Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04879
- Subject:
- XM_017005731.1
- Aligned Length:
- 904
- Identities:
- 789
- Gaps:
- 110
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAAACAAAGAAACTCATCCAAAGTTTCTCTGCAAATACATGTTACAAAGAGTGTTACACTGCGCCTTTAAG 74
Query 1 -----------------AT--GTGTA----TGG---TGATATTTGCTC---------CGCTTTTTGCAATCTTT 39
|| .|||| ||| ||..|.|| ||| .||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAAACTTTCCTTCATCATTCCTGTAAGCGTGGACATGCAACTT-CTCTCACCACAAAGCTTTTTGCAATCTTT 147
Query 40 GCATTTGCAACATGCGGTGGCTATTCTGGAGGCCTGCGGCTGAGTGTGGACTGCGTCAACAAGACAGAAAGTAA 113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 GCATTTGCAACATGCGGTGGCTATTCTGGAGGCCTGCGGCTGAGTGTGGACTGCGTCAACAAGACAGAAAGTAA 221
Query 114 CCTCAGCATCGACATAGCGTTTGCCTACCCATTCAGGTTGCACCAGGTGACGTTTGAGGTGCCCACCTGCGAGG 187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 CCTCAGCATCGACATAGCGTTTGCCTACCCATTCAGGTTGCACCAGGTGACGTTTGAGGTGCCCACCTGCGAGG 295
Query 188 GAAAGGAACGGCAGAAGCTGGCATTGATTGGTGACTCCTCGTCTTCAGCAGAGTTCTTCGTCACTGTTGCTGTC 261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 GAAAGGAACGGCAGAAGCTGGCATTGATTGGTGACTCCTCGTCTTCAGCAGAGTTCTTCGTCACTGTTGCTGTC 369
Query 262 TTCGCCTTCCTCTACTCTTTGGCTGCCACTGTCGTTTACATTTTCTTCCAGAACAAATACCGGGAAAACAACCG 335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 TTCGCCTTCCTCTACTCTTTGGCTGCCACTGTCGTTTACATTTTCTTCCAGAACAAATACCGGGAAAACAACCG 443
Query 336 GGGCCCACTCATTGACTTCATTGTCACTGTAGTCTTTTCGTTCTTGTGGTTGGTGGGTTCATCAGCTTGGGCAA 409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GGGCCCACTCATTGACTTCATTGTCACTGTAGTCTTTTCGTTCTTGTGGTTGGTGGGTTCATCAGCTTGGGCAA 517
Query 410 AAGGACTGTCTGACGTCAAAGTTGCAACGGATCCCAAGGAAGTATTGCTACTAATGTCAGCTTGCAAACAGCCA 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 AAGGACTGTCTGACGTCAAAGTTGCAACGGATCCCAAGGAAGTATTGCTACTAATGTCAGCTTGCAAACAGCCA 591
Query 484 TCCAACAAATGCATGGCTATCCACAGCCCTGTTATGTCAAGCTTAAACACTTCTGTGGTCTTTGGATTCTTGAA 557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TCCAACAAATGCATGGCTATCCACAGCCCTGTTATGTCAAGCTTAAACACTTCTGTGGTCTTTGGATTCTTGAA 665
Query 558 CTTTATTCTCTGGGCTGGAAACATATGGTTTGTTTTCAAGGAGACCGGCTGGCATTCTTCGGGACAGAGATATC 631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 CTTTATTCTCTGGGCTGGAAACATATGGTTTGTTTTCAAGGAGACCGGCTGGCATTCTTCGGGACAGAGATATC 739
Query 632 TTTCAGATCCAATGGAGAAGCACTCCAGCAGCTATAATCAAGGTGGTTACAACCAAGACAGCTATGGATCAAGC 705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 TTTCAGATCCAATGGAGAAGCACTCCAGCAGCTATAATCAAGGTGGTTACAACCAAGACAGCTATGGATCAAGC 813
Query 706 AGTGGGTACAGTCAGCAGGCGAGTTTGGGGCCAACCTCAGATGAGTTTGGCCAACAGCCTACTGGCCCCACTTC 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AGTGGGTACAGTCAGCAGGCGAGTTTGGGGCCAACCTCAGATGAGTTTGGCCAACAGCCTACTGGCCCCACTTC 887
Query 780 CTTTACCAATCAGATT 795
||||||||||||||||
Sbjct 888 CTTTACCAATCAGATT 903