Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04968
• Subject: NM_001144882.2
• Aligned Length: 2493
• Identities: 2493
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCTTTGGAGATGGAGCCCAAGATGAGCAAACTGGCCTTTGGCTGTCAGAGAAGTTCCACATCAGATGATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTTGGAGATGGAGCCCAAGATGAGCAAACTGGCCTTTGGCTGTCAGAGAAGTTCCACATCAGATGATGA  74

Query   75  CTCTGGCTGTGCATTGGAGGAGTACGCCTGGGTCCCCCCGGGCCTGAGACCAGAGCAGATCCAGCTCTATTTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGGCTGTGCATTGGAGGAGTACGCCTGGGTCCCCCCGGGCCTGAGACCAGAGCAGATCCAGCTCTATTTTG  148

Query  149  CTTGCTTACCAGAGGAAAAAGTTCCTTACGTTAACAGCCCCGGAGAGAAGCATCGGATTAAACAGCTTTTGTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTGCTTACCAGAGGAAAAAGTTCCTTACGTTAACAGCCCCGGAGAGAAGCATCGGATTAAACAGCTTTTGTAC  222

Query  223  CAGTTACCACCACATGATAATGAGGTACGGTATTGCCAGTCTTTGAGTGAAGAGGAGAAAAAAGAGTTGCAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTTACCACCACATGATAATGAGGTACGGTATTGCCAGTCTTTGAGTGAAGAGGAGAAAAAAGAGTTGCAGGT  296

Query  297  GTTCAGTGCTCAGCGGAAGAAAGAAGCACTGGGAAGAGGAACAATTAAGCTTCTGTCCAGAGCAGTCATGCATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTCAGTGCTCAGCGGAAGAAAGAAGCACTGGGAAGAGGAACAATTAAGCTTCTGTCCAGAGCAGTCATGCATG  370

Query  371  CTGTGTGTGAGCAGTGTGGTTTGAAGATAAATGGAGGTGAAGTTGCAGTGTTCGCCTCCCGTGCGGGCCCTGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGTGTGTGAGCAGTGTGGTTTGAAGATAAATGGAGGTGAAGTTGCAGTGTTCGCCTCCCGTGCGGGCCCTGGT  444

Query  445  GTGTGCTGGCACCCATCCTGTTTTGTCTGTTTCACGTGTAATGAGCTGCTGGTCGACCTCATCTATTTTTATCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGTGCTGGCACCCATCCTGTTTTGTCTGTTTCACGTGTAATGAGCTGCTGGTCGACCTCATCTATTTTTATCA  518

Query  519  GGATGGAAAAATTCACTGTGGCAGGCACCATGCAGAACTGCTCAAACCACGGTGCTCAGCATGTGACGAGATAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATGGAAAAATTCACTGTGGCAGGCACCATGCAGAACTGCTCAAACCACGGTGCTCAGCATGTGACGAGATAA  592

Query  593  TTTTTGCTGATGAGTGCACAGAAGCTGAGGGTCGCCATTGGCACATGAAACACTTCTGCTGCCTTGAGTGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTTGCTGATGAGTGCACAGAAGCTGAGGGTCGCCATTGGCACATGAAACACTTCTGCTGCCTTGAGTGTGAA  666

Query  667  ACGGTCCTGGGAGGACAGAGGTATATCATGAAGGACGGCCGCCCCTTCTGCTGTGGCTGTTTTGAGTCTCTCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGGTCCTGGGAGGACAGAGGTATATCATGAAGGACGGCCGCCCCTTCTGCTGTGGCTGTTTTGAGTCTCTCTA  740

Query  741  TGCGGAGTACTGTGAAACCTGTGGGGAACATATTGGTGTGGACCATGCACAGATGACCTATGACGGGCAGCACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCGGAGTACTGTGAAACCTGTGGGGAACATATTGGTGTGGACCATGCACAGATGACCTATGACGGGCAGCACT  814

