Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05284
- Subject:
- NM_001323005.2
- Aligned Length:
- 1443
- Identities:
- 1301
- Gaps:
- 142
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCTCCTGGTCGCTCTTGGTTACCCTGCGCCCCTTAGCACAGAGCCCGCTGAGAGGGAGATGTGTTGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCCTCCTGGTCGCTCTTGGTTACCCTGCGCCCCTTAGCACAGAGCCCGCTGAGAGGGAGATGTGTTGG 74
Query 75 GTGCGGGGCCTGGGCCGCCGCTCTCGCTCCTCTGGCCACCGCCCCTGGGAAGCCCTTTTGGAAAGCCTATACGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTGCGGGGCCTGGGCCGCCGCTCTCGCTCCTCTGGCCACCGCCCCTGGGAAGCCCTTTTGGAAAGCCTATACGG 148
Query 149 TTCAGACATCCGAGAGCATGACCCCAACTGCCACTTCAGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCCATGGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTCAGACATCCGAGAGCATGACCCCAACTGCCACTTCAGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCCATGGA 222
Query 223 CCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATGAGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTCATACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATGAGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTCATACA 296
Query 297 GTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATACAATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCTTTTTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATACAATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCTTTTTT 370
Query 371 CAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGGAGATGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGGACATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGGAGATGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGGACATG 444
Query 445 TTTTATGCTTATGTGGAAATGAAGAGGAAAAAACGGGTTCATTTTCATGGTTTCATGCTAGATGTGCACAAAAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTTATGCTTATGTGGAAATGAAGAGGAAAAAACGGGTTCATTTTCATGGTTTCATGCTAGATGTGCACAAAAG 518
Query 519 AATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAACCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAATAGCTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAACCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAATAGCTC 592
Query 593 CCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTGCTGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTGCTGAT 666
Query 667 GCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGGCC 740
Query 741 ACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCTAACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGAATATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCTAACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGAATATT 814
Query 815 GTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCGGAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCTACTAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCGGAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCTACTAC 888
Query 889 CTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGATTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGATTT 962
Query 963 AACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGCCGACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGCCGACT 1036
Query 1037 GCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGCCAGTGACTATTTGGAACTATCAAAGAATTTTGATACA 1110
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGA------------------------------------------------ 1062
Query 1111 ATATTTTTACGAAACATTCCGCAATTTACTCTGGCAAACAGGACTCAAGGTCGAAGATTCATAACTCTCATCGA 1184
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1185 TAACTTTTATGATCTCAAGGTGCGTATAATTTGCTCTGCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCATCAAC 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 -------------------GTGCGTATAATTTGCTCTGCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCATCAAC 1117
Query 1259 ATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAGAAGGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118 ATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAGAAGGA 1191
Query 1333 CTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCATTTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATGCAGAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 CTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCATTTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATGCAGAC 1265
Query 1407 TGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAA- 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1266 TGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAAG 1302