Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04908
• Subject: NM_023729.3
• Aligned Length: 1427
• Identities: 1226
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGAGCGCGCTGCGAGGCCTGCCAGTGGCTGGCGGAGGCGAGAGTAGCGAGAGCGAGGATGATGGCTG  74
            |||||.|||.||.|.|||.|.|||.||.||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCAGCGGGCACACTGAGGGGCTTGGCAGTGGCTGGTGGAGGCGAGAGCAGCGATAGTGAGGATGACGGCTG  74

Query   75  GGAGATTGGGTATCTCGACCGGACGTCTCAGAAATTGAAAAGG-CTATTACCCATTGAAGAAAAGAAAGAAAAA  147
            |||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||| || ||||||.|||||||.|||||.||.|.|
Sbjct   75  GGATATTGGGTATCTCGACCGGTCCTCTCAGAAATTAAAAAGGTCT-TTACCCGTTGAAGAGAAGAACGAGACA  147

Query  148  TTTAAGAAAGCAATGACCATCGGAGATGTTTCATTGGTCCAGGAGCTCCTAGATTCTGGCATTAGTGTAGATTC  221
            ||||||||||||.||||||.|||||||.||||.||.||..|.||.|||||.|||||||||||||.|||.||.||
Sbjct  148  TTTAAGAAAGCACTGACCACCGGAGATATTTCTTTAGTTAAAGAACTCCTGGATTCTGGCATTAATGTGGACTC  221

Query  222  CAACTTTCAGTATGGATGGACTCCCCTTATGTATGCTGCTAGTGTTGCCAATGCAGAGCTGGTTCGGGTCCTTT  295
            ||.|||.|..|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct  222  CAGCTTCCGCTATGGATGGACCCCTCTTATGTATGCCGCTAGTGTGGCCAATGCAGAGCTGGTTCGCTTCCTTT  295

Query  296  TGGACAGAGGTGCTAATGCAAGCTTTGAGAAGGATAAGCAAAGTATTTTGATAACTGCATGTTCTGCTCATGGC  369
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||..||..||||||||||.|||.||||||||||.||||
Sbjct  296  TGGACAGAGGTGCTAATGCCAGCTTTGATAAGGACAAGTTAACCATTTTGATAAGTGCTTGTTCTGCTCGTGGC  369

Query  370  TCAGAGGAACAGATCTTGAAGTGTGTAGAACTACTACTTTCAAGAAATGCTGATCCAAATGTTGCTTGTAGGAG  443
            ||||||||.||..|||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.||.||||||..||||||||||||
Sbjct  370  TCAGAGGAGCAAGTCTTGAAATGTGTAGAGTTACTACTTTCAAGAAATGCGGACCCAAATACTGCTTGTAGGAG  443

Query  444  ACTTATGACCCCAATCATGTATGCTGCTCGAGATGGTCACACCCAGGTTGTTGCTCTCCTTGTTGCTCATGGAG  517
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  444  ACTTATGACGCCAATCATGTATGCTGCCCGAGACGGTCATACTCAGGTTGTGGCTCTGCTTGTGGCTCACGGAG  517

Query  518  CAGAAGTTAATACCCAGGATGAGAATGGTTACACTGCTTTAACGTGGGCAGCACGTCAGGGTCATAAAAATATA  591
            |.||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct  518  CCGAAGTTAACGCCCAGGATGAGAATGGTTATACTGCCTTAACATGGGCAGCACGGCAGGGTCATAAAAATGTA  591

Query  592  GTTTTGAAGTTGCTTGAACTTGGAGCTAATAAAATGCTACAAACCAAAGATGGAAAGATGCCAAGTGAGATTGC  665
            .||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|..|..|||||.||||||||
Sbjct  592  ATTCTGAAGTTGCTTGAACTGGGAGCTAATAAAATGCTACAGACCAAAGATGGCAGAACACCAAGCGAGATTGC  665

Query  666  AAAAAGAAACAAACATCATGAGATCTTCAACTTACTTTCTTTTACTTTAAATCCATTGGAAGGAAAACTTCAAC  739
            |||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  666  AAAAAGAAATAAACATCTTGAGATCTTCAACTTTCTTTCTCTGACTCTAAATCCATTGGAAGGAAAACTTCAGC  739

