Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04781
• Subject: XM_011522866.1
• Aligned Length: 1632
• Identities: 1504
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCCATTTCATCCTTCCTCCCTGTGGCCTCCACATCTTACAACCCAGCCTGGAGGGAGGGGCCGCGCAGCC  74

Query    1  ----------------------------------------ATGGCTTCTGGGGACCTTTACGAGGTTGAAAGGA  34
                                                    |.||    |||        |.|||||||||||||
Sbjct   75  CCGAGGGGCCAGGTCTCCCAGGCGGCGTCCACTCCCCTCGAGGG----TGG--------AGGAGGTTGAAAGGA  136

Query   35  TTGTAGACAAGAGGAAGAACAAGAAAGGAAAATGGGAGTATCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGGAGCACCGAG  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  137  TTGTAGACAAGAGGAAGAACAAGAAAGGAAAATGGGAGTATCTTATCCGATGGAAAGGCTACGGGAGCACCGAG  210

Query  109  GACACGTGGGAGCCGGAGCACCACCTCTTGCACTGTGAGGAGTTTATTGATGAATTCAATGGGTTGCACATGTC  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211  GACACGTGGGAGCCGGAGCACCACCTCTTGCACTGTGAGGAGTTTATTGATGAATTCAATGGGTTGCACATGTC  284

Query  183  CAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTACCTCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGG  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  CAAGGACAAGAGGATCAAGTCAGGGAAGCAGTCCAGTACCTCCAAGCTGCTGCGTGACAGTCGAGGCCCGTCGG  358

Query  257  TTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAGAGCAAGGGGACCTCCCATAAACGGAAGCGAATTAAC  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  TTGAGAAACTGTCCCACAGACCTTCAGATCCTGGAAAGAGCAAGGGGACCTCCCATAAACGGAAGCGAATTAAC  432

Query  331  CCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGCAAGCCCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGT  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  CCTCCCCTGGCCAAGCCAAAAAAAGGGTATTCAGGCAAGCCCTCTTCAGGAGGTGACAGGGCCACCAAGACGGT  506

Query  405  GTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAATGCCCCTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGG  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  GTCTTACAGGACTACCCCCAGTGGTTTGCAAATAATGCCCCTGAAAAAGTCTCAGAACGGGATGGAAAATGGGG  580

Query  479  ACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAAATGGGTCCCATCAGCCTGGCTTGGATTTGAATGATCAT  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  ACGCCGGCTCTGAGAAGGATGAGAGGCACTTTGGAAATGGGTCCCATCAGCCTGGCTTGGATTTGAATGATCAT  654

Query  553  GTTGGAGAGCAAGATATGGGTGAATGTGACGTGAATCACGCTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCT  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  GTTGGAGAGCAAGATATGGGTGAATGTGACGTGAATCACGCTACACTGGCGGAGAACGGGCTCGGCTCTGCTCT  728

Query  627  GACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAGTGAAGAGGAAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACA  700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  GACCAACGGGGGATTGAACCTGCACAGTCCAGTGAAGAGGAAGCTGGAAGCGGAGAAGGACTACGTCTTTGACA  802

Query  701  AAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAAAGCAACTGTCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAA  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  AAAGGCTCAGATACAGTGTCCGCCAGAATGAAAGCAACTGTCGGTTTCGAGACATCGTTGTGCGGAAGGAAGAA  876

Query  775  GGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGACCTCGGATAACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGT  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  GGGTTCACGCACATCCTGCTGTCCAGTCAGACCTCGGATAACAATGCCCTGACACCTGAGATCATGAAAGAAGT  950

Query  849  CCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACGACAGCAAACTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCT  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  CCGGCGAGCGCTCTGCAACGCAGCCACAGACGACAGCAAACTGCTGCTCCTCAGCGCAGTGGGGAGCGTGTTCT  1024

Query  923  GCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGCCGGTTGTCCAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCA  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  GCAGCGGCCTGGATTATTCCTACCTAATTGGCCGGTTGTCCAGCGACCGGCGAAAGGAGAGCACTCGGATTGCA  1098

Query  997  GAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTATCCAGTTTAAGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGC  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  GAAGCCATCAGGGACTTTGTGAAGGCCTTTATCCAGTTTAAGAAGCCTATCGTGGTGGCCATCAATGGGCCGGC  1172

Query 1071  CCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCTGTGACATCGTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGC  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  CCTGGGCCTGGGTGCCTCCATCCTGCCCCTCTGTGACATCGTGTGGGCCAGTGAGAAGGCCTGGTTCCAGACGC  1246

Query 1145  CCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGCTGCTCCTCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTG  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247  CCTACGCCACCATCCGCCTCACGCCTGCTGGCTGCTCCTCCTACACCTTCCCCCAGATCCTGGGCGTCGCGCTG  1320

Query 1219  GCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCTCACCGCCCAGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGT  1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321  GCCAATGAGATGCTGTTCTGTGGGCGGAAGCTCACCGCCCAGGAGGCCTGCAGCAGGGGGCTGGTGTCGCAGGT  1394

Query 1293  CTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCATGCTGCGGGTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGT  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395  CTTCTGGCCCACCACGTTCAGCCAGGAGGTCATGCTGCGGGTCAAGGAGATGGCATCCTGCAGTGCCGTGGTGT  1468

Query 1367  TAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTCCTGAAATCAGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTC  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469  TAGAGGAGTCCAAATGCCTCGTGCGGAGCTTCCTGAAATCAGTGCTGGAAGACGTGAACGAGAAGGAATGCCTC  1542

Query 1441  ATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGGCCTTGACTCCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGA  1514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543  ATGCTCAAGCAGCTCTGGAGCTCCTCCAAAGGCCTTGACTCCCTTTTCAGCTACCTGCAGGACAAAATTTATGA  1616

Query 1515  AGTC  1518
            ||||
Sbjct 1617  AGTC  1620