Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05284
• Subject: XM_011535657.2
• Aligned Length: 1443
• Identities: 1340
• Gaps: 103

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCTCCTGGTCGCTCTTGGTTACCCTGCGCCCCTTAGCACAGAGCCCGCTGAGAGGGAGATGTGTTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCTCCTGGTCGCTCTTGGTTACCCTGCGCCCCTTAGCACAGAGCCCGCTGAGAGGGAGATGTGTTGG  74

Query   75  GTGCGGGGCCTGGGCCGCCGCTCTCGCTCCTCTGGCCACCGCCCCTGGGAAGCCCTTTTGGAAAGCCTATACGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGCGGGGCCTGGGCCGCCGCTCTCGCTCCTCTGGCCACCGCCCCTGGGAAGCCCTTTTGGAAAGCCTATACGG  148

Query  149  TTCAGACATCCGAGAGCATGACCCCAACTGCCACTTCAGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCCATGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCAGACATCCGAGAGCATGACCCCAACTGCCACTTCAGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCCATGGA  222

Query  223  CCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATGAGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTCATACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATGAGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTCATACA  296

Query  297  GTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATACAATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCTTTTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATACAATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCTTTTTT  370

Query  371  CAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGGAGATGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGGACATG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct  371  CAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGGAGATGTTG-----------------------------  415

Query  445  TTTTATGCTTATGTGGAAATGAAGAGGAAAAAACGGGTTCATTTTCATGGTTTCATGCTAGATGTGCACAAAAG  518
                                                                                     |
Sbjct  416  -------------------------------------------------------------------------G  416

Query  519  AATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAACCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAATAGCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  AATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAACCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAATAGCTC  490

Query  593  CCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTGCTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  CCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTGCTGAT  564

Query  667  GCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  GCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGGCC  638

Query  741  ACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCTAACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGAATATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  ACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCTAACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGAATATT  712

Query  815  GTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCGGAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCTACTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  GTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCGGAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCTACTAC  786

Query  889  CTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGATTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  CTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGATTT  860

Query  963  AACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGCCGACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  AACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGCCGACT  934

Query 1037  GCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGCCAGTGACTATTTGGAACTATCAAAGAATTTTGATACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  GCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGCCAGTGACTATTTGGAACTATCAAAGAATTTTGATACA  1008

Query 1111  ATATTTTTACGAAACATTCCGCAATTTACTCTGGCAAACAGGACTCAAGGTCGAAGATTCATAACTCTCATCGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  ATATTTTTACGAAACATTCCGCAATTTACTCTGGCAAACAGGACTCAAGGTCGAAGATTCATAACTCTCATCGA  1082

Query 1185  TAACTTTTATGATCTCAAGGTGCGTATAATTTGCTCTGCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCATCAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  TAACTTTTATGATCTCAAGGTGCGTATAATTTGCTCTGCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCATCAAC  1156

Query 1259  ATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAGAAGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  ATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAGAAGGA  1230

Query 1333  CTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCATTTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATGCAGAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  CTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCATTTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATGCAGAC  1304

Query 1407  TGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAA-  1442
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1305  TGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAAG  1341