Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04817
• Subject: NM_001323912.2
• Aligned Length: 1344
• Identities: 1062
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74

Query   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACT------------------------------------------  106

Query  149  ATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTTCGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCC  222
                                                                                      
Sbjct  107  --------------------------------------------------------------------------  106

Query  223  TTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACATGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGC  296
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct  107  ----------------------------------------------------GGAATGGTGCAGATGTGAATGC  128

Query  297  CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA  202

Query  371  TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC  276

Query  445  AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCC  350

Query  519  TGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  TGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTA  424

Query  593  TTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCTCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCACC  666
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  425  TTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCT-----------------------------------------------  451

Query  667  TCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCTTGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCAA  740
                                                                               |||||||
Sbjct  452  -------------------------------------------------------------------CAGCCAA  458

Query  741  TACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  459  TACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGG  532

Query  815  TCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  533  TCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAG  606

Query  889  CCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  607  CCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGT  680

Query  963  AATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  681  AATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGG  754

Query 1037  AGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  755  AGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAA  828

Query 1111  TACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  829  TACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACA  902

Query 1185  GCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  903  GCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGG  976

Query 1259  AGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTGACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  977  AGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTGACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCA  1050

Query 1333  ACTGTTTCATCT  1344
            ||||||||||||
Sbjct 1051  ACTGTTTCATCT  1062