Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04968
- Subject:
- NM_001144881.2
- Aligned Length:
- 2493
- Identities:
- 2493
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGCCTTTGGAGATGGAGCCCAAGATGAGCAAACTGGCCTTTGGCTGTCAGAGAAGTTCCACATCAGATGATGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTTTGGAGATGGAGCCCAAGATGAGCAAACTGGCCTTTGGCTGTCAGAGAAGTTCCACATCAGATGATGA 74
Query 75 CTCTGGCTGTGCATTGGAGGAGTACGCCTGGGTCCCCCCGGGCCTGAGACCAGAGCAGATCCAGCTCTATTTTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCTGGCTGTGCATTGGAGGAGTACGCCTGGGTCCCCCCGGGCCTGAGACCAGAGCAGATCCAGCTCTATTTTG 148
Query 149 CTTGCTTACCAGAGGAAAAAGTTCCTTACGTTAACAGCCCCGGAGAGAAGCATCGGATTAAACAGCTTTTGTAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTTGCTTACCAGAGGAAAAAGTTCCTTACGTTAACAGCCCCGGAGAGAAGCATCGGATTAAACAGCTTTTGTAC 222
Query 223 CAGTTACCACCACATGATAATGAGGTACGGTATTGCCAGTCTTTGAGTGAAGAGGAGAAAAAAGAGTTGCAGGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGTTACCACCACATGATAATGAGGTACGGTATTGCCAGTCTTTGAGTGAAGAGGAGAAAAAAGAGTTGCAGGT 296
Query 297 GTTCAGTGCTCAGCGGAAGAAAGAAGCACTGGGAAGAGGAACAATTAAGCTTCTGTCCAGAGCAGTCATGCATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTTCAGTGCTCAGCGGAAGAAAGAAGCACTGGGAAGAGGAACAATTAAGCTTCTGTCCAGAGCAGTCATGCATG 370
Query 371 CTGTGTGTGAGCAGTGTGGTTTGAAGATAAATGGAGGTGAAGTTGCAGTGTTCGCCTCCCGTGCGGGCCCTGGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGTGTGTGAGCAGTGTGGTTTGAAGATAAATGGAGGTGAAGTTGCAGTGTTCGCCTCCCGTGCGGGCCCTGGT 444
Query 445 GTGTGCTGGCACCCATCCTGTTTTGTCTGTTTCACGTGTAATGAGCTGCTGGTCGACCTCATCTATTTTTATCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGTGCTGGCACCCATCCTGTTTTGTCTGTTTCACGTGTAATGAGCTGCTGGTCGACCTCATCTATTTTTATCA 518
Query 519 GGATGGAAAAATTCACTGTGGCAGGCACCATGCAGAACTGCTCAAACCACGGTGCTCAGCATGTGACGAGATAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGATGGAAAAATTCACTGTGGCAGGCACCATGCAGAACTGCTCAAACCACGGTGCTCAGCATGTGACGAGATAA 592
Query 593 TTTTTGCTGATGAGTGCACAGAAGCTGAGGGTCGCCATTGGCACATGAAACACTTCTGCTGCCTTGAGTGTGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTTTGCTGATGAGTGCACAGAAGCTGAGGGTCGCCATTGGCACATGAAACACTTCTGCTGCCTTGAGTGTGAA 666
Query 667 ACGGTCCTGGGAGGACAGAGGTATATCATGAAGGACGGCCGCCCCTTCTGCTGTGGCTGTTTTGAGTCTCTCTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACGGTCCTGGGAGGACAGAGGTATATCATGAAGGACGGCCGCCCCTTCTGCTGTGGCTGTTTTGAGTCTCTCTA 740
Query 741 TGCGGAGTACTGTGAAACCTGTGGGGAACATATTGGTGTGGACCATGCACAGATGACCTATGACGGGCAGCACT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCGGAGTACTGTGAAACCTGTGGGGAACATATTGGTGTGGACCATGCACAGATGACCTATGACGGGCAGCACT 814
