Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04852
• Subject: NM_001190179.1
• Aligned Length: 978
• Identities: 817
• Gaps: 54

Alignment

Query   1  ATGGCAGCCTTTGCAGTGGAACCTCAGGGGCCCGCGTTAGGATCTGAACCAATGATGCTGGGTTCACCCACATC  74
                                                              ||||||.||||||||||.|||||
Sbjct   1  ---------------------------------------------------ATGATGTTGGGTTCACCTACATC  23

Query  75  TCCAAAGCCAGGAGTTAATGCCCAGTTCTTACCTGGATTTTTAATGGGGGATTTGCCAGCTCCGGTGACTCCAC  148
           |||||||.||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||.|
Sbjct  24  TCCAAAGACAGGCGCTAATGCCCAGTTCTTGCCTGGATTTTTAATGGGGGATCTACCAGCTCCAGTGACTCCGC  97

Query 149  AACCTCGATCAATTAGTGGCCCTTCAGTAGGAGTAATGGAAATGAGATCACCTTTACTTGCAGGTGGGTCACCA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  98  AACCTCGATCAATTAGTGGCCCTTCAGTAGGAGTAATGGAAATGAGATCACCTTTACTAGCAGGGGGCTCCCCA  171

Query 223  CCACAACCAGTTGTACCAGCTCATAAAGATAAAAGTGGCGCTCCACCAGTTAGAAGTATATATGATGACATTTC  296
           |||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 172  CCACAGCCAGTTGTCCCTGCTCATAAAGATAAGAGTGGAGCTCCACCTGTGAGAAGTATCTATGATGACATTTC  245

Query 297  TAGCCCAGGACTTGGATCAACACCTTTAACTTCAAGAAGACAGCCAAACATTTCAGTAATGCAGAGTCCTCTTG  370
           .||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||.|..|||||||||||||||
Sbjct 246  CAGCCCAGGACTTGGATCAACGCCTTTGACTTCAAGAAGACAGGCAAACATTTCATTGTTGCAGAGTCCTCTTG  319

Query 371  TTGGAGTTACATCTACTCCTGGAACAGGGCAAAGTATGTTTAGTCCAGCAAGTATCGGTCAGCCACGAAAGACG  444
           ||||||.||||   |||||||.|.|.||||||||.||||||||||||||||..||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 320  TTGGAGCTACA---ACTCCTGTACCTGGGCAAAGCATGTTTAGTCCAGCAAACATTGGTCAACCACGAAAGACA  390

Query 445  ACATTATCTCCTGCCCAGTTGGATCCTTTTTATACTCAAGGAGATTCTTTGACTTCAGAAGATCACCTCGATGA  518
           |||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 391  ACACTATCTCCTGCCCAACTGGATCCTTTTTATACTCAAGGAGATTCTCTGACTTCAGAAGATCACCTAGATGA  464

Query 519  CTCTTGGGTGACTGTATTTGGGTTTCCTCAAGCATCTGCTTCCTACATATTACTACAATTTGCACAGTATGGGA  592
           |.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||.||||.||||||||.|||||||
Sbjct 465  CACTTGGGTGACTGTGTTTGGGTTTCCACAGGCATCTGCTTCTTATATATTATTACAGTTTGCACAATATGGGA  538

Query 593  ATATCTTAAAACATGTGATGTCTAATACAGGAAATTGGATGCATATTCGTTATCAATCTAAACTGCAGGCTCGG  666
           ||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.|||
Sbjct 539  ATATCTTAAAGCATGTGATGTCTAACACAGGCAACTGGATGCATATTCGTTACCAATCTAAATTGCAAGCCCGG  612

Query 667  AAAGCCTTAAGCAAAGATGGGAGGATTTTTGGAGAATCCATCATGATTGGTGTAAAACCATGTATTGACAAAAG  740
           |||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||.
Sbjct 613  AAAGCCTTAAGCAAAGACGGGAGAATATTTGGAGAATCCATCATGATTGGTGTCAAGCCATGTATAGATAAAAA  686

Query 741  TGTTATGGAAAGCAGTGACAGATGTGCTTTATCATCTCCATCTTTAGCCTTTACACCACCAATCAAAACTCTAG  814
           |||.|||||||.||||||||||.|.|..||.||||||||||||.|||||||||||.||||.||||..|||.|||
Sbjct 687  TGTCATGGAAAACAGTGACAGAGGAGTCTTGTCATCTCCATCTCTAGCCTTTACAACACCCATCAGGACTTTAG  760

Query 815  GTACACCAACACAACCTGGAAGTACTCCTAGGATTTCTACCATGAGACCTCTTGCTACAGCATACAAAGCCTCT  888
           |.||.||||||||..|.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 761  GCACTCCAACACAGTCCGGAAGCACTCCTAGGGTTTCTACCATGAGGCCTCTTGCCACAGCATACAAGGCCTCC  834

Query 889  ACTAGTGATTATCAGGTTATTTCTGACAGACAAACGCCAAAAAAAGATGAAAGTCTTGTATCCAAAGCAATGGA  962
           ||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|.|||.|||||
Sbjct 835  ACTAGTGACTACCAGGTTATTTCTGACAGACAGACACCAAAGAAGGATGAGAGCCTTGTGTCAAGAGCGATGGA  908

Query 963  GTACATGTTTGGCTGG  978
           |||||||||.||.|||
Sbjct 909  GTACATGTTCGGTTGG  924