Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04526
• Subject: NM_001139468.1
• Aligned Length: 1578
• Identities: 1427
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGAGCATAACCAGTGACGAGGTGAACTTTCTGGTTTATCGGTATCTCCAGGAGTCAGGTTTTTCTCACTCGGC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGAGCATAACCAGTGACGAGGTGAACTTTCTGGTGTATCGGTATCTCCAGGAGTCAGGTTTTTCCCACTCGGC  74

Query   75  TTTCACGTTTGGGATCGAGAGCCACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACACTAGTGCCACCGTCTGCCCTCA  148
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct   75  TTTCACGTTTGGGATTGAGAGCCACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACGCTAGTGCCACCGGCCGCCCTCA  148

Query  149  TCTCCATTCTCCAGAAGGGACTGCAGTATGTAGAGGCTGAGATAAGCATCAACAAGGATGGCACAGTGTTCGAC  222
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCCATTCTCCAGAAGGGCCTGCAGTATGTAGAGGCCGAGATCAGTATCAACGAGGATGGCACAGTGTTCGAC  222

Query  223  AGCCGCCCTATAGAGTCCCTGTCCCTGATAGTTGCTGTGATTCCTGATGTGGTGCAGATGCGGCAGCAGGCATT  296
            .|||||||.||||||||||||||.|||||||..||.|||||.||.||.||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  223  GGCCGCCCCATAGAGTCCCTGTCACTGATAGACGCCGTGATGCCCGACGTGGTGCAGACGCGGCAGCAGGCATT  296

Query  297  TGGAGAGAAGCTCACTCAGCAGCAAGCCAGTGCAGCAGCCACAGAGGCATCAGCAATGGCA------AAGGCGG  364
            ..|||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||..|.|.|||..|.||.|.||||      |..||.|
Sbjct  297  CCGAGAGAAGCTCGCTCAGCAGCAAGCCAGTGCGGCGGCGGCGGCGGCTGCGGCCACGGCAGCAGCGACAGCAG  370

Query  365  CAACCATGACCCCAGCTGCTATTTCCCAGCAAAATCCTCCAAAGAACCGAGAGGCCACAGTGAACGGGGAAGAG  438
            |.||||.||||.||||.|...|||||||.||||||||..|.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  371  CCACCACGACCTCAGCCGGCGTTTCCCACCAAAATCCATCGAAGAACAGAGAGGCCACGGTGAATGGGGAAGAG  444

Query  439  AATGGAGCACATGAAATCAATAATCACTCAAAGCCAATGGAAATAGATGGGGATGTTGAGATTCCACCCAACAA  512
            ||..||||||||..|.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||.|||
Sbjct  445  AACAGAGCACATTCAGTCAATAATCACGCGAAGCCAATGGAAATAGATGGAGAGGTTGAGATTCCATCCAGCAA  518

Query  513  AGCCACAGTCCTTCGGGGCCACGAGTCTGAGGTGTTCATTTGTGCCTGGAACCCTGTCAGTGATTTGCTAGCCT  586
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCACAGTCCTTCGGGGCCATGAGTCTGAGGTGTTCATTTGTGCCTGGAATCCTGTCAGTGATTTGCTAGCCT  592

Query  587  CTGGATCTGGAGACTCAACTGCAAGGATATGGAACCTGAATGAGAATAGCAACGGGGGCTCCACCCAGCTCGTG  660
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGGATCTGGAGACTCAACTGCAAGGATATGGAACCTGAATGAGAATAGCAACGGGGGCTCCACCCAGCTCGTG  666

Query  661  TTGAGACATTGTATACGAGAAGGGGGGCACGACGTCCCAAGTAATAAAGATGTCACCTCACTGGACTGGAACAG  734
            |||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|.
Sbjct  667  TTGAGGCACTGTATACGAGAGGGGGGCCATGACGTCCCGAGTAACAAAGACGTCACCTCACTGGACTGGAATAC  740

