Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04494
• Subject: XM_011537289.3
• Aligned Length: 927
• Identities: 758
• Gaps: 156

Alignment

Query   1  ATGTCCGCCAAGCCTGAAGTCAGCTTAGTGCGCGAGGCTTCTCGGCAGATCGTGGCCGGTGGTTCTGCAGGTCT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TGTAGAAATTTGCCTGATGCACCCCCTAGATGTGGTGAAAAC------------CAGGTTTCAGATTCAG-AGA  135
                                        |||||.|.|||||            |||...||||   ||| ||.
Sbjct   1  -----------------------------ATGTGTTTAAAACAACTTGATGGGGCAGTCCTCAG---CAGAAGC  42

Query 136  TGTGC-AACC-----GATCCAAACAGT----TATAAAAGCTTGG-TAGAC------AGCTTTCGAATGATTTTC  192
           .|||| .|||     |.|||  |||||    |||   .||.||| ||.||      |||     ||||     |
Sbjct  43  GGTGCTGACCTGAGTGTTCC--ACAGTCCTCTAT---TGCATGGATATACGGTAAAAGC-----AATG-----C  101

Query 193  CAAATGGAAGGGTTATTTGGTTTTTACAAGGGAATTCTGCCACCTATCTTGGCTGAAACCCCAAAAAGAGCAGT  266
           .|   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102  GA---GGA--GGTTATTTGGTTTTTACAAGGGAATTCTGCCACCTATCTTGGCTGAAACCCCAAAAAGAGCAGT  170

Query 267  GAAGTTTTTCACCTTTGAGCAGTACAAGAAATTGCTGGGATATGTGTCACTGTCACCAGCATTGACATTCGCCA  340
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171  GAAGTTTTTCACCTTTGAGCAGTACAAGAAATTGCTGGGATATGTGTCACTGTCACCAGCATTGACATTCGCCA  244

Query 341  TTGCTGGATTGGGATCTGGACTAACAGAAGCCATTGTAGTTAACCCTTTTGAGGTAGTAAAAGTTGGCTTGCAA  414
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245  TTGCTGGATTGGGATCTGGACTAACAGAAGCCATTGTAGTTAACCCTTTTGAGGTAGTAAAAGTTGGCTTGCAA  318

Query 415  GCAAATCGGAACACATTTGCAGAGCAACCATCCACTGTGGGTTATGCAAGACAAATCATTAAGAAGGAAGGCTG  488
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319  GCAAATCGGAACACATTTGCAGAGCAACCATCCACTGTGGGTTATGCAAGACAAATCATTAAGAAGGAAGGCTG  392

Query 489  GGGACTCCAGGGCCTCAACAAAGGATTAACTGCAACTTTGGGACGACATGGAGTTTTCAACATGGTTTATTTTG  562
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393  GGGACTCCAGGGCCTCAACAAAGGATTAACTGCAACTTTGGGACGACATGGAGTTTTCAACATGGTTTATTTTG  466

Query 563  GCTTCTACTACAATGTCAAAAACATGATTCCTGTCAATAAGGATCCAATCTTGGAGTTTTGGAGAAAATTTGGG  636
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 467  GCTTCTACTACAATGTCAAAAACATGATTCCTGTCAATAAGGATCCAATCTTGGAGTTTTGGAGAAAATTTGGG  540

Query 637  ATTGGTCTTCTCTCGGGGACAATAGCCTCAGTCATTAACATCCCTTTTGATGTTGCCAAAAGTAGGATTCAAGG  710
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541  ATTGGTCTTCTCTCGGGGACAATAGCCTCAGTCATTAACATCCCTTTTGATGTTGCCAAAAGTAGGATTCAAGG  614

Query 711  GCCTCAACCAGTTCCTGGAGAGATCAAGTACAGAACCTGTTTTAAAACAATGGCAACAGTCTATCAGGAAGAAG  784
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615  GCCTCAACCAGTTCCTGGAGAGATCAAGTACAGAACCTGTTTTAAAACAATGGCAACAGTCTATCAGGAAGAAG  688

Query 785  GGATTTTAGCTTTGTACAAAGGCCTGCTTCCCAAGATTATGAGACTTGGACCAGGTGGTGCAGTGATGCTGCTG  858
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 689  GGATTTTAGCTTTGTACAAAGGCCTGCTTCCCAAGATTATGAGACTTGGACCAGGTGGTGCAGTGATGCTGCTG  762

Query 859  GTTTATGAATACACCTATTCATGGCTTCAAGAGAACTGG  897
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763  GTTTATGAATACACCTATTCATGGCTTCAAGAGAACTGG  801