Query  815  GGCACGCCACGGAAGCCTGCTTTTCTTGTGCCCAGTGTAAAGCCTCTTTGTTGGGATGTCCCTTCCTTCCCAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCACGCCACGGAAGCCTGCTTTTCTTGTGCCCAGTGTAAAGCCTCTTTGTTGGGATGTCCCTTCCTTCCCAAA  888

Query  889  CAGGGTCAGATTTACTGCTCAAAAACGTGCAGTCTTGGTGAAGACGTCCATGCCTCTGATTCTTCCGACTCTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGGGTCAGATTTACTGCTCAAAAACGTGCAGTCTTGGTGAAGACGTCCATGCCTCTGATTCTTCCGACTCTGC  962

Query  963  ATTTCAGTCAGCTCGATCAAGAGACTCCCGAAGAAGTGTCCGAATGGGCAAGAGCAGCCGGTCAGCAGATCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTTCAGTCAGCTCGATCAAGAGACTCCCGAAGAAGTGTCCGAATGGGCAAGAGCAGCCGGTCAGCAGATCAGT  1036

Query 1037  GTAGACAGTCTCTCCTCTTATCGCCTGCTCTGAACTACAAGTTTCCTGGCCTCTCAGGCAATGCTGATGACACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTAGACAGTCTCTCCTCTTATCGCCTGCTCTGAACTACAAGTTTCCTGGCCTCTCAGGCAATGCTGATGACACC  1110

Query 1111  CTTTCTCGAAAATTGGATGATCTGAGTCTCTCCAGACAAGGAACAAGTTTTGCCAGTGAAGAATTTTGGAAAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTTCTCGAAAATTGGATGATCTGAGTCTCTCCAGACAAGGAACAAGTTTTGCCAGTGAAGAATTTTGGAAAGG  1184

Query 1185  CAGAGTAGAGCAGGAAACTCCAGAAGACCCTGAAGAATGGGCTGATCATGAAGATTATATGACGCAGCTCCTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGAGTAGAGCAGGAAACTCCAGAAGACCCTGAAGAATGGGCTGATCATGAAGATTATATGACGCAGCTCCTCC  1258

Query 1259  TCAAGTTTGGTGATAAAAGCCTCTTTCAGCCACAGCCCAATGAGATGGATATTCGAGCCAGTGAGCACTGGATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAAGTTTGGTGATAAAAGCCTCTTTCAGCCACAGCCCAATGAGATGGATATTCGAGCCAGTGAGCACTGGATA  1332

Query 1333  TCTGATAACATGGTTAAAAGTAAGACCGAGTTAAAGCAAAATAACCAGAGCCTTGCAAGTAAAAAATACCAGTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCTGATAACATGGTTAAAAGTAAGACCGAGTTAAAGCAAAATAACCAGAGCCTTGCAAGTAAAAAATACCAGTC  1406

Query 1407  TGATATGTACTGGGCACAGTCACAAGATGGACTGGGCGATTCTGCTTATGGCAGCCACCCAGGCCCTGCAAGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGATATGTACTGGGCACAGTCACAAGATGGACTGGGCGATTCTGCTTATGGCAGCCACCCAGGCCCTGCAAGCA  1480

Query 1481  GTAGAAGGCTTCAGGAATTGGAACTGGACCATGGGGCTTCAGGGTATAATCATGATGAAACACAGTGGTATGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTAGAAGGCTTCAGGAATTGGAACTGGACCATGGGGCTTCAGGGTATAATCATGATGAAACACAGTGGTATGAA  1554

Query 1555  GATTCCCTGGAGTGTCTGTCAGACCTGAAACCAGAGCAAAGTGTTCGGGATTCGATGGATTCTTTGGCATTGTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATTCCCTGGAGTGTCTGTCAGACCTGAAACCAGAGCAAAGTGTTCGGGATTCGATGGATTCTTTGGCATTGTC  1628

