Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05391
• Subject: XM_017006203.1
• Aligned Length: 1937
• Identities: 1575
• Gaps: 355

Alignment

Query    1  ATGGAGAGACAGTCAAGGGTTATGTCAGAAAAGGATGAGTATCAGTTTCAACATCAGGGAGCGGTGGAGCTGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGTCTTCAATTTTTTGCTCATCCTTACCATTTTGACAATCTGGTTATTTAAAAATCATCGATTCCGCTTCTTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAAACTGGAGGAGCAATGGTGTATGGCCTTATAATGGGACTAATTTTACGATATGCTACAGCACCAACTGAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATTGAAAGTGGAACTGTCTATGACTGTGTAAAACTAACTTTCAGTCCATCAACTCTGCTGGTTAATATCACTGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCAAGTTTATGAATATAAATACAAAAGAGAAATAAGTCAGCACAACATCAATCCTCATCAAGGA--AATGCTAT  368
                                                          ||.||.|    |..||||  ||||.|.|
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGAAAC----TGGAGGAGCAATGGTGT  24

Query  369  ACTTGAAAAGATGACATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTTCATGCAGGAT  442
                   |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   25  -------ATGATGACATTTGATCCAGAAATCTTCTTCAATGTTTTACTGCCACCAATTATATTTCATGCAGGAT  91

Query  443  ATAGTCTAAAGAAGAGACACTTTTTTCAAAACTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTGCCATC  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  ATAGTCTAAAGAAGAGACACTTTTTTCAAAACTTAGGATCTATTTTAACGTATGCCTTCTTGGGAACTGCCATC  165

Query  517  TCCTGCATCGTCATAGGGTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATGATACATGCTGGCCAGCTGAAAAATGG  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  TCCTGCATCGTCATAGGGTTAATTATGTATGGTTTTGTGAAGGCTATGATACATGCTGGCCAGCTGAAAAATGG  239

Query  591  AGACTTTCATTTCACTGACTGTTTATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGTGACAGTGCTGGCCA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  AGACTTTCATTTCACTGACTGTTTATTTTTTGGTTCACTGATGTCTGCTACAGATCCAGTGACAGTGCTGGCCA  313

Query  665  TTTTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTCTTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTG  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314  TTTTCCATGAACTGCACGTCGACCCTGACCTGTACACACTCTTGTTTGGAGAGAGTGTGTTGAATGATGCAGTG  387

Query  739  GCCATAGTCCTTACATATTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCATTTGATGCCGCAGCATT  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  388  GCCATAGTCCTTACATATTCTATATCCATTTACAGTCCCAAGGAGAATCCAAATGCATTTGATGCCGCAGCATT  461

Query  813  CTTCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTCGCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  CTTCCAGTCTGTGGGGAATTTCCTGGGAATCTTCGCTGGCTCATTTGCAATGGGGTCTGCGTATGCCATCATCA  535

Query  887  CAGCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAACCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCT  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  CAGCACTGTTGACCAAATTTACCAAGCTGTGTGAGTTCCCGATGCTGGAAACCGGCCTGTTTTTCCTGCTTTCT  609

Query  961  TGGAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCTGCCGGCCTAACAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTCACACA  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  TGGAGTGCCTTCCTGTCTGCCGAGGCTGCCGGCCTAACAGGGATAGTTGCTGTTCTCTTCTGTGGAGTCACACA  683

Query 1035  AGCACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAAGAACTAAACAGTTGTTTGAATTTATGAACT  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  AGCACATTATACCTACAACAATCTGTCTTCGGATTCCAAAATAAGAACTAAACAGTTGTTTGAATTTATGAACT  757

Query 1109  TTTTGGCGGAGAACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCATATCTTTAATGCT  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  TTTTGGCGGAGAACGTCATCTTCTGTTACATGGGCCTGGCACTGTTCACGTTCCAGAATCATATCTTTAATGCT  831

Query 1183  CTTTTTATACTTGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCT  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  CTTTTTATACTTGGAGCCTTTCTAGCAATTTTTGTTGCCAGAGCCTGCAACATATATCCCCTCTCCTTCCTCCT  905

Query 1257  GAATCTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGGAGCGA  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  906  GAATCTAGGCCGAAAACAGAAGATCCCCTGGAACTTTCAGCACATGATGATGTTTTCAGGTTTGCGAGGAGCGA  979

Query 1331  TCGCATTTGCCTTAGCTATTCGGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTCCTC  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  980  TCGCATTTGCCTTAGCTATTCGGAACACAGAATCTCAGCCCAAACAAATGATGTTTACCACTACGCTGCTCCTC  1053

Query 1405  GTGTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTTGACTTGGCTTCAGATCAGAGTTGGCGT  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054  GTGTTCTTCACTGTCTGGGTATTTGGAGGAGGAACAACCCCCATGTTGACTTGGCTTCAGATCAGAGTTGGCGT  1127

Query 1479  GGACCTGGATGAAAATCTGAAGGAGGACCCCTCCTCACAACACCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGA  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128  GGACCTGGATGAAAATCTGAAGGAGGACCCCTCCTCACAACACCAGGAAGCAAATAACTTGGATAAAAACATGA  1201

Query 1553  CGAAAGCAGAGAGTGCTCGGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTATCTGAAACCAATTTTAACC  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202  CGAAAGCAGAGAGTGCTCGGCTCTTCAGAATGTGGTATAGCTTTGACCACAAGTATCTGAAACCAATTTTAACC  1275

Query 1627  CACTCTGGTCCTCCGCTGACTACAACATTACCTGAATGGTGTGGTCCGATTTCCAGGCTGCTTACCAGTCCTCA  1700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276  CACTCTGGTCCTCCGCTGACTACAACATTACCTGAATGGTGTGGTCCGATTTCCAGGCTGCTTACCAGTCCTCA  1349

Query 1701  AGCCTATGGGGAACAGCTAAAAGAGGATGATGTGGAATGCATTGTAAACCAGGATGAACTAGCCATAAATTACC  1774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350  AGCCTATGGGGAACAGCTAAAAGAGGATGATGTGGAATGCATTGTAAACCAGGATGAACTAGCCATAAATTACC  1423

Query 1775  AGGAGCAAGCCTCCTCACCCTGCAGTCCTCCTGCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCAGACGCCA  1848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424  AGGAGCAAGCCTCCTCACCCTGCAGTCCTCCTGCAAGGCTAGGTCTGGACCAGAAAGCTTCACCCCAGACGCCA  1497

Query 1849  GGCAAGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGGCCTGGGAGGCTATGAACTCAAGCTTGAGCAAACTTTGGGTCA  1922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498  GGCAAGGAAAACATTTATGAGGGAGACCTCGGCCTGGGAGGCTATGAACTCAAGCTTGAGCAAACTTTGGGTCA  1571

Query 1923  ATCCCAGTTGAAT  1935
            |||||||||||||
Sbjct 1572  ATCCCAGTTGAAT  1584