Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04510
• Subject: XM_011513293.2
• Aligned Length: 1844
• Identities: 1699
• Gaps: 142

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------------------ATGGAC----  6
                                                                            | ||||    
Sbjct    1  ATGGGCCTTGTAAAGAGACTTAACAAATGTACTGAATGTCCACTTTGGGCCAGGCTGGGCACCGA-GGACACAG  73

Query    7  --GACGACTATGAAGCGTACCACAGTCTGTTCTTGTCGCTG-----CTC-------------------------  48
              ||  ||||.||       |||||||    ||.|||.|||     |||                         
Sbjct   74  GGGA--ACTAAGA-------CACAGTC----CTGGTCACTGGGAAACTCACAGGCTGTTGGGAAAGAAAGATGC  134

Query   49  ----------------------------GGACTCTGCCCGTCTAAGACTCCCATCAATGAAAATGCTCCCGTCT  94
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  135  AGAAAGTATCTTCATTTCAGAAAAATATGGACTCTGCCCGTCTAAGACTCCCATCAATGAAAATGCTCCCGTCT  208

Query   95  TTGATCCTGAACCGGTCATTGCCCACTGCTTCAAGCAGTTCCAGCAGAAGGACTTCCGCCTGCCTCAGACCCGC  168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  209  TTGATCCTGAACCGGTCATTGCCCACTGCTTCAAGCAGTTCCAGCAGAAGGACTTCCGCCTGCCTCAGACCCGC  282

Query  169  CGGCGAATCATCATGGTGCCTCGCAAGGAGGATCAGACACCCCTTAATCCTGCATCCCAACCTCAGGCTCCCCC  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  283  CGGCGAATCATCATGGTGCCTCGCAAGGAGGATCAGACACCCCTTAATCCTGCATCCCAACCTCAGGCTCCCCC  356

Query  243  AAAGCCCATCCCCAGCTTCAAAGTTCTGGAAGCTAGAGATATCCAAGAGCAGCCAGAGGACAGGAAGACCTGGC  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  357  AAAGCCCATCCCCAGCTTCAAAGTTCTGGAAGCTAGAGATATCCAAGAGCAGCCAGAGGACAGGAAGACCTGGC  430

Query  317  TGAGCCAGAGGTCGAAGCTGCGGCAGGAGCTAGAGTCCTTTGGTGATGTAAAGAGGTGGCTGGAGAACAAGCCC  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  431  TGAGCCAGAGGTCGAAGCTGCGGCAGGAGCTAGAGTCCTTTGGTGATGTAAAGAGGTGGCTGGAGAACAAGCCC  504

Query  391  AGCATCACGCCTTCAGAGGCCAAGGTCTTACACATGATCCACGAGGAGCAGAGTGCCCAGCCAAATGCCTCCCA  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  505  AGCATCACGCCTTCAGAGGCCAAGGTCTTACACATGATCCACGAGGAGCAGAGTGCCCAGCCAAATGCCTCCCA  578

Query  465  GGCAACTACCAGGACCACCAGGAAGAAAGCCCCCAGGCTCTCCCGGCTGTCCCGCCAGATGGTGCCCCAGCTCC  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  GGCAACTACCAGGACCACCAGGAAGAAAGCCCCCAGGCTCTCCCGGCTGTCCCGCCAGATGGTGCCCCAGCTCC  652

Query  539  AGCTGCCCGAGCCCCCTGCCCTGTCGGTCATGTACTCCTACCTGCATAGCCGCAAGATCAAGATCCTGGAGATA  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  AGCTGCCCGAGCCCCCTGCCCTGTCGGTCATGTACTCCTACCTGCATAGCCGCAAGATCAAGATCCTGGAGATA  726

Query  613  TTTCACAAGGTGGGCCAGGGTGAGAACCAGAGAATCACCAGGGAGGAGTTCATCGCGGCTGTAAAGGCAGTCGG  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  TTTCACAAGGTGGGCCAGGGTGAGAACCAGAGAATCACCAGGGAGGAGTTCATCGCGGCTGTAAAGGCAGTCGG  800

Query  687  AGTCCCTCTGAAGAACCAAGAGGTGGAGGATATAGTGATCTACCTCAGCTCTCTTGGGAAGCACAACACCATCA  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  AGTCCCTCTGAAGAACCAAGAGGTGGAGGATATAGTGATCTACCTCAGCTCTCTTGGGAAGCACAACACCATCA  874

