Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05205
• Subject: XM_011516922.1
• Aligned Length: 1547
• Identities: 1407
• Gaps: 124

Alignment

Query    1  ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG  74

Query   75  CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA  148

Query  149  GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA  222

Query  223  AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT  296

Query  297  TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA  370

Query  371  GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT  444

Query  445  GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC  518

Query  519  GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA  592

Query  593  AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG  666

Query  667  CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC  740

Query  741  CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA  814

Query  815  ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC  888

Query  889  AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA  962

Query  963  GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCCGCAGGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCCGCAGGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC  1036

Query 1037  TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG  1110

Query 1111  GCGCAGAGGGGCAGTAAA---CAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAA  1181
            ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCGCAGAGGGGCAGTAAACAGCAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAA  1184

Query 1182  CGGGAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGGGAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCA  1258

Query 1256  TCCGGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAGAGCAACTTGCTGGATGTGAATCAGATCATCAAGGACTTG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCGGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAGAGCAACTTGCTGGATGTGAATCAGATCATCAAGGACTTG  1332

Query 1330  GCCTCCATGGTGTCAGAGCAAGGAGAAGCTGTT-GATAGTATTGAAGCC--AGCCTTGAGGCTGCGTCCTCGCA  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||  |.||||    .|||         
Sbjct 1333  GCCTCCATGGTGTCAGAGCAAGGAGAAGCTGTTGGA-------GAAGCCCTACCCTT----TTGC---------  1386

Query 1401  TGC-GGAGG-CAGCCCGCCAGCTCCTGGCTGGAGCCAGCCGGCACCAACTCCAGAGACACAAGATCAAGTGCTG  1472
            ||| ||||| ||.||..|.||..||||.|.|  ||.||..|.||..|                           
Sbjct 1387  TGCTGGAGGCCACCCATCAAGGACCTGACAG--GCGAGAGGTCAGGA---------------------------  1431

Query 1473  CTTCCTATCAGCTGGAGTCACTGCCCTGCTTGTCATCATCATCATCATCGCCACCTCTGTCCGAAAG  1539
                                                                               
Sbjct 1432  -------------------------------------------------------------------  1431