Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05284
• Subject: NM_145743.2
• Aligned Length: 1445
• Identities: 1269
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCTCCTGGTCGCTCTTGGTTACCCTGCGCCCCTTAGCACAGAGCCCGCTGAGAGGGAGATGTGTTGG  74
            |||||||||||||||||||.|||||||||.||||||.||...||.|..||||.|||||..||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCTCCTGGTCGCCCTTGGTTACTCTGCGCTCCGCCGCGCGCAGCCGGCTGACTGGGAGAGGTGTTGG  74

Query   75  GTGCGGGGCCTGGGCCGCCGCTCTCGCTCCTCTGGCCACCGCCCCTGGGAAGCCCTTTTGGAAAGCCTATACGG  148
            |||||||||..|||.||.|||..||.||||||.||||.|.|.|||||||||.|||.|.|||||||||||.||.|
Sbjct   75  GTGCGGGGCGCGGGTCGTCGCAATCCCTCCTCCGGCCCCTGGCCCTGGGAAACCCCTGTGGAAAGCCTACACAG  148

Query  149  TTCAGACATCCGAGAGCATG-AC-CCCAACTGCCACTTCAGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCCATG  220
            |.||||||||||||.|  || || ||||||.|||.||||.|||.|...|||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  149  TCCAGACATCCGAGGG--TGTACGCCCAACAGCCGCTTCTGAGGCCCGTTTGAAAGCCTTGGCTGTTTGCCACG  220

Query  221  GACCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATGAGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTCATA  294
            |.||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||||||.|.
Sbjct  221  GGCCTCTGGACCACTACGACTTTCTGATCAAATCTCAGGAGCTGAGGGAGGATGAACATCAAAGAAGAGTCGTT  294

Query  295  CAGTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATACAATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCTTTT  368
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||..|||||||.||.|||.||.||||||||||||||
Sbjct  295  CAGTGTTTGCAGAAGTTACAGGAGGACCTTAAAGGATACAGCATAGAGGAAGGAGGGCTCTTTTCAAAGCTTTT  368

Query  369  TTCAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGGAGATGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGGACA  442
            ||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TTCAAGGAACAAACCTCCAAAGGGCCTCTATGTTTATGGAGACGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGGACA  442

Query  443  TGTTTTATGCTTATGTGGAAATGAAGAGGAAAAAACGGGTTCATTTTCATGGTTTCATGCTAGATGTGCACAAA  516
            ||||||||||.||||||||||.||||||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||.|
Sbjct  443  TGTTTTATGCATATGTGGAAACGAAGAGAAAGAAGCGGGTCCATTTTCACGGCTTCATGCTGGACGTGCACAGA  516

Query  517  AGAATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAACCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAATAGC  590
            ||.|||||.|.|||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  517  AGGATACACCACCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAGGCGGGATTCATGGCTAAGTCATATGACCCGATAGC  590

Query  591  TCCCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTGCTG  664
            ||||||||||||.||||||||..|||||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  591  TCCCATAGCCGAGGAAATCAGTCAAGAAACTTCTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATCGCCG  664

Query  665  ATGCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGG  738
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  665  ACGCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGA  738

Query  739  CCACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCTAACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGAATA  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||.||||||||||
Sbjct  739  CCACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAGAGGGCTAACTTTGTGCCATTTATAGCTGTCCTGAAGGAATA  812

Query  813  TTGTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCGGAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCTACT  886
            ||||.||||..|||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||..|..||||||||||||||||||
Sbjct  813  TTGTGATACGCTCCAGCTGGATTCTGGGGTAGATTACCGGAAAAGGGAACTCGCCCCTGCAGGAAAACTCTACT  886

Query  887  ACCTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGAT  960
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  ACCTCACAAGTGAGGCTGATGTGGAGGCCGTCGTGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGAT  960

Query  961  TTAACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGCCGA  1034
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  961  TTAACTAGCCCAAGGATTCTGAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGGCTGAATAAAGCCTGTGGAAGCGTTGCCGA  1034

Query 1035  CTGCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGCCAGTGACTATTTGGAACTATCAAAGAATTTTGATA  1108
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1035  CTGCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGCAAGTGACTATTTGGAATTATCAAAGAATTTTGATA  1108

Query 1109  CAATATTTTTACGAAACATTCCGCAATTTACTCTGGCAAACAGGACTCAAGGTCGAAGATTCATAACTCTCATC  1182
            |..||.|..||||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||||...||||||||||.||||||||.
Sbjct 1109  CGGTAATCATACGAAACATTCCGCAGTTTTCACTGGCAAAGAGGACGCAAGCGAGAAGATTCATCACTCTCATT  1182

Query 1183  GATAACTTTTATGATCTCAAGGTGCGTATAATTTGCTCTGCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCATCA  1256
            ||||||||.|||||..||||||||||.||.||.|||||.||.||..||||.||.||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1183  GATAACTTCTATGACTTCAAGGTGCGCATTATCTGCTCCGCTTCAGCTCCGATCTCAAGCTTGTTTCTGCATCA  1256

Query 1257  ACATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAGAAG  1330
            .|||||.||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||   .|
Sbjct 1257  GCATCAGGACAGTGAGTCGGACCAAAGCAGAATCCTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGACTCAGC---CG  1327

Query 1331  GACTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCATTTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATGCAG  1404
            |.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1328  GGCTCTCCATGTTTACGGGGGAGGAGGAAATCTTCGCCTTTCAGCGCACCATTTCCCGGCTCACAGAGATGCAG  1401

Query 1405  ACTGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAA-  1442
            ||.||.||||||||||.||||||.|||||||.||.||| 
Sbjct 1402  ACGGAGCAGTACTGGATTGAAGGGGACAGAAGCAGGAAG  1440