Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05129
- Subject:
- XM_017000479.1
- Aligned Length:
- 1560
- Identities:
- 1311
- Gaps:
- 249
Alignment
Query 1 ATGGCGGGGCCCGAGCGCTGGGGCCCCCTGCTCCTGTGCCTGCTGCAGGCCGCTCCAGGGAGGCCCCGTCTGGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCTCCCCAGAATGTGACGCTGCTCTCCCAGAACTTCAGCGTGTACCTGACATGGCTCCCAGGGCTTGGCAACC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCCAGGATGTGACCTATTTTGTGGCCTATCAGAGCTCTCCCACCCGTAGACGGTGGCGCGAAGTGGAAGAGTGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCGGGAACCAAGGAGCTGCTATGTTCTATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAACAAGTTCAAGGGACG 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------ATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAACAAGTTCAAGGGACG 47
Query 297 CGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTGGGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCTTTTTGAAGTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 CGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTGGGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCTTTTTGAAGTGG 121
Query 371 AGCCGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCCAATGCCACGTACCAGCTGCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 AGCCGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCCAATGCCACGTACCAGCTGCCC 195
Query 445 CCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTATGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAACAAGACCCTATT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 CCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTATGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAACAAGACCCTATT 269
Query 519 TCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCAGCTGCCAGCGAACACCACTGCCTCAGTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 TCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCAGCTGCCAGCGAACACCACTGCCTCAGTG 343
Query 593 CCAGAACCATCTACACGTTCAGTGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCTTGCTGGAGGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 CCAGAACCATCTACACGTTCAGTGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCTTGCTGGAGGTC 417
Query 667 CCAGAAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTTCTGATACTGCTGTTAGTAATTGCCGCAGGGGGTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 CCAGAAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTTCTGATACTGCTGTTAGTAATTGCCGCAGGGGGTGT 491
Query 741 GATCTGGAAGACCCTCATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCTGGACTTTTCTGGAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 GATCTGGAAGACCCTCATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCTGGACTTTTCTGGAC 565
Query 815 ACACACACCCTGTGGCAACCTTTCAGCCCAGCAGACCAGAGTCCGTGAATGACTTGTTCCTCTGTCCCCAAAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 566 ACACACACCCTGTGGCAACCTTTCAGCCCAGCAGACCAGAGTCCGTGAATGACTTGTTCCTCTGTCCCCAAAAG 639
Query 889 GAACTGACCAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGACAAGATGGAAGAAGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 GAACTGACCAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGACAAGATGGAAGAAGGA 713
Query 963 CCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGGACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCCCTACATTGAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 CCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGGACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCCCTACATTGAAC 787
Query 1037 CACCTTCTTTCCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGGACTCAGGGAGGCCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 CACCTTCTTTCCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGGACTCAGGGAGGCCC 861
Query 1111 AGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCTTGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCCAGCACTGTGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 862 AGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCTTGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCCAGCACTGTGGA 935
Query 1185 CTCCTCCTGGGACAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGCCGGGTGGGGATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 CTCCTCCTGGGACAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGCCGGGTGGGGATG 1009
Query 1259 GGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAGGACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCCCAGAAGATAAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 GGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAGGACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCCCAGAAGATAAC 1083
Query 1333 CTCTCCTCCTGGGCCACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCCCCAGTTTCTCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084 CTCTCCTCCTGGGCCACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCCCCAGTTTCTCT 1157
Query 1407 TCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAGGAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGAAATTGAGGACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 TCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAGGAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGAAATTGAGGACA 1231
Query 1481 GCGATGCGGGCAGCTGGGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGGGGCATTACATG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 GCGATGCGGGCAGCTGGGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGGGGCATTACATG 1305
Query 1555 GCCAGG 1560
||||||
Sbjct 1306 GCCAGG 1311