Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05397
• Subject: XM_006522581.2
• Aligned Length: 841
• Identities: 707
• Gaps: 20

Alignment

Query   1  ATGTCAACAATTGGGAGTTTTGAAGGATTCCAGGCTGTGTCTCTGAAGCAAGAGGGAGATGACCAACCCTCTGA  74
           |||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCAACAATTGGGAGCTTTGACGGATTCCAGCCCGTGTCTTTGAAGCAAGAGGAAGAGGACCAACCCTCTGA  74

Query  75  GACTGACCACCTATC-------GATGG------AGGAAGAGGACCC--GATGCCAAGACAGATTTCAAGGCAGT  133
           .|.|||||||.|.||       ||.||      |||.| |||||||  |||  ||||...|||||||||.||| 
Sbjct  75  AAATGACCACTTGTCCACAAAGGAGGGGAATTCAGGCA-AGGACCCAGGAT--CAAGGAGGATTTCAAGACAG-  144

Query 134  CA-AGTGTGACCGAATCAACTCTTTACCCCAATCCTTATCATCAGCCTTATATCTCACGGAAGTACTTTGCTAC  206
           || |||.|.||..||.|.||.||.||||||||||||||||..|||||.|||.|.||||||||||||||||.|||
Sbjct 145  CAGAGTATAACTAAAGCGACACTGTACCCCAATCCTTATCGCCAGCCCTATGTTTCACGGAAGTACTTTGTTAC  218

Query 207  ACGGCCGGGGGCCATTGAGACTGCCATGGAAGACTTGAAAGGTCACGTAGCTGAGACTTCTGGAGAGACCATTC  280
           ||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||.||||..||||||||||.|||||..|||
Sbjct 219  ACGGCCAGGGGCCATTGAGACTGCTGTGGAAGACTTGAAAGGCCACATAGCACAGACTTCTGGGGAGACTGTTC  292

Query 281  AAGGCTTCTGGCTCTTGACAAAGATAGACCACTGGAACAATGAGAAGGAGAGAATTCTACTGGTCACAGACAAG  354
           ||||||||||||||.|||||.||||.||.||||||||||||||||||||||..||.||.||..|||||||||||
Sbjct 293  AAGGCTTCTGGCTCCTGACAGAGATTGATCACTGGAACAATGAGAAGGAGAAGATCCTGCTACTCACAGACAAG  366

Query 355  ACTCTCTTGATCTGCAAATACGACTTCATCATGCTGAGTTGTGTGCAGCTGCAGCGGATTCCTCTGAGCGCTGT  428
           ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||.|.||||.||||..||..|
Sbjct 367  ACCCTCTTGATCTGCAAATACGACTTCATCATGCTCAGCTGTGTGCAGGTGCAGCAGGTTCCCCTGAATGCCAT  440

Query 429  CTATCGCATCTGCCTGGGCAAGTTCACCTTCCCTGGGATGTCCCTGGACAAGAGACAAGGAGAAGGCCTTAGGA  502
           ||...|||||||.|||||||||||....|||||.||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||.||||
Sbjct 441  CTGCTGCATCTGTCTGGGCAAGTTTGTTTTCCCAGGGATGTCTCTGGACAAGAGACCAGGAGATGGCCTAAGGA  514

Query 503  TCTACTGGGGGAGTCCGGAGGAGCAGTCTCTTCTGTCCCGCTGGAACCCATGGTCCACTGAAGTTCCTTATGCT  576
           |.|.|||||||||..|.||||.|..||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 515  TTTTCTGGGGGAGCACCGAGGGGTGGTCTCTACTGTCTCGTTGGAACCCGTGGTCCACTGAAGTTCCCTATGCC  588

Query 577  ACTTTCACTGAGCATCCTATGAAATACACCAGTGAGAAATTCCTTGAAATTTGCAAGTTGTCTGGGTTCATGTC  650
           ||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||.|||||..||
Sbjct 589  ACCTTCACAGAGCATCCTATGAAACAGACCAGTGAGAAGTTCCTTGAGATCTGCAAGTTGTCTGAGTTCACCTC  662

Query 651  TAAGCTTGTTCCAGCTATCCAGAATGCCCACAAGAATTCAACTGGATCTGGAAGAGGAAAGAAACTGATGGTGT  724
           |||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||.|||||.||||||
Sbjct 663  TAAGCTTGTTCCAGCCATCGAGAATGCCCACAAGAATTCTGCTGGATCTGGAAGTGGAAAGGAACTGGTGGTGT  736

Query 725  TAACTGAACCCATTTTGATTGAGACCTACACAGGGCTGATGTCATTCATTGGAAACCGCAACAAACTTGGCTAT  798
           ||||..||||.||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737  TAACCCAACCTATACTGATTGAGACCTACACAGGGCTCATGTCATTCATTGGAAACCGCAACAAACTTGGCTAT  810

Query 799  TCCCTTGCCCGTGGGAGTATTGGTTTT  825
           ||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 811  TCCCTTGCTCGTGGGAGTATTGGCTTT  837