Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04772
- Subject:
- NM_001321678.2
- Aligned Length:
- 1108
- Identities:
- 790
- Gaps:
- 314
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTATAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATATGAAAA 148
|| |||| |||||
Sbjct 1 -----------------------------------AT--GGGA---------------------TATAT----- 11
Query 149 GGAACTC---CCTGACATC----CTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCT 215
|| |.||.|.|| |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 -----TCAGTCATGGCGTCCGAACTTTCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCT 80
Query 216 GCACTCAAATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTG 289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 GCACTCAAATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTG 154
Query 290 ACAATGCCTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAAC 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 ACAATGCCTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAAC 228
Query 364 CAACTGCAATTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCGTTT 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 CAACTGCAATTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCGTTT 302
Query 438 GCTAACTTTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTATGGT 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 GCTAACTTTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTATGGT 376
Query 512 ATGTGCCGCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTTTTG 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 ATGTGCCGCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTTTTG 450
Query 586 CCACTTGATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCC 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 CCACTTGATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCC 524
Query 660 ATCTTATCTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGC 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 ATCTTATCTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGC 598
Query 734 TTTCCTTTTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCAC 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TTTCCTTTTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCAC 672
Query 808 GTCCTCCCTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAAGATTTGAACTT 881
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 GTCCTCCCTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAA----------- 735
Query 882 TCTGTCTCCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGTGTA 955
Sbjct 736 -------------------------------------------------------------------------- 735
Query 956 GTGAGCCTATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCACCAG 1029
Sbjct 736 -------------------------------------------------------------------------- 735
Query 1030 TGGAAGACAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAGT 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 -GGAAGACAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGC----- 801