Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04451
• Subject: XM_011542313.2
• Aligned Length: 1385
• Identities: 1246
• Gaps: 127

Alignment

Query    1  ATGGAGGCTACAGGAACAGATGAAGTTGACAAGCTAAAAACCAAATTTATATCTGCTTGGAACAACATGAAATA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCTACAGGAACAGATGAAGTTGACAAGCTAAAAACCAAATTTATATCTGCTTGGAACAACATGAAATA  74

Query   75  TAGTTGGGTGTTGAAAACAAAGACGTATTTTAGTAGAAATTCTCCTGTATTATTGCTTGGAAAATGTTACCATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAGTTGGGTGTTGAAAACAAAGACGTATTTTAGTAGAAATTCTCCTGTATTATTGCTTGGAAAATGTTACCATT  148

Query  149  TTAAATATGAAGATGAAGATAAAACGTTACCTGCAGAGTCGGGATGTACAATAGAGGATCACGTAATTGCAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTAAATATGAAGATGAAGATAAAACGTTACCTGCAGAGTCGGGATGTACAATAGAGGATCACGTAATTGCAGGA  222

Query  223  AATGTAGAAGAATTTCGTAAAGATTTCATTTCTAGAATATGGCTGACCTACAGGGAAGAATTCCCTCAAATAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATGTAGAAGAATTTCGTAAAGATTTCATTTCTAGAATATGGCTGACCTACAGGGAAGAATTCCCTCAAATAGA  296

Query  297  AGGCTCAGCTTTGACAACAGACTGTGGGTGGGGCTGCACATTGAGAACTGGCCAGATGCTCTTGGCTCAAGGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCTCAGCTTTGACAACAGACTGTGGGTGGGGCTGCACATTGAGAACTGGCCAGATGCTCTTGGCTCAAGGAC  370

Query  371  TCATACTACACTTTCTTGGTAGAGCTTGGACCTGGCCTGATGCTTTGAATATTGAAAATTCAGACTCTGAATCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATACTACACTTTCTTGGTAGAGCTTGGACCTGGCCTGATGCTTTGAATATTGAAAATTCAGACTCTGAATCA  444

Query  445  TGGACTTCCCACACTGTCAAAAAATTTACTGCATCATTTGAAGCATCACTTTCAGGGGAAAGAGAATTCAAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGACTTCCCACACTGTCAAAAAATTTACTGCATCATTTGAAGCATCACTTTCAGGGGAAAGAGAATTCAAAAC  518

Query  519  CCCAACAATTTCTCTGAAGGAAACAATTGGGAAATATTCTGATGATCATGAAATGCGAAATGAAGTTTATCATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCAACAATTTCTCTGAAGGAAACAATTGGGAAATATTCTGATGATCATGAAATGCGAAATGAAGTTTATCATA  592

Query  593  GGAAAATCATCTCTTGGTTTGGTGATTCCCCCTTGGCTCTTTTTGGCTTACATCAACTAATAGAATATGGAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGAAAATCATCTCTTGGTTTGGTGATTCCCCCTTGGCTCTTTTTGGCTTACATCAACTAATAGAATATGGAAAG  666

Query  667  AAGTCTGGGAAAAAAGCAGGAGATTGGTATGGACCAGCTGTGGTTGCTCACATTTTAAGAAAAGCAGTTGAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTCTGGGAAAAAAGCAGGAGATTGGTATGGACCAGCTGTGGTTGCTCACATTTTAAGAAAAGCAGTTGAAGA  740

Query  741  AGCAAGGCATCCTGATTTACAAGGAATAACTATTTATGTTGCACAAGATTGTACAGTTTACAATTCTGATGTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCAAGGCATCCTGATTTACAAGGAATAACTATTTATGTTGCACAAGATTGTACAGTTTACAATTCTGATGTAA  814

Query  815  TTGATAAACAGAGTGCTTCCATGACTTCTGATAATGCAGATGACAAAGCTGTTATTATTCTAGTTCCTGTTAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGATAAACAGAGTGCTTCCATGACTTCTGATAATGCAGATGACAAAGCTGTTATTATTCTAGTTCCTGTTAGA  888

Query  889  CTTGGTGGAGAAAGAACCAACACCGACTACTTAGAATTTGTGAAGGGTATTTTAAGCCTGGAATATTGTGTGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTGGTGGAGAAAGAACCAACACCGACTACTTAGAATTTGTGAAGGGTATTTTAAGCCTGGAATATTGTGTGGG  962

Query  963  TATTATTGGTGGCAAACCTAAACAGTCATATTACTTTGCTGGATTTCAAGATGACAGTTTGATTTACATGGATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATTATTGGTGGCAAACCTAAACAGTCATATTACTTTGCTGGATTTCAAGATGACAGTTTGATTTACATGGATC  1036

Query 1037  CTCATTACTGCCAATCTTTTGTAGATGTCAGCATAAAGGATTTCCCTCTTGAGACATTCCACTGCCCTTCTCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCATTACTGCCAATCTTTTGTAGATGTCAGCATAAAGGATTTCCCTCTTGAGACATTCCACTGCCCTTCTCCC  1110

Query 1111  AAAAAGATGTCTTTTCGAAAAATGGATCCCAGCTGTACAATAGGATTTTACTGTCGAAATGTTCAGGACTTCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAAGATGTCTTTTCGAAAAATGGATCCCAGCTGTACAATAGGATTTTACTGTCGAAATGTTCAGGACTTCAA  1184

Query 1185  ACGAGCTTCTGAAGAAATCACCAAGATGCTGAAATTTTCTTCTAAGGAGAAATATCCCTTATTTACTTTTGTAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||  .|.|||||.|..|..|||                .|.||.||.|||
Sbjct 1185  ACGAGCTTCTGAAGAAATCACCAAGA--ATCAAATTATGATTAAAG----------------CTGCTATTATAA  1240

Query 1259  ATGGTCAT-----TCCAGAGACTATGATTTT------ACATCTACTACAACCAATGAAGAAGACCTTTTTTCAG  1321
            |    |||     |.|||       ||||||      |||                                  
Sbjct 1241  A----CATCCATGTGCAG-------GATTTTATGTGGACA----------------------------------  1269

Query 1322  AGGATGAAAAGAAACAATTAAAAAGATTTAGCACGGAAGAGTTTGTCTTGCTT  1374
                                                                 
Sbjct 1270  -----------------------------------------------------  1269