Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05019
• Subject: XM_006711749.3
• Aligned Length: 1769
• Identities: 1487
• Gaps: 280

Alignment

Query    1  ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCTGCGGCTGCGCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCTGCGGCTGCGCTC  74

Query   75  CCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTGCAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTACTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTGCAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTACTC  148

Query  149  ACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTTGTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTTGTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACCTGG  222

Query  223  ATGAGACATTTGCTACAGCATCCCACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATGGCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGAGACATTTGCTACAGCATCCCACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATGGCTG  296

Query  297  TGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAAGATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTGAATC  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAGGATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTGAATC  370

Query  371  AGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTCCGAAGACACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCAGCGTGAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTCCGAAGACACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCAGCGTGAGT  444

Query  445  TTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGTTTCCAGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGTTTCCAGAG  518

Query  519  GAACATCACTGTCAAACTTTATCAGGCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCCTCCAAGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAACATCACTGTCAAACTTTATCAGGCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCCTCCAAGCT  592

Query  593  GTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTGGTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTGAAGGTACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTGGTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTGAAGGTACA  666

Query  667  ATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCCACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAATGATGGAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCCACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAATGATGGAGG  740

Query  741  GGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCTGGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGAGGGAGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCTGGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGAGGGAGTTG  814

Query  815  CAGGTGGTTTTATATATACTATTCAGGAAGGTGATGCTCTCTTACACAACCTTCATTCTCGCCCTCAAAGACTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGGTGGTTTTATATATACTATTCAGGAAGGTGATGCTCTCTTACACAACCTTCATTCTCGCCCTCAAAGACTT  888

Query  889  ATTGATCATATAAGGAATCTCCATGAGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATGATGATATTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGATCATATAAGGAATCTCCATGAGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATGATGATATTGT  962

Query  963  TTTTGTGGATGTTGTCGACACTTATCGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGGACTGTGGAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTTGTGGATGTTGTCGACACTTATCGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGGACTGTGGAAA  1036

Query 1037  CAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAAGACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATTTAATAGGATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAAGACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATTTAATAGGATT  1110

Query 1111  GTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTGACCGAACCGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTGACCGAACCGG  1184

Query 1185  AAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCGAGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATATGTGATCTCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCGAGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATATGTGATCTCCA  1258

Query 1259  AGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAGCAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGTAAGCATGGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAGCAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGTAAGCATGGGC  1332

Query 1333  ATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTAAAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCTGTGAGACAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTAAAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCTGTGAGACAGG  1406

Query 1407  AATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCTCCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGGTGCGGTGATC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||
Sbjct 1407  AATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCTCCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGGTG------TC  1474

Query 1481  CTTGTCGATGTCA-----AGCAAGA-------------------------------------------------  1500
            ||    || .|||     |||||||                                                 
Sbjct 1475  CT----GA-CTCAAAACTAGCAAGAGAAGACTGCCTTCAAATACTTCAAATGTTTTCCCCGAGTGTCACCTTTG  1543

Query 1501  --------------------------------------------------------------------------  1500
                                                                                      
Sbjct 1544  GTAACAGTTCTCTTTCTGCGCTGACAGAAACCTGGTGCCACCTGAGACACGATCCACAGGACACTTCTCACGTT  1617

Query 1501  --------------------------------------------------------------------------  1500
                                                                                      
Sbjct 1618  TCCACCAGACCGTGCAGTGCCAGGCTGGGTGCTCAGTACCATACTGCAAACCAGTTCCTAGGCCTGGACCACAG  1691

Query 1501  -------------------------------------------------------------------  1500
                                                                               
Sbjct 1692  CCTCCACAGGAGAGGAGGAAAGCAGTACTTTTTTCCTGCTCTAGGCCAAACAGTGACAACATTTCTC  1758