Query 815 GGCACGCCACGGAAGCCTGCTTTTCTTGTGCCCAGTGTAAAGCCTCTTTGTTGGGATGTCCCTTCCTTCCCAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGCACGCCACGGAAGCCTGCTTTTCTTGTGCCCAGTGTAAAGCCTCTTTGTTGGGATGTCCCTTCCTTCCCAAA 888
Query 889 CAGGGTCAGATTTACTGCTCAAAAACGTGCAGTCTTGGTGAAGACGTCCATGCCTCTGATTCTTCCGACTCTGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAGGGTCAGATTTACTGCTCAAAAACGTGCAGTCTTGGTGAAGACGTCCATGCCTCTGATTCTTCCGACTCTGC 962
Query 963 ATTTCAGTCAGCTCGATCAAGAGACTCCCGAAGAAGTGTCCGAATGGGCAAGAGCAGCCGGTCAGCAGATCAGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTTCAGTCAGCTCGATCAAGAGACTCCCGAAGAAGTGTCCGAATGGGCAAGAGCAGCCGGTCAGCAGATCAGT 1036
Query 1037 GTAGACAGTCTCTCCTCTTATCGCCTGCTCTGAACTACAAGTTTCCTGGCCTCTCAGGCAATGCTGATGACACC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTAGACAGTCTCTCCTCTTATCGCCTGCTCTGAACTACAAGTTTCCTGGCCTCTCAGGCAATGCTGATGACACC 1110
Query 1111 CTTTCTCGAAAATTGGATGATCTGAGTCTCTCCAGACAAGGAACAAGTTTTGCCAGTGAAGAATTTTGGAAAGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTTTCTCGAAAATTGGATGATCTGAGTCTCTCCAGACAAGGAACAAGTTTTGCCAGTGAAGAATTTTGGAAAGG 1184
Query 1185 CAGAGTAGAGCAGGAAACTCCAGAAGACCCTGAAGAATGGGCTGATCATGAAGATTATATGACGCAGCTCCTCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGAGTAGAGCAGGAAACTCCAGAAGACCCTGAAGAATGGGCTGATCATGAAGATTATATGACGCAGCTCCTCC 1258
Query 1259 TCAAGTTTGGTGATAAAAGCCTCTTTCAGCCACAGCCCAATGAGATGGATATTCGAGCCAGTGAGCACTGGATA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCAAGTTTGGTGATAAAAGCCTCTTTCAGCCACAGCCCAATGAGATGGATATTCGAGCCAGTGAGCACTGGATA 1332
Query 1333 TCTGATAACATGGTTAAAAGTAAGACCGAGTTAAAGCAAAATAACCAGAGCCTTGCAAGTAAAAAATACCAGTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCTGATAACATGGTTAAAAGTAAGACCGAGTTAAAGCAAAATAACCAGAGCCTTGCAAGTAAAAAATACCAGTC 1406
Query 1407 TGATATGTACTGGGCACAGTCACAAGATGGACTGGGCGATTCTGCTTATGGCAGCCACCCAGGCCCTGCAAGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGATATGTACTGGGCACAGTCACAAGATGGACTGGGCGATTCTGCTTATGGCAGCCACCCAGGCCCTGCAAGCA 1480
Query 1481 GTAGAAGGCTTCAGGAATTGGAACTGGACCATGGGGCTTCAGGGTATAATCATGATGAAACACAGTGGTATGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GTAGAAGGCTTCAGGAATTGGAACTGGACCATGGGGCTTCAGGGTATAATCATGATGAAACACAGTGGTATGAA 1554
Query 1555 GATTCCCTGGAGTGTCTGTCAGACCTGAAACCAGAGCAAAGTGTTCGGGATTCGATGGATTCTTTGGCATTGTC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GATTCCCTGGAGTGTCTGTCAGACCTGAAACCAGAGCAAAGTGTTCGGGATTCGATGGATTCTTTGGCATTGTC 1628