Query  735  TGATGGAACACTATTGGCTATGGGTTCATATGATGGTTTCGCAAGAATATGGACAGAAAATGGTAACCTGGCCA  808
            ..||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct  741  CAATGGAACACTCTTGGCTACGGGTTCATATGACGGTTTTGCAAGAATATGGACGGAAGATGGTAACCTGGCCA  814

Query  809  GCACCTTAGGCCAACATAAAGGCCCCATCTTCGCTCTGAAATGGAACAAAAAGGGGAATTATGTTTTGAGTGCT  882
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||..||||||||||||..|||||||||||
Sbjct  815  GCACCTTAGGCCAACATAAAGGCCCCATCTTTGCCTTGAAATGGAACCGAAAGGGGAATTACATTTTGAGTGCT  888

Query  883  GGTGTAGACAAAACAACAATAATTTGGGATGCTCACACAGGAGAAGCCAAACAGCAGTTTCCTTTTCATTCAGC  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGTAGACAAAACAACAATAATTTGGGATGCCCACACAGGAGAAGCCAAACAGCAGTTTCCTTTTCATTCAGC  962

Query  957  CCCCGCCCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACATGACCTTTGCCTCCTGTAGCACAGACATGTGTATCCATGTGT  1030
            |||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTGCCCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACACGACCTTTGCCTCCTGTAGCACAGACATGTGTATCCATGTGT  1036

Query 1031  GCAGGCTCGGCTGTGACCACCCAGTCAAAACCTTCCAGGGACACACAAACGAGGTCAATGCCATCAAATGGGAT  1104
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAGGCTCGGCTGTGACCGCCCAGTCAAAACCTTCCAGGGACACACAAACGAGGTCAACGCCATCAAATGGGAT  1110

Query 1105  CCTTCTGGAATGTTGCTGGCGTCCTGCTCGGATGACATGACATTGAAGATCTGGAGTATGAAGCAGGATGCATG  1178
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|..||
Sbjct 1111  CCGTCTGGAATGTTGCTGGCATCCTGCTCGGATGACATGACATTGAAGATCTGGAGCATGAAACAGGAGGTGTG  1184

Query 1179  CGTCCACGATCTTCAGGCTCACAGCAAAGAGATCTACACCATCAAGTGGAGCCCCACCGGGCCTGCCACCAGCA  1252
            |.||||.||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185  CATCCATGATCTTCAGGCTCACAATAAAGAGATCTACACCATCAAGTGGAGCCCCACTGGGCCCGCCACCAGCA  1258

Query 1253  ACCCAAACTCCAGCATCATGTTGGCAAGTGCTTCATTTGATTCTACAGTGCGACTGTGGGATGTGGAGCAAGGT  1326
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|.||.|.|||.
Sbjct 1259  ACCCAAACTCCAACATCATGTTGGCAAGTGCTTCGTTTGATTCTACGGTGCGACTGTGGGACATAGAACGAGGC  1332

Query 1327  GTCTGCACCCACACACTCATGAAGCATCAAGAGCCTGTCTACAGTGTAGCTTTCAGCCCCGATGGAAAGTACTT  1400
            ||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333  GTCTGCACCCACACGCTCACGAAGCATCAGGAGCCTGTCTATAGCGTAGCTTTCAGCCCTGATGGGAAGTACTT  1406

Query 1401  GGCTAGTGGATCCTTTGACAAGTATGTTCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAGTCTCGTCCACAGCTACCAAG  1474
            |||.|||||||||||.|||||||..||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||
Sbjct 1407  GGCCAGTGGATCCTTCGACAAGTGCGTCCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAATCTTGTCCACAGCTACCGAG  1480

Query 1475  GCACTGGCGGTATCTTCGAGGTGTGCTGGAACGCCCGAGGAGATAAAGTGGGCGCCAGCGCGTCTGATGGCTCT  1548
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1481  GCACTGGCGGCATCTTCGAGGTGTGCTGGAACGCCCGAGGAGACAAAGTGGGTGCCAGCGCGTCCGACGGCTCT  1554

Query 1549  GTGTGTGTTCTGGATCTG------  1566
            |||||||||.||||||||      
Sbjct 1555  GTGTGTGTTTTGGATCTGCGGAAG  1578