Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05205
- Subject:
- NM_001366901.1
- Aligned Length:
- 1539
- Identities:
- 1536
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG 74
Query 75 CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA 148
Query 149 GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA 222
Query 223 AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT 296
Query 297 TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA 370
Query 371 GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT 444
Query 445 GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC 518
Query 519 GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA 592
Query 593 AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG 666
Query 667 CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC 740
Query 741 CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA 814
Query 815 ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC 888
Query 889 AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA 962
Query 963 GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCCGCAGGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC 1036
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCC---GGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC 1033
Query 1037 TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG 1107
Query 1111 GCGCAGAGGGGCAGTAAACAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAACGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GCGCAGAGGGGCAGTAAACAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAACGG 1181
Query 1185 GAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCATCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 GAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCATCC 1255
Query 1259 GGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAGAGCAACTTGCTGGATGTGAATCAGATCATCAAGGACTTGGCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 GGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAGAGCAACTTGCTGGATGTGAATCAGATCATCAAGGACTTGGCC 1329
Query 1333 TCCATGGTGTCAGAGCAAGGAGAAGCTGTTGATAGTATTGAAGCCAGCCTTGAGGCTGCGTCCTCGCATGCGGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 TCCATGGTGTCAGAGCAAGGAGAAGCTGTTGATAGTATTGAAGCCAGCCTTGAGGCTGCGTCCTCGCATGCGGA 1403
Query 1407 GGCAGCCCGCCAGCTCCTGGCTGGAGCCAGCCGGCACCAACTCCAGAGACACAAGATCAAGTGCTGCTTCCTAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 GGCAGCCCGCCAGCTCCTGGCTGGAGCCAGCCGGCACCAACTCCAGAGACACAAGATCAAGTGCTGCTTCCTAT 1477
Query 1481 CAGCTGGAGTCACTGCCCTGCTTGTCATCATCATCATCATCGCCACCTCTGTCCGAAAG 1539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 CAGCTGGAGTCACTGCCCTGCTTGTCATCATCATCATCATCGCCACCTCTGTCCGAAAG 1536