGGTGCTTCGAGCGGACCAAGGA  2114
                                                                                      
Sbjct 1501  --------------------------------------------------------------------------  1500

Query 2115  GCAGATGGATAGGTCCTCAGCCCAGGTGGTGGCCGAAATGTTATTT  2160
                                                          
Sbjct 1501  ----------------------------------------------  1500