Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05246
- Subject:
- XM_006717702.3
- Aligned Length:
- 1755
- Identities:
- 1212
- Gaps:
- 543
Alignment
Query 1 ATGTTTTCTTGTTTCTGTTTCAGCCTTCAGGATAATTCCTTCAGCAGCACCACTGTAACAGAGTGTGACGAAGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCCAGTCTCTCTACATGAAGACCAGACTGATTGCTCCAGTCTCAGAGATGAAAACAATAAAGAGAACTACCCCG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACGCAGGGGCTCTGGTAGAAGAGCACGCGCCGCCCTCTTGGGAGCCGCAGCAGCAGAATGTAGAGGCGACCGTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGGTGGACAGCGTATTGCGACCCAGCATGGGCAACTTCAAGTCCAGGAAGCCCAAGTCCATCTTCAAAGCGGA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------ATGGGCAACTTCAAGTCCAGGAAGCCCAAGTCCATCTTCAAAGCGGA 47
Query 297 GAGCGGGAGGAGCCACGGAGAAAGTCAGGAGACAGAGCATGTGGTATCCAGCCAGTCAGAGTGTCAGGTGAGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 GAGCGGGAGGAGCCACGGAGAAAGTCAGGAGACAGAGCATGTGGTATCCAGCCAGTCAGAGTGTCAGGTGAGAG 121
Query 371 CAGGAACACCAGCTCATGAGAGTCCACAAAACAATGCCTTCAAGTGCCAAGAAACAGTGCGACTTCAACCAAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 CAGGAACACCAGCTCATGAGAGTCCACAAAACAATGCCTTCAAGTGCCAAGAAACAGTGCGACTTCAACCAAGA 195
Query 445 ATAGACCAGAGGACTGCCATTTCGCCAAAGGATGCTTTTGAAACTCGGCAGGACTTAAATGAGGAAGAAGCTGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 ATAGACCAGAGGACTGCCATTTCGCCAAAGGATGCTTTTGAAACTCGGCAGGACTTAAATGAGGAAGAAGCTGC 269
Query 519 TCAGGTGCATGGAGTCAAGGACCCGGCGCCAGCATCAACCCAGAGCGTGCTTGCCGATGGGACAGATTCTGCAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 TCAGGTGCATGGAGTCAAGGACCCGGCGCCAGCATCAACCCAGAGCGTGCTTGCCGATGGGACAGATTCTGCAG 343
Query 593 ACCCCTCACCAGTCCACAAAGATGGGCAGAATGAGGCCGACAGTGCACCAGAAGACCTCCACTCTGTGGGGACC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 ACCCCTCACCAGTCCACAAAGATGGGCAGAATGAGGCCGACAGTGCACCAGAAGACCTCCACTCTGTGGGGACC 417
Query 667 AGCAGGCTGCTCTATCACATCACTGATGGTGATAACCCACTGCTGTCGCCACGATGCTCCATCTTCAGCCAAAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 AGCAGGCTGCTCTATCACATCACTGATGGTGATAACCCACTGCTGTCGCCACGATGCTCCATCTTCAGCCAAAG 491
Query 741 CCAGAGATTCAACTTAGACCCCGAGTCAGCCCCATCTCCACCCAGCACTCAGCAGTTTATGATGCCGCGGAGTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 CCAGAGATTCAACTTAGACCCCGAGTCAGCCCCATCTCCACCCAGCACTCAGCAGTTTATGATGCCGCGGAGTT 565
Query 815 CTTCACGCTGCAGCTGTGGAGATGGCAAGGAGCCACAGACCATCACCCAGCTCACCAAGCACATCCAGAGCCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 566 CTTCACGCTGCAGCTGTGGAGATGGCAAGGAGCCACAGACCATCACCCAGCTCACCAAGCACATCCAGAGCCTC 639
Query 889 AAGCGGAAAATTCGGAAATTTGAAGAAAAATTTGAACAAGAAAAGAAATACCG--------------------- 941
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 AAGCGGAAAATTCGGAAATTTGAAGAAAAATTTGAACAAGAAAAGAAATACCGGCCTTCACATGGTGACAAGAC 713
Query 942 -------------------------------------------------------------------------- 941
Sbjct 714 TTCTAATCCTGAAGTCCTGAAATGGATGAATGATTTGGCTAAAGGTCGTAAACAGCTCAAAGAACTAAAGCTAA 787
Query 942 -------------------------------------------------------------------------- 941
Sbjct 788 AGCTGTCAGAAGAACAAGGGAGTGCTCCCAAAGGTCCACCTAGAAACCTGTTGTGTGAGCAACCCACAGTCCCC 861
Query 942 -------------------------------------------------------------------------- 941
Sbjct 862 AGAGAAAATGGGAAACCGGAAGCTGCGGGCCCGGAGCCAAGCTCCTCTGGAGAAGAGACTCCAGATGCTGCCTT 935
Query 942 ---------------------------------------------------GGTAACTAAGCAAGACAAGAACC 964
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 GACATGCCTGAAGGAGAGAAGAGAGCAACTTCCTCCCCAGGAGGATTCTAAGGTAACTAAGCAAGACAAGAACC 1009
Query 965 TCATAAAGCCGCTTTATGACCGATACAGAATTATCAAGCAAATCTTGTCAACACCTTCCCTTATTCCAACAATT 1038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 TCATAAAGCCGCTTTATGACCGATACAGAATTATCAAGCAAATCTTGTCAACACCTTCCCTTATTCCAACAATT 1083
Query 1039 CAGGAGGAAGAGGACTCTGATGAAGACCGTCCACAGGGAAGCCAACAACCTTCTTTGGCAGATCCAGCATCTCA 1112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084 CAGGAGGAAGAGGACTCTGATGAAGACCGTCCACAGGGAAGCCAACAACCTTCTTTGGCAGATCCAGCATCTCA 1157
Query 1113 CCTTCCTGTTGGTGACCACCTCACCTACTCTAATGAGACTGAGCCTGTTAGGGCCCTTTTACCAGATGAAAAGA 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 CCTTCCTGTTGGTGACCACCTCACCTACTCTAATGAGACTGAGCCTGTTAGGGCCCTTTTACCAGATGAAAAGA 1231
Query 1187 AAGAAGTAAAACCACCAGCTCTCTCCATGTCTAATTTACATGAGGCTACCATGCCTGTACTTCTTGACCATCTC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 AAGAAGTAAAACCACCAGCTCTCTCCATGTCTAATTTACATGAGGCTACCATGCCTGTACTTCTTGACCATCTC 1305
Query 1261 CGAGAAACTAGGGCTGACAAGAAGAGACTGCGGAAAGCCTTAAGAGAATTTGAAGAACAGTTTTTTAAACAAAC 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 CGAGAAACTAGGGCTGACAAGAAGAGACTGCGGAAAGCCTTAAGAGAATTTGAAGAACAGTTTTTTAAACAAAC 1379
Query 1335 AGGAAGAAGTCCACAAAAGGAAGATAGGATACCAATGGCAGATGAGTATTATGAATATAAGCACATAAAAGCCA 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 AGGAAGAAGTCCACAAAAGGAAGATAGGATACCAATGGCAGATGAGTATTATGAATATAAGCACATAAAAGCCA 1453
Query 1409 AACTGAGACTATTAGAGGTCCTCATCAGCAAGCAAGATGTGGCCAAAACTATT 1461
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454 AACTGAGACTATTAGAGGTCCTCATCAGCAAGCAAGATGTGGCCAAAACTATT 1506