Query  740  AGCTAACTAAAGAAGACACTATTTGTAAAATATTGACAACAGATTCTGATAGAGAAAAAGATCACATTTTTAGT  813
            |||||||.||||||||.||.|||||||||.|.|||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.
Sbjct  740  AGCTAACCAAAGAAGAGACCATTTGTAAACTGTTGGCCACAGATTCTGATAAAGAAAAAGATCACATATTTAGC  813

Query  814  TCATATACAGCATTTGGAGATCTGGAAGTATTTTTACATGGTCTTGGACTTGAACATATGACAGATTTACTAAA  887
            .|.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|.||||
Sbjct  814  CCGTATACAGCGTTTGGAGATCTGGAAATATTTTTACATGGCCTTGGACTTGAACATATGACAGACTCATTAAA  887

Query  888  GGAAAGGGATATAACGTTAAGACATCTTTTGACCATGAGGGAAGATGAATTTACAAAGAATGGAATTACCAGTA  961
            |||||.|||||||||.||||||||.|||.|||||||||.|.||||.||..|||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  888  GGAAAAGGATATAACTTTAAGACACCTTCTGACCATGAAGAAAGACGAGCTTACAAAGAATGGAATTGCTAGTA  961

Query  962  AAGACCAGCAGAAAATTCTGGCTGCTCTTAAAGAACTACAGGTAGAAGAGATACAATTTGGAGAGCTATCTGAA  1035
            ||||.||.||||||||..|||||||||||||.||||||.|.||||||||||||.|.||||||.|..||.|||||
Sbjct  962  AAGATCAACAGAAAATCTTGGCTGCTCTTAAGGAACTAGAAGTAGAAGAGATAAATTTTGGAAAATTACCTGAA  1035

Query 1036  GAGACAAAGTTGGAAATCAGTGGTGATGAGTTCCTCAACTTTCTTCTCAAATTAAATAAACAGTGTGGCCATTT  1109
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1036  GTGACAAAGTTGGAAATCAGTGGTGATGAGTTCCTCAACTTTCTTTTGAAATTAAATAAGCAGTGTGGCCATTT  1109

Query 1110  AATAACAGCTGTACAGAATGTTATTACTGAGTTACCTGTAAATTCTCAAAAGATAACACTGGAATGGGCTTCTC  1183
            |||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||..||||||.||||||||| 
Sbjct 1110  AATCACAGCTGTGCAGAATATCATTACCGAGTTGCCTGTAAATTCTCACAAGATAGTACTGGAGTGGGCTTCT-  1182

Query 1184  CCCAG-AATTTTACTTCAGTTTGTGAAGAATTGGTTAATAATGTTGAAGATTTGAGTGAAAAGGTCTGCAAACT  1256
            ||||| ||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.|||||||||.|||
Sbjct 1183  CCCAGAAATTTTACTTCAGTTTGTGAAGAACTGGTTAGTAATGTTGAAGATTTGAATGAAGAGGTCTGCAGACT  1256

Query 1257  AAAAGACCTAATTCAAAAGTTGCAAAATGAACGGGAAAATGATCCAACTCATATACAATTAAGGGAAGAAGTAT  1330
            .||.||..|.|||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|.|.||...|||||.||.|
Sbjct 1257  GAAGGAGTTGATTCAGAAGATGCAGAATGAGCGGGAAAATGACCCAACTCATATCCCACTAGTAGAAGAGGTCT  1330

Query 1331  CTACATGGAATAGTAGAATTTTGAAGAGGACAGCTATTACCATATGCGGATTCGGTTTTCTTCTTTTCATTTGC  1404
            ||||||||||.|.|.|||||.||||||||.||||..||||..|.||.||||||||..|.||.||||||||..||
Sbjct 1331  CTACATGGAAGACTCGAATTCTGAAGAGGTCAGCAGTTACAGTGTGTGGATTCGGGCTGCTGCTTTTCATCGGC  1404

Query 1405  AAGCTAACTTTCCAGAGGAAA  1425
            |||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1405  AAGCTAACTTTGCAGAGAAAA  1425