Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05284
• Subject: XM_017313883.1
• Aligned Length: 1480
• Identities: 1236
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGG------CGGCCTCCTGGTCGCTCTTGGTTACCCTGCG---CCCCTTAGCACAGA-GCCCGCTGAGAGGGA  64
            ||||      |.||  ||.|  |||       .||..||||   ||.|||    |..| |||.||||..|..||
Sbjct    1  ATGGAGAGCACAGC--CCAG--CGC-------CACTGTGCGGCTCCGCTT----CCTATGCCAGCTGCAAATGA  59

Query   65  GATGTGTTGGGTGCGGGGC---CTGGGCCGCCGCTCTCGCTC------CTCTGG--CCA------------CCG  115
            |||             |||   ||.|.||.|..|||| ||.|      ||||||  |||            ||.
Sbjct   60  GAT-------------GGCCCACTTGCCCACATCTCT-GCCCAGCAGGCTCTGGGTCCAGGGACTTCCATTCCT  119

Query  116  CCCCTGGGAAGCCC--TTTTGGAAAGCCTATACGGTTCAGACATCCGAGAGCATG-AC-CCCAACTGCCACTTC  185
            |||||    |.|.|  ||||     |||||.||.||.||||||||||||.|  || || ||||||.|||.||||
Sbjct  120  CCCCT----ACCTCAGTTTT-----GCCTACACAGTCCAGACATCCGAGGG--TGTACGCCCAACAGCCGCTTC  182

Query  186  AGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCCATGGACCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATG  259
            .|||.|...|||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.|
Sbjct  183  TGAGGCCCGTTTGAAAGCCTTGGCTGTTTGCCACGGGCCTCTGGACCACTACGACTTTCTGATCAAATCTCAGG  256

Query  260  AGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTCATACAGTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATAC  333
            ||||.|.|||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  257  AGCTGAGGGAGGATGAACATCAAAGAAGAGTCGTTCAGTGTTTGCAGAAGTTACAGGAGGACCTTAAAGGATAC  330

Query  334  AATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCTTTTTTCAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGG  407
            |..|||||||.||.|||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  331  AGCATAGAGGAAGGAGGGCTCTTTTCAAAGCTTTTTTCAAGGAACAAACCTCCAAAGGGCCTCTATGTTTATGG  404

Query  408  AGATGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGGACATGTTTTATGCTTATGTGGAAATGAAGAGGAAAAAACGGG  481
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||.||.||||
Sbjct  405  AGACGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGGACATGTTTTATGCATATGTGGAAACGAAGAGAAAGAAGCGGG  478

Query  482  TTCATTTTCATGGTTTCATGCTAGATGTGCACAAAAGAATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAA  555
            |.||||||||.||.||||||||.||.|||||||.|||.|||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  479  TCCATTTTCACGGCTTCATGCTGGACGTGCACAGAAGGATACACCACCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAG  552

Query  556  CCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAATAGCTCCCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCT  629
            .|.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||..|||||.|.|.||||||
Sbjct  553  GCGGGATTCATGGCTAAGTCATATGACCCGATAGCTCCCATAGCCGAGGAAATCAGTCAAGAAACTTCTCTCCT  626

Query  630  ATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTGCTGATGCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCA  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  ATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATCGCCGACGCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCA  700

Query  704  AAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGGCCACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCT  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  701  AAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGACCACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAGAGGGCT  774

Query  778  AACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGAATATTGTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCG  851
            ||||||||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.||||..|||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  775  AACTTTGTGCCATTTATAGCTGTCCTGAAGGAATATTGTGATACGCTCCAGCTGGATTCTGGGGTAGATTACCG  848

Query  852  GAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCTACTACCTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATA  925
            ||||||||||||..|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct  849  GAAAAGGGAACTCGCCCCTGCAGGAAAACTCTACTACCTCACAAGTGAGGCTGATGTGGAGGCCGTCGTGGATA  922

Query  926  AGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGATTTAACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAG  999
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  923  AGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGATTTAACTAGCCCAAGGATTCTGAAAGTGCAAGGCAGAGAG  996

Query 1000  CTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGCCGACTGCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGC  1073
            |||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  CTGCGGCTGAATAAAGCCTGTGGAAGCGTTGCCGACTGCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGC  1070

Query 1074  CAGTGACTATTTGGAACTATCAAAGAATTTTGATACAATATTTTTACGAAACATTCCGCAATTTACTCTGGCAA  1147
            .|||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||.|..||||||||||||||||.|||.|.|||||||
Sbjct 1071  AAGTGACTATTTGGAATTATCAAAGAATTTTGATACGGTAATCATACGAAACATTCCGCAGTTTTCACTGGCAA  1144

Query 1148  ACAGGACTCAAGGTCGAAGATTCATAACTCTCATCGATAACTTTTATGATCTCAAGGTGCGTATAATTTGCTCT  1221
            |.|||||.||||...||||||||||.||||||||.||||||||.|||||..||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 1145  AGAGGACGCAAGCGAGAAGATTCATCACTCTCATTGATAACTTCTATGACTTCAAGGTGCGCATTATCTGCTCC  1218

Query 1222  GCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCATCAACATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGAT  1295
            ||.||..||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||||.||||||||||.|||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1219  GCTTCAGCTCCGATCTCAAGCTTGTTTCTGCATCAGCATCAGGACAGTGAGTCGGACCAAAGCAGAATCCTGAT  1292

Query 1296  GGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAGAAGGACTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCAT  1369
            ||||||||||||||||||||||||.|||||   .||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1293  GGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGACTCAGC---CGGGCTCTCCATGTTTACGGGGGAGGAGGAAATCTTCGCCT  1363

Query 1370  TTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATGCAGACTGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAA-  1442
            ||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||.||||||.|||||||.||.||| 
Sbjct 1364  TTCAGCGCACCATTTCCCGGCTCACAGAGATGCAGACGGAGCAGTACTGGATTGAAGGGGACAGAAGCAGGAAG  1437