Query 1629 CAATATCACAGGGGCTTCGGTGGATGGAGAAAACAAGCCAAGGCCATCATTGTATTCTCTGCAAAATTTTGAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAATATCACAGGGGCTTCGGTGGATGGAGAAAACAAGCCAAGGCCATCATTGTATTCTCTGCAAAATTTTGAGG 1702
Query 1703 AGATGGAAACAGAAGATTGTGAGAAGATGAGCAATATGGGAACTTTGAACTCTTCCATGCTGCACAGGAGTGCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGATGGAAACAGAAGATTGTGAGAAGATGAGCAATATGGGAACTTTGAACTCTTCCATGCTGCACAGGAGTGCA 1776
Query 1777 GAGTCCTTAAAGAGTCTAAGTTCAGAGTTGTGTCCAGAGAAAATCCTGCCTGAAGAGAAGCCAGTACATCTGCC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAGTCCTTAAAGAGTCTAAGTTCAGAGTTGTGTCCAGAGAAAATCCTGCCTGAAGAGAAGCCAGTACATCTGCC 1850
Query 1851 AGTGCTCAGAAGGTCCAAGTCTCAATCCAGACCCCAGCAGGTCAAGTTTTCTGATGATGTCATTGACAATGGGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGTGCTCAGAAGGTCCAAGTCTCAATCCAGACCCCAGCAGGTCAAGTTTTCTGATGATGTCATTGACAATGGGA 1924
Query 1925 ACTATGACATTGAAATCCGGCAGCCTCCGATGAGTGAAAGGACTCGGAGACGCGTCTACAATTTTGAAGAGAGG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACTATGACATTGAAATCCGGCAGCCTCCGATGAGTGAAAGGACTCGGAGACGCGTCTACAATTTTGAAGAGAGG 1998
Query 1999 GGATCCAGGTCTCATCACCACCGCCGCCGGAGAAGTAGAAAGTCCCGCTCCGACAATGCCCTGAATCTTGTTAC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GGATCCAGGTCTCATCACCACCGCCGCCGGAGAAGTAGAAAGTCCCGCTCCGACAATGCCCTGAATCTTGTTAC 2072
Query 2073 AGAAAGAAAATACTCTCCCAAGGACAGACTGCGGCTGTACACCCCCGATAACTATGAGAAATTTATACAGAATA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGAAAGAAAATACTCTCCCAAGGACAGACTGCGGCTGTACACCCCCGATAACTATGAGAAATTTATACAGAATA 2146
Query 2147 AAAGTGCCCGGGAGATCCAAGCATACATCCAGAATGCTGATCTCTACGGACAGTACGCCCATGCCACTTCCGAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AAAGTGCCCGGGAGATCCAAGCATACATCCAGAATGCTGATCTCTACGGACAGTACGCCCATGCCACTTCCGAT 2220
Query 2221 TATGGCCTGCAGAACCCAGGAATGAATCGGTTTCTGGGACTCTACGGCGAGGATGATGATTCCTGGTGTTCTTC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TATGGCCTGCAGAACCCAGGAATGAATCGGTTTCTGGGACTCTACGGCGAGGATGATGATTCCTGGTGTTCTTC 2294
Query 2295 CTCCTCCTCCTCTTCCGACTCGGAAGAAGAAGGATATTTTCTTGGACAACCAATCCCTCAACCCCGGCCACAGA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTCCTCCTCCTCTTCCGACTCGGAAGAAGAAGGATATTTTCTTGGACAACCAATCCCTCAACCCCGGCCACAGA 2368
Query 2369 GATTTGCCTACTATACAGATGACCTTTCTAGTCCACCATCTGCACTTCCCACCCCTCAGTTTGGTCAGAGGACA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GATTTGCCTACTATACAGATGACCTTTCTAGTCCACCATCTGCACTTCCCACCCCTCAGTTTGGTCAGAGGACA 2442
Query 2443 ACAAAATCCAAGAAGAAAAAGGGACACAAGGGCAAAAATTGTATTATTTCT 2493
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACAAAATCCAAGAAGAAAAAGGGACACAAGGGCAAAAATTGTATTATTTCT 2493