Query  761  CCATGGATATCCTGGCCAATACCTACAAGCAGTGGTCTATGGCTCAGCAAAGGAGCAGCCTGGCCACTGCAAGG  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  CCATGGATATCCTGGCCAATACCTACAAGCAGTGGTCTATGGCTCAGCAAAGGAGCAGCCTGGCCACTGCAAGG  948

Query  835  GAGCATTATATCTTGGCCAAGCACAGAGATTCCCTGAAGGGTCCGCTCAAGAAGCAGGAGGTGGATTCAGCCCC  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  949  GAGCATTATATCTTGGCCAAGCACAGAGATTCCCTGAAGGGTCCGCTCAAGAAGCAGGAGGTGGATTCAGCCCC  1022

Query  909  ACAGCTTCCCAAAGTGGACCTACTGACGGTGCCTGCAGTCGACACGCAGATGGAGACGCGGCCCATGACCCTGG  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023  ACAGCTTCCCAAAGTGGACCTACTGACGGTGCCTGCAGTCGACACGCAGATGGAGACGCGGCCCATGACCCTGG  1096

Query  983  AGGAGATGGAGGAAGTGGGCAAGCGGTACCGCGAGCGGCAGCGACAGCACAAGCTCACGATCCCCTCCATCCAG  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097  AGGAGATGGAGGAAGTGGGCAAGCGGTACCGCGAGCGGCAGCGACAGCACAAGCTCACGATCCCCTCCATCCAG  1170

Query 1057  TACACGGAGCAATGTCACCTGGTGCGCTGTGGGAATCGGCACTTTGATGAGCACTGCCTCCCGTCCACCATCCA  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171  TACACGGAGCAATGTCACCTGGTGCGCTGTGGGAATCGGCACTTTGATGAGCACTGCCTCCCGTCCACCATCCA  1244

Query 1131  CGGGGATATGAGGGAGCTCATTGACTCGGCCCGCAGGCACAACTTTCTGGTCTACCTGCAATGCTGGAAGCTCT  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245  CGGGGATATGAGGGAGCTCATTGACTCGGCCCGCAGGCACAACTTTCTGGTCTACCTGCAATGCTGGAAGCTCT  1318

Query 1205  GTAAGTCCTATGGCCTCCCGCTGACAGAGGACATCCTCATGAAAGCCTTGCTGTACCCAGGAGACAAGATCATT  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319  GTAAGTCCTATGGCCTCCCGCTGACAGAGGACATCCTCATGAAAGCCTTGCTGTACCCAGGAGACAAGATCATT  1392

Query 1279  TTCCAGATGGACAAAGTGTGCCCCATCCGGCAGCCGGGAGGCTACTACTCTGACTGGAAGGTCTTTTCTCCGAA  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393  TTCCAGATGGACAAAGTGTGCCCCATCCGGCAGCCGGGAGGCTACTACTCTGACTGGAAGGTCTTTTCTCCGAA  1466

Query 1353  TCTGGCTCTGCTCCGGTCCCAGGGCCCTGGCAAGTCTAAGAGGACTGACAAGAAAACGCCAAAGAAAAGCAAGA  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1467  TCTGGCTCTGCTCCGGTCCCAGGGCCCTGGCAAGTCTAAGAGGACTGACAAGAAAACGCCAAAGAAAAGCAAGA  1540

Query 1427  AAATGCGCTTTAAGGAGTTTGAGGAATTTACCAGGAAGCTGAAGGTGAAGAGGTCCAGTGGTCTGCAGCAAACA  1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541  AAATGCGCTTTAAGGAGTTTGAGGAATTTACCAGGAAGCTGAAGGTGAAGAGGTCCAGTGGTCTGCAGCAAACA  1614

Query 1501  CACCCCAATTCCTTCTGGCCGGGTCATCTTCTGGATAAGCTGCAGCTCTACCTGCCCACTGTGGCCACAGACCG  1574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615  CACCCCAATTCCTTCTGGCCGGGTCATCTTCTGGATAAGCTGCAGCTCTACCTGCCCACTGTGGCCACAGACCG  1688

Query 1575  GAGCCTGGCGCTCTTCAGTTGTGTTCAACACCAGCCCCATGTCTACCCAGCCACCTACCACCCTGACCACTGGT  1648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1689  GAGCCTGGCGCTCTTCAGTTGTGTTCAACACCAGCCCCATGTCTACCCAGCCACCTACCACCCTGACCACTGGT  1762

Query 1649  GGCCCCTTAGGAACAAGAACTACATGACCCACGCCCATTATGATGCCGCCAAGGTGTACTACATCAAC  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1763  GGCCCCTTAGGAACAAGAACTACATGACCCACGCCCATTATGATGCCGCCAAGGTGTACTACATCAAC  1830