Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04697
- Subject:
- XM_017027628.1
- Aligned Length:
- 1702
- Identities:
- 1419
- Gaps:
- 269
Alignment
Query 1 ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGC-CGCTCGCAGAGTG------ACCCCAGCG 67
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Sbjct 1 AT----GCGT--------------GGC-----CGTGGCGGGGGGCGCGCCCGC----TGTCCTGCGCCCCTGCG 47
Query 68 TCCTCAC-------CGACTCCTCGGCC----AC-CT-CCTCCGCGGACGCCGGGGAGAAC-----CCAGATGAG 123
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Sbjct 48 --CTCGCTGCTGGGCGCCTTCGGGGCCCGGGACGCTGCCGCCGC---CGCC--CGAGATCCTGCGCAAGATGAG 114
Query 124 ATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTCCTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAG 197
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Sbjct 115 ATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTCCTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAG 188
Query 198 CAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGA 271
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Sbjct 189 CAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGA 262
Query 272 CAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGATGGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAG 345
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Sbjct 263 CAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGATGGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAG 336
Query 346 ATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCAAAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACC 419
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Sbjct 337 ATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCAAAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACC 410
Query 420 CACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACTTCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGG 493
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Sbjct 411 CACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACTTCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGG 484
Query 494 TCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTCAGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGT 567
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Sbjct 485 TCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTCAGCTGCCCACTTGGACGATG----------------------------- 529
Query 568 GAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCCTGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCT 641
Sbjct 530 -------------------------------------------------------------------------- 529
Query 642 GGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAGAGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCAC 715
Sbjct 530 -------------------------------------------------------------------------- 529
Query 716 CCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAAAAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGT 789
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Sbjct 530 ---------------------------------CAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGT 570
Query 790 GCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCT 863
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Sbjct 571 GCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCT 644
Query 864 TCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAA 937
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Sbjct 645 TCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAA 718
Query 938 GAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAG 1011
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Sbjct 719 GAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAG 792
Query 1012 GAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAA 1085
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Sbjct 793 GAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAA 866
Query 1086 CAAGGAGAACCTGATCATAAATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACG 1159
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Sbjct 867 CAAGGAGAACCTGATCATAAATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACG 940
Query 1160 ACTCCATTATTTCTGGAACACTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCA 1233
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Sbjct 941 ACTCCATTATTTCTGGAACACTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCA 1014
Query 1234 AGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCA 1307
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Sbjct 1015 AGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCA 1088
Query 1308 GATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGA 1381
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Sbjct 1089 GATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGA 1162
Query 1382 AACAAAGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAG 1455
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Sbjct 1163 AACAAAGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAG 1236
Query 1456 AGACCCACTGTTGATGAATTAAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGC 1529
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Sbjct 1237 AGACCCACTGTTGATGAATTAAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGC 1310
Query 1530 GCAGGACTATGACAGGAGGGCAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAG 1603
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Sbjct 1311 GCAGGACTATGACAGGAGGGCAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAG 1384
Query 1604 AATTAAATGAGTACAAAAGTAATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1677
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Sbjct 1385 AATTAAATGAGTACAAAAGTAATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1458
