Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05019
• Subject: XM_017000394.1
• Aligned Length: 1623
• Identities: 1499
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCTGCGGCTGCGCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCTGCGGCTGCGCTC  74

Query   75  CCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTG---------------------------------------  109
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct   75  CCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTGCAGGTGGAGTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCA  148

Query  110  --------------------------------------------------------------------------  109
                                                                                      
Sbjct  149  ATGGCGCGGTCTCGGCTCACCCCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTA  222

Query  110  ----------CAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTACTCACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTT  173
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGGGATAACAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTACTCACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTT  296

Query  174  GTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACCTGGATGAGACATTTGCTACAGCATCCCA  247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACCTGGATGAGACATTTGCTACAGCATCCCA  370

Query  248  CATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATGGCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAA  321
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATGGCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAG  444

Query  322  GATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTGAATCAGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTC  395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTGAATCAGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTC  518

Query  396  CGAAGACACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCAGCGTGAGTTTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTA  469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAAGACACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCAGCGTGAGTTTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTA  592

Query  470  TTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGTTTCCAGAGGAACATCACTGTCAAACTTTATCAG  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGTTTCCAGAGGAACATCACTGTCAAACTTTATCAG  666

Query  544  GCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCCTCCAAGCTGTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTG  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCCTCCAAGCTGTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTG  740

Query  618  GTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTGAAGGTACAATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCC  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTGAAGGTACAATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCC  814

Query  692  ACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAATGATGGAGGGGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCT  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAATGATGGAGGGGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCT  888

Query  766  GGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGAGGGAGTTGCAGGTGGTTTTATATATACTATTCA  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGAGGGAGTTGCAGGTGGTTTTATATATACTATTCA  962

Query  840  GGAAGGTGATGCTCTCTTACACAACCTTCATTCTCGCCCTCAAAGACTTATTGATCATATAAGGAATCTCCATG  913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAGGTGATGCTCTCTTACACAACCTTCATTCTCGCCCTCAAAGACTTATTGATCATATAAGGAATCTCCATG  1036

Query  914  AGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATGATGATATTGTTTTTGTGGATGTTGTCGACACTTAT  987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATGATGATATTGTTTTTGTGGATGTTGTCGACACTTAT  1110

Query  988  CGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGGACTGTGGAAACAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAA  1061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGGACTGTGGAAACAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAA  1184

Query 1062  GACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATTTAATAGGATTGTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTA  1135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATTTAATAGGATTGTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTA  1258

Query 1136  ATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTGACCGAACCGGAAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCG  1209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTGACCGAACCGGAAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCG  1332

Query 1210  AGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATATGTGATCTCCAAGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAG  1283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATATGTGATCTCCAAGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAG  1406

Query 1284  CAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGTAAGCATGGGCATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTA  1357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGTAAGCATGGGCATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTA  1480

Query 1358  AAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCTGTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCT  1431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCTGTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCT  1554

Query 1432  CCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGGTGCGGTGATCCTTGTCGATGTCAAGCAAGA  1500
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGGTGCGGTGATCCTTGTCGATGTCAAGCAAGA  1623