Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05195
• Subject: NM_144996.4
• Aligned Length: 1284
• Identities: 963
• Gaps: 321

Alignment

Query    1  ATGTTCAGTCTGATGGCCAGTTGCTGCGGCTGGTTCAAGCGGTGGCGGGAGCCTGTCAGAAAGGTGACTCTTTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct    1  ATGTTCAGTCTGATGGCCAGTTGCTGCGGCTGGTTCAAGCGGTGGCGGGAGCCTGTCAG---------------  59

Query   75  GATGGTGGGACTTGATAATGCTGGTAAAACCGCAACAGCAAAGGGAATCCAAGGAGAATACCCTGAAGATGTAG  148
                                                                                      
Sbjct   60  --------------------------------------------------------------------------  59

Query  149  CTCCTACTGTTGGATTTTCAAAAATTAACCTTAGACAAGGAAAGTTTGAAGTCACCATCTTTGACTTGGGAGGT  222
                                                                                      
Sbjct   60  --------------------------------------------------------------------------  59

Query  223  GGAATAAGAATTCGGGGAATCTGGAAGAATTACTATGCTGAATCCTATGGGGTAATATTTGTTGTGGATTCCAG  296
                                                                                      
Sbjct   60  --------------------------------------------------------------------------  59

Query  297  TGATGAAGAGAGAATGGAAGAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACATCCTAGGATATCGGGAAAGC  370
                                                                                      
Sbjct   60  --------------------------------------------------------------------------  59

Query  371  CTATATTGGTGTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCT  444
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   60  ----------GTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCT  123

Query  445  CTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  124  CTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAA  197

Query  519  GAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  198  GAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAA  271

Query  593  ATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  272  ATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGA  345

Query  667  GTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  346  GTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGC  419

Query  741  TGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  TGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTG  493

Query  815  AAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  494  AAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAG  567

Query  889  CAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  568  CAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAA  641

Query  963  GGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  642  GGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAA  715

Query 1037  AGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  716  AGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAG  789

Query 1111  AGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  790  AGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGA  863

Query 1185  GCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  864  GCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTA  937

Query 1259  ACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA  1284
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  938  ACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA  963