Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04781
- Subject:
- NM_029441.3
- Aligned Length:
- 1526
- Identities:
- 1303
- Gaps:
- 25
Alignment
Query 1 ATGGCTTCTGGGGACCTTTACGAGGTTGAAAGGATTGTAGACAAGAGGAAGAACAAGAAAGGAAAATGGGAGTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCTTCTGGGGACCTTTACGAGGTTGAAAGGATTGTGGACAAGAGGAAGAACAAGAAGGGGAAATGGGAATA 74
Query 75 TCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGGAGCACCGAGGACACGTGGGAGCCGGAGCACCACCTCTTGCACTGTGAGG 148
||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 75 TCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGCAGCACGGAGGACACGTGGGAACCGGAGCATCACCTCCTGCACTGTGAGG 148
Query 149 AGTTTATTGATGAATTCAATGGGTTGCACATGTCCAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTACC 222
|||||||.||.||.|||||.|||.|.|||.||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||.||.|..||
Sbjct 149 AGTTTATCGACGAGTTCAACGGGCTCCACTTGTCCAAGGATAAGAGGGTGAAGTCAGGGAAGCAGGCCGGAGCC 222
Query 223 TCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGGTTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAGAG 296
||||||||.||.||.|||...||.||||.|.|.||.||.|.|||.|||||..|.|||...||.||.||.|||||
Sbjct 223 TCCAAGCTCCTCCGCGACGCCCGCGGCCTGCCAGTGGAAAGACTCTCCCATCGGCCTCTGGAACCCGGGAAGAG 296
Query 297 CAAGGGGACC----TCCCATAAACGGAAGCGAATTAACCCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGC 366
||| ||| |||||.||.||||||||..|.|||.||||||||.|||.|||.||.||.||||.|||.||.
Sbjct 297 CAA----ACCATCTTCCCACAAGCGGAAGCGCGTCAACTCTCCCCTGTCCAGGCCCAAGAAGGGGTCTTCGGGT 366
Query 367 AAGCCCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGTGTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAAT 440
||| .||.|| |||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 367 AAG---GCTCCA------GACAGGGCCACCAAGACTGTGTCCTATAGGACTACCCCCAGTGGCTTACAGATCAT 431
Query 441 GCCCCTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGGACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAA 514
|||||||||.|||.||||||||||..||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||...||||||||||
Sbjct 432 GCCCCTGAAGAAGGCTCAGAACGGCCTGGAGAACGGAGATGCCGGCTCTGAGAAGGACGAGTCACACTTTGGAA 505
Query 515 ATGGGTCCCATCAGCCTGGCT-TGGATTTGAATGATCATGTTGGAGAGCAAGATATGG---GTGAATGTGACGT 584
|.|||||||||||||| ||.| ||||.|||||.||.||..||||||||||.|| || ||||.||.||||.
Sbjct 506 ACGGGTCCCATCAGCC-GGATCTGGAGTTGAACGACCAGCTTGGAGAGCAGGA---GGCCAGTGACTGCGACGG 575
Query 585 GAATCACGCTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCTGACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAG 658
||..|||.|..|.||||.||||||.||..|.|||||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.|
Sbjct 576 GACCCACTCCGCGCTGGTGGAGAATGGAGTTGGCTCTGCTCTGACCAATGGAGGCCTGAACCTGCACAGCCCTG 649
Query 659 TGAAGAGGAAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACAAAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAA 732
||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 650 TGAAGAGGAAGCTGGAGACGGAGAAGGACTATGTCTTTGACAAAAGGCTCAGGTACAGCGTCCGCCAGAATGAA 723
Query 733 AGCAACTGTCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAAGGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGAC 806
|||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 724 AGCAACTGTCGGTTTCGTGACATCGTGGTGAGGAAGGAAGAGGGCTTCACACACATTCTTCTGTCCAGCCAGAC 797
Query 807 CTCGGATAACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGTCCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACG 880
.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 798 TTCGGATAACAATGCACTGACTCCTGAGATCATGAAGGAAGTCCGGCGAGCCCTGTGCAACGCGGCCACAGATG 871
Query 881 ACAGCAAACTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCTGCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGC 954
|||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 872 ACAGCAAGCTACTGCTGCTCAGTGCCGTGGGCAGTGTGTTCTGCAGCGGACTAGACTATTCCTACCTGATCGGC 945
Query 955 CGGTTGTCCAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCAGAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTAT 1028
|||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 946 CGGCTGTCCAGCGACCGGAGAAAGGAGAGCACTCGAATCGCAGAAGCTATCAGGGACTTCGTGAAGGCCTTTAT 1019
Query 1029 CCAGTTTAAGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGCCCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCT 1102
||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1020 CCAGTTTAAGAAACCCATCGTGGTAGCCATTAATGGGCCAGCATTGGGCCTGGGAGCCTCCATCCTGCCCCTCT 1093
Query 1103 GTGACATCGTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGCCCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGC 1176
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1094 GTGACATCGTATGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTTCAGACACCATACGCTACCATCCGACTCACGCCTGCTGGC 1167
Query 1177 TGCTCCTCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTGGCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCT 1250
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1168 TGTTCCTCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGTGTGGCGCTGGCCAATGAAATGCTGTTTTGTGGGCGGAAACT 1241
Query 1251 CACCGCCCAGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGTCTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCA 1324
|||.|||||.|||||.||||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1242 CACTGCCCAAGAGGCATGCAGCCGGGGCCTTGTGTCACAGGTCTTCTGGCCCACGACTTTCAGCCAAGAGGTCA 1315
Query 1325 TGCTGCGGGTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGTTAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTC 1398
||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1316 TGCTGCGGGTGAAGGAGATGGCATCTTGCAGTGCTGTGGTTTTGGAGGAGTCCAAATGCCTGGTCCGAAGCTTC 1389
Query 1399 CTGAAATCAGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTCATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGG 1472
|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1390 CTGAAGTCAGTGCTGGAGGAGGTGAACGAGAAGGAGTGCGTCATGCTGAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAGGG 1463
Query 1473 CCTTGACTCCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGAAGTC 1518
|||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1464 CCTGGACTCCCTGTTCAGCTATCTGCAGGACAAAATCTATGAAGTC 1509