Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04772
- Subject:
- NM_175124.5
- Aligned Length:
- 1104
- Identities:
- 972
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTATAG 74
|||||.||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCATCCGAAATCTGTAAGACGATCTCTGTGGCCAGGCTTGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTACAG 74
Query 75 GAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATATGAAAA 148
|||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||||||.||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 GAATCTGCACCATTTTCCACTGGAGTTGCTGAAGGATGAGGGGCTGCAGCACCTGGAGAGGCTCTATATGAAAA 148
Query 149 GGAACTCCCTGACATCCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCTGCACTCA 222
||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 149 GGAACTCCCTCACAACCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTGTACCTTCACTCA 222
Query 223 AATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTGACAATGC 296
||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 AATAACATAGTTGTGGTTCCAGAAGCCATCGGGTCCCTCGTGAAACTCCAGTGTCTGGATCTCAGTGACAATGC 296
Query 297 CTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCAACTGC 370
||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297 CTTAGAGATCGTTTGCCCAGAAATCGGTGGTCTGAGAGCGTTGCGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCAGCTAC 370
Query 371 AATTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCGTTTGCTAACT 444
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||.||
Sbjct 371 AGTTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTAGCAATCGCTTGCTAGCT 444
Query 445 TTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTATGGTATGTGCC 518
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|.||||||
Sbjct 445 TTACCCGAGAGGCTTCACCTGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGCAATCGGCTATGCTGTGTGCC 518
Query 519 GCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTTTTGCCACTTG 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||..|||
Sbjct 519 GCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCATCTTGCATCTTTGCCCATTG 592
Query 593 ATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCCATCTTAT 666
||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||.||||.||.||.
Sbjct 593 ATTTAGGTCGCTCCCGAGAACTGCAGTACGTGTATGTGGATAACAACATCCAGCTGAAGGGCCTGCCCTCATAC 666
Query 667 CTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGCTTTCCTT 740
||.|||||.|||||||||||.||||..||||||||....|||||.|||.|.||.|||||||.||||||..|.||
Sbjct 667 CTCTACAACAAAGTCATCGGCTGCAACGGCTGTGGCATCCCCATCCAATTGTCAGAGGTGAGGCTGCTGACATT 740
Query 741 TTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCACGTCCTCC 814
||||||.|||||||..||.||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||.|.|||||.|||||.|
Sbjct 741 TTCATCTGGGCAGCTGACAGTCTTCCTCCCAGCAGAGGTGAAGACAATAGGCACAGAGAAGGATCATGTCCTGC 814
Query 815 CTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCT---GAAAGATTTGAACTTTCTG 885
|||||||.|||.||.|.|||.|..|.||.||.|..|||||||||.| ||| |||||||.||||||||.||
Sbjct 815 CTCTGCAAGAACTGACCATGCGGAGTCTCTACCGCACCTACCACGG---GCTTTGGAAAGATCTGAACTTTTTG 885
Query 886 TCTCCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGTGTAGTGA 959
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 886 TCTCCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTGGAGCTGCTGCACTGCCCCCTGGGGCACTGTCACCTGTGTAGTGA 959
Query 960 GCCTATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCACCAGTGGA 1033
|||.|||||||||.|||||||.||.|||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 960 GCCCATGTTTACCTTCGTCTATCCTAAGATCTTCCCCTTGAGAGAGACGCCGATGGCAGGCCTGCACCAGAGGA 1033
Query 1034 AGACAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAGT 1101
.|||||.|.||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||
Sbjct 1034 GGACAAGTATTGGCTTCGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCGGACTTTTAACCTGCTGTGT 1101