Query 1629  CAATATCACAGGGGCTTCGGTGGATGGAGAAAACAAGCCAAGGCCATCATTGTATTCTCTGCAAAATTTTGAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAATATCACAGGGGCTTCGGTGGATGGAGAAAACAAGCCAAGGCCATCATTGTATTCTCTGCAAAATTTTGAGG  1702

Query 1703  AGATGGAAACAGAAGATTGTGAGAAGATGAGCAATATGGGAACTTTGAACTCTTCCATGCTGCACAGGAGTGCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGATGGAAACAGAAGATTGTGAGAAGATGAGCAATATGGGAACTTTGAACTCTTCCATGCTGCACAGGAGTGCA  1776

Query 1777  GAGTCCTTAAAGAGTCTAAGTTCAGAGTTGTGTCCAGAGAAAATCCTGCCTGAAGAGAAGCCAGTACATCTGCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGTCCTTAAAGAGTCTAAGTTCAGAGTTGTGTCCAGAGAAAATCCTGCCTGAAGAGAAGCCAGTACATCTGCC  1850

Query 1851  AGTGCTCAGAAGGTCCAAGTCTCAATCCAGACCCCAGCAGGTCAAGTTTTCTGATGATGTCATTGACAATGGGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGTGCTCAGAAGGTCCAAGTCTCAATCCAGACCCCAGCAGGTCAAGTTTTCTGATGATGTCATTGACAATGGGA  1924

Query 1925  ACTATGACATTGAAATCCGGCAGCCTCCGATGAGTGAAAGGACTCGGAGACGCGTCTACAATTTTGAAGAGAGG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACTATGACATTGAAATCCGGCAGCCTCCGATGAGTGAAAGGACTCGGAGACGCGTCTACAATTTTGAAGAGAGG  1998

Query 1999  GGATCCAGGTCTCATCACCACCGCCGCCGGAGAAGTAGAAAGTCCCGCTCCGACAATGCCCTGAATCTTGTTAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGATCCAGGTCTCATCACCACCGCCGCCGGAGAAGTAGAAAGTCCCGCTCCGACAATGCCCTGAATCTTGTTAC  2072

Query 2073  AGAAAGAAAATACTCTCCCAAGGACAGACTGCGGCTGTACACCCCCGATAACTATGAGAAATTTATACAGAATA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGAAAGAAAATACTCTCCCAAGGACAGACTGCGGCTGTACACCCCCGATAACTATGAGAAATTTATACAGAATA  2146

Query 2147  AAAGTGCCCGGGAGATCCAAGCATACATCCAGAATGCTGATCTCTACGGACAGTACGCCCATGCCACTTCCGAT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AAAGTGCCCGGGAGATCCAAGCATACATCCAGAATGCTGATCTCTACGGACAGTACGCCCATGCCACTTCCGAT  2220

Query 2221  TATGGCCTGCAGAACCCAGGAATGAATCGGTTTCTGGGACTCTACGGCGAGGATGATGATTCCTGGTGTTCTTC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TATGGCCTGCAGAACCCAGGAATGAATCGGTTTCTGGGACTCTACGGCGAGGATGATGATTCCTGGTGTTCTTC  2294

Query 2295  CTCCTCCTCCTCTTCCGACTCGGAAGAAGAAGGATATTTTCTTGGACAACCAATCCCTCAACCCCGGCCACAGA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTCCTCCTCCTCTTCCGACTCGGAAGAAGAAGGATATTTTCTTGGACAACCAATCCCTCAACCCCGGCCACAGA  2368

Query 2369  GATTTGCCTACTATACAGATGACCTTTCTAGTCCACCATCTGCACTTCCCACCCCTCAGTTTGGTCAGAGGACA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GATTTGCCTACTATACAGATGACCTTTCTAGTCCACCATCTGCACTTCCCACCCCTCAGTTTGGTCAGAGGACA  2442

Query 2443  ACAAAATCCAAGAAGAAAAAGGGACACAAGGGCAAAAATTGTATTATTTCT  2493
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACAAAATCCAAGAAGAAAAAGGGACACAAGGGCAAAAATTGTATTATTTCT  2493