Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04772
- Subject:
- NM_001321677.2
- Aligned Length:
- 1101
- Identities:
- 894
- Gaps:
- 207
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTATAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTATAG 74
Query 75 GAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATATGAAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATATGAAAA 148
Query 149 GGAACTCCCTGACATCCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCTGCACTCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGAACTCCCTGACATCCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCTGCACTCA 222
Query 223 AATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTGACAATGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTGACAATGC 296
Query 297 CTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCAACTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCAACTGC 370
Query 371 AATTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCGTTTGCTAACT 444
||||||||||||||
Sbjct 371 AATTCCTACCTCCA------------------------------------------------------------ 384
Query 445 TTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTATGGTATGTGCC 518
Sbjct 385 -------------------------------------------------------------------------- 384
Query 519 GCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTTTTGCCACTTG 592
|
Sbjct 385 -------------------------------------------------------------------------G 385
Query 593 ATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCCATCTTAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 ATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCCATCTTAT 459
Query 667 CTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGCTTTCCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGCTTTCCTT 533
Query 741 TTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCACGTCCTCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 TTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCACGTCCTCC 607
Query 815 CTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAAGATTTGAACTTTCTGTCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 CTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAAGATTTGAACTTTCTGTCT 681
Query 889 CCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGTGTAGTGAGCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 CCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGTGTAGTGAGCC 755
Query 963 TATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCACCAGTGGAAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 TATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCACCAGTGGAAGA 829
Query 1037 CAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAGT 1101
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 CAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAGT 894