Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05603
• Subject: XM_011243188.1
• Aligned Length: 828
• Identities: 644
• Gaps: 93

Alignment

Query   1  ATGGCCGAAGGCGGGGCTAGCAAAGGTGGTGGAGAAGAGCCCGGGAAGCTGCCGGAGCCGGCAGAGGAGGAATC  74
           |||||||||||||||||.|||||||||      ||||||||.|..||.|||||.|.||.|||||||||.|||.|
Sbjct   1  ATGGCCGAAGGCGGGGCAAGCAAAGGT------GAAGAGCCAGAAAAACTGCCCGGGCTGGCAGAGGACGAACC  68

Query  75  CCAGGTTTTGCGCGGAACTGGCCACTGTAAGTGGTTCAATGTGCGCATGGGATTTGGATTCATCTCCATGATAA  148
           |||||||.|||..||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  69  CCAGGTTCTGCATGGCACTGGCCACTGTAAATGGTTCAACGTGCGCATGGGATTCGGATTCATCTCCATGATAA  142

Query 149  ACCGAGAGGGAAGCCCCTTGGATATTCCAGTCGATGTATTTGTACACCAAAGCAAACTATTCATGGAAGGATTT  222
           ..||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143  GTCGAGAGGGAAATCCCTTGGATATTCCAGTGGATGTATTTGTACACCAAAGCAAACTATTCATGGAAGGATTT  216

Query 223  AGAAGCCTAAAAGAAGGAGAACCAGTGGAATTCACATTTAAAAAATCTTCCAAAGGCCTTGAGTCAATACGGGT  296
           ||||||.|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217  AGAAGCTTGAAAGAAGGAGAGCCAGTGGAATTTACATTTAAAAAATCCCCCAAAGGCCTTGAGTCAATACGGGT  290

Query 297  AACAGGACCTGGTGGGAGCCCCTGTTTAGGAAGTGAAAGAAGACCCAAAGGGAAGACACTACAGAAAAGAAAAC  370
           ||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 291  AACAGGCCCAGGTGGGAGCCCCTGCTTAGGAAGTGAAAGAAGACCTAAAGGGAAGACCCTGCAAAAGAGAAAGC  364

Query 371  CAAAGGGAGAT---------------------------------------------------------------  381
           |||||||||||                                                               
Sbjct 365  CAAAGGGAGATAGGTGGAGACGGCAGGATTTACTGATGGATCAGATGTGGACTGTGCGAGAAGAAGAGTCCAGG  438

Query 382  ---------AGATGCTACAACTGTGGTGGCCTTGATCATCATGCTAAGGAATGTAGTCTACCTCCTCAGCCAAA  446
                    ||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 439  ATGATTCCAAGATGCTACAACTGTGGTGGTCTCGACCATCATGCTAAAGAATGCAGTCTACCTCCTCAGCCAAA  512

Query 447  GAAGTGCCATTACTGTCAGAGCATCATGCACATGGTGGCAAACTGCCCACATAAAAATGTTGCACAGCCACCCG  520
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||...||..||.||||..||||
Sbjct 513  GAAGTGCCATTACTGTCAGAGCATCATGCACATGGTGGCCAACTGCCCACACAAGCTTGCCGCTCAGCTGCCCG  586

Query 521  CGAGTTCTCAGGGAAGACAGGAAGCAGAATCCCAGCCATGCACTTCAACTCT-----CCCTCGAGAAGTGGGAG  589
           |.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||     ||.||||     .||..||||||||||||
Sbjct 587  CCAGTTCTCAGGGAAGACAGGAGGCAGAATCCCAGCCATG-----CAGCTCTGCGGCACCAAGAGAAGTGGGAG  655

Query 590  GCGGGCATGGCTGTACA-TCACCACCGTTTCCTCAGGAGGCTAGGGCAGAGATCTCAGAACGGTCAGGCAGGTC  662
           |.|||||||||||.||| |    ||.||||||||||||||..|.|.||||.||..||||.|..||||.||||||
Sbjct 656  GGGGGCATGGCTGCACAGT----ACTGTTTCCTCAGGAGGTGAAGTCAGAAATGGCAGAGCACTCAGACAGGTC  725

Query 663  ACCTCAAGAAGCTTCCTCCACGAAGTCATCTATAGCACCAGAAGAGCAAAGCAAAAAGGGGCCTTCAGTTCAAA  736
           |||.|||||||.|||.||||||||..|.|.|..||||..||.||||||||.||||||||||||||...||||.|
Sbjct 726  ACCCCAAGAAGTTTCTTCCACGAAAGCGTTTGCAGCAATAGGAGAGCAAAACAAAAAGGGGCCTTTGATTCAGA  799

Query 737  AAAGGAAAAAGACA  750
           ||.||||||||||.
Sbjct 800  AACGGAAAAAGACT  813