Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05129
- Subject:
- NM_173064.3
- Aligned Length:
- 1560
- Identities:
- 1473
- Gaps:
- 87
Alignment
Query 1 ATGGCGGGGCCCGAGCGCTGGGGCCCCCTGCTCCTGTGCCTGCTGCAGGCCGCTCCAGGGAGGCCCCGTCTGGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGGGCCCGAGCGCTGGGGCCCCCTGCTCCTGTGCCTGCTGCAGGCCGCTCCAGGGAGGCCCCGTCTGGC 74
Query 75 CCCTCCCCAGAATGTGACGCTGCTCTCCCAGAACTTCAGCGTGTACCTGACATGGCTCCCAGGGCTTGGCAACC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCTCCCCAGAATGTGACGCTGCTCTCCCAGAACTTCAGCGTGTACCTGACATGGCTCCCAGGGCTTGGCAACC 148
Query 149 CCCAGGATGTGACCTATTTTGTGGCCTATCAGAGCTCTCCCACCCGTAGACGGTGGCGCGAAGTGGAAGAGTGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCAGGATGTGACCTATTTTGTGGCCTATCAGAGCTCTCCCACCCGTAGACGGTGGCGCGAAGTGGAAGAGTGT 222
Query 223 GCGGGAACCAAGGAGCTGCTATGTTCTATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAACAAGTTCAAGGGACG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCGGGAACCAAGGAGCTGCTATGTTCTATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAACAAGTTCAAGGGACG 296
Query 297 CGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTGGGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCTTTTTGAAGTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTGGGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCTTTTTGAAGTGG 370
Query 371 AGCCGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCCAATGCCACGTACCAGCTGCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCCGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCCAATGCCACGTACCAGCTGCCC 444
Query 445 CCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTATGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAACAAGACCCTATT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTATGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAACAAGACCCTATT 518
Query 519 TCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCAGCTGCCAGCGAACACCACTGCCTCAGTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCAGCTGCCAGCGAACACCACTGCCTCAGTG 592
Query 593 CCAGAACCATCTACACGTTCAGTGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCTTGCTGGAGGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAGAACCATCTACACGTTCAGTGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCTTGCTGGAGGTC 666
Query 667 CCAGAAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTTCTGATACTGCTGTTAGTAATTGCCGCAGGGGGTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCAGAAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTTCTGATACTGCTGTTAGTAATTGCCGCAGGGGGTGT 740
Query 741 GATCTGGAAGACCCTCATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCTGGACTTTTCTGGAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GATCTGGAAGACCCTCATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCT-------------- 800
Query 815 ACACACACCCTGTGGCAACCTTTCAGCCCAGCAGACCAGAGTCCGTGAATGACTTGTTCCTCTGTCCCCAAAAG 888
|
Sbjct 801 -------------------------------------------------------------------------G 801
Query 889 GAACTGACCAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGACAAGATGGAAGAAGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 GAACTGACCAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGACAAGATGGAAGAAGGA 875
Query 963 CCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGGACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCCCTACATTGAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 CCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGGACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCCCTACATTGAAC 949
Query 1037 CACCTTCTTTCCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGGACTCAGGGAGGCCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 CACCTTCTTTCCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGGACTCAGGGAGGCCC 1023
Query 1111 AGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCTTGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCCAGCACTGTGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024 AGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCTTGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCCAGCACTGTGGA 1097
Query 1185 CTCCTCCTGGGACAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGCCGGGTGGGGATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098 CTCCTCCTGGGACAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGCCGGGTGGGGATG 1171
Query 1259 GGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAGGACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCCCAGAAGATAAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 GGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAGGACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCCCAGAAGATAAC 1245
Query 1333 CTCTCCTCCTGGGCCACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCCCCAGTTTCTCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246 CTCTCCTCCTGGGCCACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCCCCAGTTTCTCT 1319
Query 1407 TCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAGGAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGAAATTGAGGACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 TCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAGGAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGAAATTGAGGACA 1393
Query 1481 GCGATGCGGGCAGCTGGGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGGGGCATTACATG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 GCGATGCGGGCAGCTGGGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGGGGCATTACATG 1467
Query 1555 GCCAGG 1560
||||||
Sbjct 1468 GCCAGG 1473