Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04879
• Subject: NM_028052.4
• Aligned Length: 864
• Identities: 700
• Gaps: 78

Alignment

Query   1  ------------------------------------------------------------------ATGTG---  5
                                                                             .||.|   
Sbjct   1  ATGGACCCTGTGAGCCAGGTGGCCTCTGCGGGCACCTTTCGGGCATTGAAGGAACCCCTTGCCTTCCTGCGAGC  74

Query   6  TATGGTGATATTTGCTCCGCTTTTTGCAATCTTTGCATTTGCAACATGCGGTGGCTATTCTGGAGGCCTGCGGC  79
           |.|||.|.|         ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  75  TCTGGAGTT---------GCTTTTTGCAATGTTTGCATTTGCAACATGTGGTGGCTATTCAGGAGGCCTGCGGC  139

Query  80  TGAGTGTGGACTGCGTCAACAAGACAGAAAGTAACCTCAGCATCGACATAGCGTTTGCCTACCCATTCAGGTTG  153
           |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 140  TGAGTGTGGACTGTGTCAATAAGACAGAAAGTAACCTCAGCATTGACATAGCGTTTGCGTACCCATTCAGGCTG  213

Query 154  CACCAGGTGACGTTTGAGGTGCCCACCTGCGAGGGAAAGGAACGGCAGAAGCTGGCATTGATTGGTGACTCCTC  227
           ||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||.||||||||
Sbjct 214  CAACAGGTGACCTTTGAAGTGCCCACCTGTGAGGGAAAGGAACAGCAGAAGCTGGCATTGGTTGGAGACTCCTC  287

Query 228  GTCTTCAGCAGAGTTCTTCGTCACTGTTGCTGTCTTCGCCTTCCTCTACTCTTTGGCTGCCACTGTCGTTTACA  301
           .||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||
Sbjct 288  ATCCTCAGCAGAATTCTTTGTCACCGTGGCTGTGTTCGCCTTTCTCTACTCCCTGGCTGCCACGGTCGTGTACA  361

Query 302  TTTTCTTCCAGAACAAATACCGGGAAAACAACCGGGGCCCACTCATTGACTTCATTGTCACTGTAGTCTTTTCG  375
           ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 362  TTTTCTTCCAGAACAAGTACCGCGAAAACAACCGGGGCCCACTCATTGACTTTATCGTCACTGTAGTCTTTTCA  435

Query 376  TTCTTGTGGTTGGTGGGTTCATCAGCTTGGGCAAAAGGACTGTCTGACGTCAAAGTTGCAACGGATCCCAAGGA  449
           |||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 436  TTCTTGTGGCTGGTGGGTTCCTCTGCTTGGGCAAAAGGACTGTCTGATGTCAAAGTGGCAACAGATCCCAAAGA  509

Query 450  AGTATTGCTACTAATGTCAGCTTGCAAACAGCCATCCAACAAATGCATGGCTATCCACAGCCCTGTTATGTCAA  523
           |||..||.|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||.|
Sbjct 510  AGTCCTGTTGCTGATGTCAGCTTGCAAGCAGCCTTCCAACAAGTGCATGGCTGTCCACAGCCCTGTCATGTCCA  583

Query 524  GCTTAAACACTTCTGTGGTCTTTGGATTCTTGAACTTTATTCTCTGGGCTGGAAACATATGGTTTGTTTTCAAG  597
           ||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 584  GCTTAAACACATCTGTGGTCTTCGGGTTTTTGAATTTTATCCTCTGGGCTGGAAACATTTGGTTTGTTTTCAAG  657

Query 598  GAGACCGGCTGGCATTCTTCGGGACAGAGATATCTTTCAGATCCAATGGAGAAGCACTCCAGCAGCTATAATCA  671
           |||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 658  GAGACTGGCTGGCATTCCTCTGGACAGAGATACCTTTCAGACCCCATGGAGAAGCACTCCAGCAGCTACAATCA  731

Query 672  AGGTGGTTACAACCAAGACAGCTATGGATCAAGCAGTGGGTACAGTCAGCAGGCGAGTTTGGGGCCAACCTCAG  745
           |||..|.|||||||||||.||.|||||.|||||..||||||||||.||||||||||.|.||||||||||.||.|
Sbjct 732  AGGACGCTACAACCAAGAGAGTTATGGGTCAAGTGGTGGGTACAGCCAGCAGGCGAATCTGGGGCCAACTTCCG  805

Query 746  ATGAGTTTGGCCAACAGCCTACTGGCCCCACTTCCTTTACCAATCAGATT  795
           |||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 806  ATGAGTTTGGCCAACAGCCTAGTGGTCCCACTTCCTTTAACAATCAGATA  855