Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04914
• Subject: NM_001287244.1
• Aligned Length: 881
• Identities: 644
• Gaps: 235

Alignment

Query   1  ATGACTGGCAAAACACAGACCAGCAACGTCACCAATAAGAATGACCCCAAGTCCATCAACTCCCGTGTTTTCAT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CGGCAATCTAAATACGGCAATTGTCAAGAAAGTTGACATTGAAGCCATTTTTTCAAAGTATGGAAAAATAGTTG  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  GATGTTCCGTTCACAAAGGTTATGCATTTGTACAGTACATGAGTGAGCGACATG--CAAGAGCTGCAGTGGCTG  220
                                                 ||||       .||||  |||||||           
Sbjct   1  --------------------------------------ATGA-------CCATGTACAAGAGC-----------  18

Query 221  GAGAAAATGC------CAGAGTCATCGCCGGCCAACCACTTGATATCAACATGGCAGGAGAGCCCAAACCATAC  288
               |||.||      |||||  ||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  19  ----AAACGCAGACATCAGAG--AT-----------------ATATCAACATGGCAGGAGAGCCCAAACCATAC  69

Query 289  AGACCAAAACCTGGAAACAAGAGGCCCCTTTCTGCACTTTACAGACTTGAATCAAAGGAACCTTTCCTGTCTGT  362
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  70  AGACCAAAACCTGGAAACAAGAGGCCCCTTTCTGCACTTTACAGACTTGAATCAAAGGAACCTTTCCTGTCTGT  143

Query 363  TGGCGGTTATGTCTTTGACTATGATTACTACAGAGATGATTTCTACAATCGGTTATTTGATTACCACGGGCGTG  436
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144  TGGCGGTTATGTCTTTGACTATGATTACTACAGAGATGATTTCTACAATCGGTTATTTGATTACCACGGGCGTG  217

Query 437  TGCCTCCACCTCCCCGTGCAGTAATTCCGCTGAAGCGTCCCAGAGTGGCAGTCACAACGACTCGCAGGGGGAAA  510
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218  TGCCTCCACCTCCCCGTGCAGTAATTCCGCTGAAGCGTCCCAGAGTGGCAGTCACAACGACTCGCAGGGGGAAA  291

Query 511  GGAGTCTTTTCCATGAAAGGTGGATCGAGATCTACTGCCAGTGGGTCAACAGGTTCTAAATTGAAATCAGATGA  584
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292  GGAGTCTTTTCCATGAAAGGTGGATCGAGATCTACTGCCAGTGGGTCAACAGGTTCTAAATTGAAATCAGATGA  365

Query 585  GTTACAGACCATCAAGAAAGAATTAACCCAGATCAAAACTAAAATTGACTCCTTGCTAGGGCGCCTGGAGAAGA  658
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366  GTTACAGACCATCAAGAAAGAATTAACCCAGATCAAAACTAAAATTGACTCCTTGCTAGGGCGCCTGGAGAAGA  439

Query 659  TTGAGAAACAGCAGAAGGCGGAGGCAGAAGCTCAGAAGAAGCAATTGGAAGAGAGTCTAGTGCTGATCCAAGAG  732
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440  TTGAGAAACAGCAGAAGGCGGAGGCAGAAGCTCAGAAGAAGCAATTGGAAGAGAGTCTAGTGCTGATCCAAGAG  513

Query 733  GAATGTGTGTCAGAGATTGCAGATCACTCTACAGAGGAGCCTGCTGAAGGAGGGCCAGATGCCGATGGAGAAGA  806
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514  GAATGTGTGTCAGAGATTGCAGATCACTCTACAGAGGAGCCTGCTGAAGGAGGGCCAGATGCCGATGGAGAAGA  587

Query 807  GATGACAGATGGGATAGAGGAGGACTTCGATGAAGATGGGGGTCATGAGCTGTTTCTACAGATAAAG  873
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588  GATGACAGATGGGATAGAGGAGGACTTCGATGAAGATGGGGGTCATGAGCTGTTTCTACAGATAAAG  654