Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05195
• Subject: NM_001174151.1
• Aligned Length: 1284
• Identities: 975
• Gaps: 309

Alignment

Query    1  ATGTTCAGTCTGATGGCCAGTTGCTGCGGCTGGTTCAAGCGGTGGCGGGAGCCTGTCAGAAAGGTGACTCTTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GATGGTGGGACTTGATAATGCTGGTAAAACCGCAACAGCAAAGGGAATCCAAGGAGAATACCCTGAAGATGTAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTCCTACTGTTGGATTTTCAAAAATTAACCTTAGACAAGGAAAGTTTGAAGTCACCATCTTTGACTTGGGAGGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGAATAAGAATTCGGGGAATCTGGAAGAATTACTATGCTGAATCCTATGGGGTAATATTTGTTGTGGATTCCAG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGATGAAGAGAGAATGGAAGAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACATCCTAGGATATCGGGAAAGC  370
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------ATGGAAGAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACATCCTAGGATATCGGGAAAGC  61

Query  371  CTATATTGGTGTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   62  CTATATTGGTGTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCT  135

Query  445  CTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  CTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAA  209

Query  519  GAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  GAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAA  283

Query  593  ATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  ATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGA  357

Query  667  GTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  GTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGC  431

Query  741  TGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  TGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTG  505

Query  815  AAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  AAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAG  579

Query  889  CAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  CAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAA  653

Query  963  GGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  GGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAA  727

Query 1037  AGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  AGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAG  801

Query 1111  AGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  AGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGA  875

Query 1185  GCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  GCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTA  949

Query 1259  ACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA  1284
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  ACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA  975